Distribution of Genes and Repetitive Elements in the Diabrotica virgifera virgifera Genome Estimated Using BAC Sequencing
المؤلفون المشاركون
Walden, Kimberly K. O.
Robertson, Hugh M.
Abel, Craig A.
Sappington, Thomas W.
French, B. Wade
Siegfried, Blair D.
Coates, Brad S.
Alves, Analiza P.
Wang, Haichuan
Miller, Nicholas J.
المصدر
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-08-05
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Feeding damage caused by the western corn rootworm, Diabrotica virgifera virgifera, is destructive to corn plants in North America and Europe where control remains challenging due to evolution of resistance to chemical and transgenic toxins.
A BAC library, DvvBAC1, containing 109,486 clones with 104±34.5 kb inserts was created, which has an ~4.56X genome coverage based upon a 2.58 Gb (2.80 pg) flow cytometry-estimated haploid genome size.
Paired end sequencing of 1037 BAC inserts produced 1.17 Mb of data (~0.05% genome coverage) and indicated ~9.4 and 16.0% of reads encode, respectively, endogenous genes and transposable elements (TEs).
Sequencing genes within BAC full inserts demonstrated that TE densities are high within intergenic and intron regions and contribute to the increased gene size.
Comparison of homologous genome regions cloned within different BAC clones indicated that TE movement may cause haplotype variation within the inbred strain.
The data presented here indicate that the D.
virgifera virgifera genome is large in size and contains a high proportion of repetitive sequence.
These BAC sequencing methods that are applicable for characterization of genomes prior to sequencing may likely be valuable resources for genome annotation as well as scaffolding.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Coates, Brad S.& Alves, Analiza P.& Wang, Haichuan& Walden, Kimberly K. O.& French, B. Wade& Miller, Nicholas J.…[et al.]. 2012. Distribution of Genes and Repetitive Elements in the Diabrotica virgifera virgifera Genome Estimated Using BAC Sequencing. BioMed Research International،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-991799
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Coates, Brad S.…[et al.]. Distribution of Genes and Repetitive Elements in the Diabrotica virgifera virgifera Genome Estimated Using BAC Sequencing. BioMed Research International No. 2012 (2012), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-991799
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Coates, Brad S.& Alves, Analiza P.& Wang, Haichuan& Walden, Kimberly K. O.& French, B. Wade& Miller, Nicholas J.…[et al.]. Distribution of Genes and Repetitive Elements in the Diabrotica virgifera virgifera Genome Estimated Using BAC Sequencing. BioMed Research International. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-991799
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-991799
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر