Exact and Approximate Stochastic Simulation of Intracellular Calcium Dynamics
المؤلفون المشاركون
Fink, Rainer H. A.
Wieder, Nicolas
von Wegner, Frederic
المصدر
العدد
المجلد 2011، العدد 2011 (31 ديسمبر/كانون الأول 2011)، ص ص. 1-5، 5ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2011-11-09
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
5
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
In simulations of chemical systems, the main task is to find an exact or approximate solution of the chemical master equation (CME) that satisfies certain constraints with respect to computation time and accuracy.
While Brownian motion simulations of single molecules are often too time consuming to represent the mesoscopic level, the classical Gillespie algorithm is a stochastically exact algorithm that provides satisfying results in the representation of calcium microdomains.
Gillespie's algorithm can be approximated via the tau-leap method and the chemical Langevin equation (CLE).
Both methods lead to a substantial acceleration in computation time and a relatively small decrease in accuracy.
Elimination of the noise terms leads to the classical, deterministic reaction rate equations (RRE).
For complex multiscale systems, hybrid simulations are increasingly proposed to combine the advantages of stochastic and deterministic algorithms.
An often used exemplary cell type in this context are striated muscle cells (e.g., cardiac and skeletal muscle cells).
The properties of these cells are well described and they express many common calcium-dependent signaling pathways.
The purpose of the present paper is to provide an overview of the aforementioned simulation approaches and their mutual relationships in the spectrum ranging from stochastic to deterministic algorithms.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wieder, Nicolas& Fink, Rainer H. A.& von Wegner, Frederic. 2011. Exact and Approximate Stochastic Simulation of Intracellular Calcium Dynamics. BioMed Research International،Vol. 2011, no. 2011, pp.1-5.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-990202
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wieder, Nicolas…[et al.]. Exact and Approximate Stochastic Simulation of Intracellular Calcium Dynamics. BioMed Research International No. 2011 (2011), pp.1-5.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-990202
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wieder, Nicolas& Fink, Rainer H. A.& von Wegner, Frederic. Exact and Approximate Stochastic Simulation of Intracellular Calcium Dynamics. BioMed Research International. 2011. Vol. 2011, no. 2011, pp.1-5.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-990202
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-990202
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر