Bioinformatics analysis of the enzyme (phenol hydroxylase)‎ on different bacterial gens

Other Title(s)

تحليل المعلوماتية الحيوية لجين انزيم (الفينول هيدروكسيليز)‎ لأنواع مختلفة من البكتيريا

Author

al-Dufiri, Muhammad E. Jabbar

Source

مجلة الكلية الإسلامية الجامعة : مجلة علمية فصلية محكمة

Publisher

Islamic University of Najaf

Publication Date

2016-04-30

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

12

Main Subjects

Earth Sciences, Water and Environment
Information Technology and Computer Science

Topics

• Pollution
• Phenols
• Information technology
• Bacteria
• Hydroxylation

Arabic Abstract

من المعروف أن معظم مركبات الفينول التي تطرح من الصناعات تتسبب في تلوث البيئة، مما أدى الى مشاكل صحية للإنسان أجريت هذه الدراسة باستخدام أدوات البرمجيات التطبيقية مع التقنيات الحاسوبية من خلال شبكة الأنترنت لغرض حل المشاكل البيولوجية.

هناك معلومات ليس واسعة عن الفينول هيدروكسيليز في الأنواع المختلفة من البكتيريا، لذلك تحاول هذه الدراسة الكشف عن الخصائص المختلفة لجين المسؤول عن انزيم فينول هيدروكسيليز باستخدام تحليل المعلوماتية الحيوية لبكتيريا المختلفة و التي هي : Pseudomonas putida, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Geobacillus thermoleovorans, Stenotrophomonas acidaminiphila, Comamonas testosterone, Azotobacter vinelandii DJ, Alcaligenes faecalis, Burkholderia cepacia, Rhodococcus erythropolis PR4, Rhodococcus jostii RHA1 and Acinetobacter radioresistens SK82.

الأيض الميكروبي في الظروف الهوائي للفينول تتضمن في البداية عملية الهيدروكسيل لإنتاج الكاتيكول، تليها تفكيك الحلقة البنزولية.

و قد اتضح من خلال هذه الدراسة بان فينول هيدروكسيليز للبكتريا المختلفة من انه ذات تسلسل أحماض أمينية يختلف في الطول و التركيب، و كذلك كان هناك اختلاف جيني في وحدات الوظيفية لها.

هذا الدراسة تتجه لبرهنة متوالية الجين وتركيبه والتحليل التطوري لانزيم الفينول هيدروكسيليز في الأنواع المختلفة للبكتريا

English Abstract

Most of the Phenol compounds discharged from industries are known to be potential environmental pollutants, resulting in human health problems.

This study is designed to apply software tools with computational techniques supplied on the internet for researching and solving biological problems.

As slightly known about phenol hydroxylase from other species of bacteria, this study attempts to reveal different characteristics of phenol hydroxylases gens using bioinformatics analysis of different bacteria : Pseudomonas putida, Pseudomonas fluorescens, Ralstonia pickettii, Geobacillus thermoleovorans, Stenotrophomonas acidaminiphila, Comamonas testosterone, Azotobacter vinelandii DJ, Alcaligenes faecalis, Burkholderia cepacia, Rhodococcus erythropolis PR4, Rhodococcus jostii RHA1 and Acinetobacter radioresistens SK82.

Microbial aerobic metabolism of phenol initially involves hydroxylation to yield catechol, followed by ring cleavage.

Their phenol hydroxlase amino acid sequences vary in length, structure as well as genetic variations in their functional units.

The present paper deals with the sequence, structure and evolutionary analysis to establish an understanding of phenol hydroxylase in different bacterial species.

Data Type

Conference Papers

Record ID

BIM-1316834

• APA
• MLA
• AMA