Modules Identification in Gene Positive Networks of Hepatocellular Carcinoma Using Pearson Agglomerative Method and Pearson Cohesion Coupling Modularity
المؤلفون المشاركون
المصدر
Journal of Applied Mathematics
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-21، 21ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-09-23
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
21
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
In this study, a gene positive network is proposed based on a weighted undirected graph, where the weight represents the positive correlation of the genes.
A Pearson agglomerative clustering algorithm is employed to build a clustering tree, where dotted lines cut the tree from bottom to top leading to a number of subsets of the modules.
In order to achieve better module partitions, the Pearson correlation coefficient modularity is addressed to seek optimal module decomposition by selecting an optimal threshold value.
For the liver cancer gene network under study, we obtain a strong threshold value at 0.67302, and a very strong correlation threshold at 0.80086.
On the basis of these threshold values, fourteen strong modules and thirteen very strong modules are obtained respectively.
A certain degree of correspondence between the two types of modules is addressed as well.
Finally, the biological significance of the two types of modules is analyzed and explained, which shows that these modules are closely related to the proliferation and metastasis of liver cancer.
This discovery of the new modules may provide new clues and ideas for liver cancer treatment.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hu, Jinyu& Gao, Zhiwei. 2012. Modules Identification in Gene Positive Networks of Hepatocellular Carcinoma Using Pearson Agglomerative Method and Pearson Cohesion Coupling Modularity. Journal of Applied Mathematics،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-21.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-993072
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hu, Jinyu& Gao, Zhiwei. Modules Identification in Gene Positive Networks of Hepatocellular Carcinoma Using Pearson Agglomerative Method and Pearson Cohesion Coupling Modularity. Journal of Applied Mathematics No. 2012 (2012), pp.1-21.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-993072
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hu, Jinyu& Gao, Zhiwei. Modules Identification in Gene Positive Networks of Hepatocellular Carcinoma Using Pearson Agglomerative Method and Pearson Cohesion Coupling Modularity. Journal of Applied Mathematics. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-21.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-993072
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-993072
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر