UniPrimer: A Web-Based Primer Design Tool for Comparative Analyses of Primate Genomes
المؤلفون المشاركون
Han, Kyudong
Lee, Jungnam
Oh, Sejong
Hong, Seung Bok
Lee, Jimin
Batnyam, Nomin
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-05-27
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Whole genome sequences of various primates have been released due to advanced DNA-sequencing technology.
A combination of computational data mining and the polymerase chain reaction (PCR) assay to validate the data is an excellent method for conducting comparative genomics.
Thus, designing primers for PCR is an essential procedure for a comparative analysis of primate genomes.
Here, we developed and introduced UniPrimer for use in those studies.
UniPrimer is a web-based tool that designs PCR- and DNA-sequencing primers.
It compares the sequences from six different primates (human, chimpanzee, gorilla, orangutan, gibbon, and rhesus macaque) and designs primers on the conserved region across species.
UniPrimer is linked to RepeatMasker, Primer3Plus, and OligoCalc softwares to produce primers with high accuracy and UCSC In-Silico PCR to confirm whether the designed primers work.
To test the performance of UniPrimer, we designed primers on sample sequences using UniPrimer and manually designed primers for the same sequences.
The comparison of the two processes showed that UniPrimer was more effective than manual work in terms of saving time and reducing errors.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Batnyam, Nomin& Lee, Jimin& Lee, Jungnam& Hong, Seung Bok& Oh, Sejong& Han, Kyudong. 2012. UniPrimer: A Web-Based Primer Design Tool for Comparative Analyses of Primate Genomes. International Journal of Genomics،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-992903
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Batnyam, Nomin…[et al.]. UniPrimer: A Web-Based Primer Design Tool for Comparative Analyses of Primate Genomes. International Journal of Genomics No. 2012 (2012), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-992903
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Batnyam, Nomin& Lee, Jimin& Lee, Jungnam& Hong, Seung Bok& Oh, Sejong& Han, Kyudong. UniPrimer: A Web-Based Primer Design Tool for Comparative Analyses of Primate Genomes. International Journal of Genomics. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-992903
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-992903
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر