Genotyping of salmonella enterica strains from animal and human origin using three molecular techniques
Other Title(s)
التوصيف الجزيئي لأنواع السالمونيلا المعوية في الحيوانات والإنسان باستخدام ثلاثة تقنيات جزيئية
Joint Authors
Cruz-Méndez, Juan S.
Ortiz-Muñoz, Julián D.
Rondon-Barragan, Iang S.
Source
Iraqi Journal of Veterinary Sciences
Issue
Vol. 36, Issue 2 (30 Apr. 2022), pp.531-538, 8 p.
Publisher
University of Mosul College of Veterinary Medicine
Publication Date
2022-04-30
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
8
Main Subjects
Topics
Abstract AR
تهدف هذه الدراسة إلى توصيف جزيئي لمختلف أنواع السالمونيلا المعوية باستخدام مؤشر تباين أطوال قطع التقييد ومؤشر التنميط الرايبي ومؤشر تباين أطوال الشريط المفرد للدنا لتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل.
عزلت السلالات المعوية (عددها = 49) من حالات التهاب الجهاز الهضمي البشري في منطقة توليما وكذلك من الحالات المرضية للدواجن في منطقة سانتاندير وتوليما في كولومبيا.
تم تحليل أنماط الحزم التي تم الحصول عليها من كل مؤشر عن طريق بناء مخططات شجرية على طريقة مجموعة الأزواج غير الموزونة بالمتوسط الحسابي وباستخدام معامل النرد للحصول على أرقام عشوائية.
من ناحية أخرى، تم تقييم القوة التمييزية لكل مؤشر باستخدام معامل سيمبسون التمييزي.
أظهرت الصورة الجينية لجين gnd التي تم الحصول عليها باستخدام إنزيم التقييد AciI ومؤشر تباين أطوال الشريط المفرد للدنا لتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل باستخدام جين groEL والتي سمحت بالتمايز بين وداخل الأنماط المصلية.
أخيرا، أظهر مؤشر التنميط الرايبي لتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل أعلى قوة تمييزية (0.8571).
نستنتج من هذه الدراسة بان هناك ثلاث مؤشرات للتنميط الجيني المعتمدة على تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل والتي توفر بديلا لتحديد أوجه التشابه والاختلاف ضمن سلالات السالمونيلا المعوية المأخوذة من مناطق جغرافية وبيولوجية مختلفة.
Abstract EN
This study aims to characterize different salmonella enteric a subsp molecularly.
enteric a strains (n=49) were isolated from human gastrointestinal cases in the Tolima region and poultry from santander and Tolima regions using PCR-RFLP, PCR-ribotyping, and PCR-SSCP.
the band patterns obtained with each technique were analyzed by building dendrograms based on the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) method and using the dice coefficient.
on the other hand, the discriminatory power of each technique was assessed using simpson's discriminatory index.
the genetic profiles of the GND gene obtained with ACII restriction enzyme and the PCR-SSCP carried out with groEL gene allowed the inter-and intraserovar differentiation.
finally, the PCR-ribotyping method exhibited the highest discriminatory power (0.8571).
in conclusion, we show three PCR-based genotyping methods providing an alternative for identifying similarities and differences within salmonella enteric a strains from different geographic and biological regions.
American Psychological Association (APA)
Cruz-Méndez, Juan S.& Ortiz-Muñoz, Julián D.& Rondon-Barragan, Iang S.. 2022. Genotyping of salmonella enterica strains from animal and human origin using three molecular techniques. Iraqi Journal of Veterinary Sciences،Vol. 36, no. 2, pp.531-538.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1341740
Modern Language Association (MLA)
Cruz-Méndez, Juan S.…[et al.]. Genotyping of salmonella enterica strains from animal and human origin using three molecular techniques. Iraqi Journal of Veterinary Sciences Vol. 36, no. 2 (2022), pp.531-538.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1341740
American Medical Association (AMA)
Cruz-Méndez, Juan S.& Ortiz-Muñoz, Julián D.& Rondon-Barragan, Iang S.. Genotyping of salmonella enterica strains from animal and human origin using three molecular techniques. Iraqi Journal of Veterinary Sciences. 2022. Vol. 36, no. 2, pp.531-538.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1341740
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references: p. 537-538
Record ID
BIM-1341740
