Most concern strains of Coronavirus-2 and diagnostic protocol in Iraqi's hospitals: a review

Other Title(s)

سلالات فيروس كورونا 2 الأكثر إثارة للقلق و البروتوكول التشخيصي في المستشفيات العراقية: مقال مراجعة

Joint Authors

Musafir, Hadil Karim
Abd al-Razzaq, Raghad Abd al-Latif
al-Bayati, Majid Ahmad
Abd al-Latif, Bashshar K.
al-Kabi, Sadiq Abd al-Rida Qatia

Source

Rafidain Journal of Science

Issue

Vol. 31, Issue 1 (31 Mar. 2022), pp.77-87, 11 p.

Publisher

University of Mosul College of Science

Publication Date

2022-03-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

11

Main Subjects

Biology

Topics

Abstract AR

المتلازمة التنفسية الحادة الجديدة ل Coronavirus-2، هي المسؤولة عن الوباء العالمي الحالي.

تسببت بظهور متغيرات COVID-19 في قارات مختلفة وخلقت قلق كبير على مستوى صحة الإنسان عالميا.

أثرت هذه المتغيرات على العديد من الأماكن حول العالم بما في ذلك الصين وأوروبا والمملكة المتحدة والولايات المتحدة.

أكثر المتغيرات المثيرة للقلق هي بيتا (النسب ب 1.351) وإبسيلون (النسب ب 1.429) وكابا (السلالة ب 1.617).

سمحت هذه المتغيرات للفيروس بأن يصبح أكثر قابلية للانتقال بين السكان، ولم يتم اكتشافه بسبب وجود عدد كبير من تراكم الطفرات في بروتين السنبلة (S)، خاصة داخل المجال الطرفي الأميني (NTD) ومجال ربط المستقبلات (RBD).

عواقب هذه المتغيرات تتمثل بتحفيز الفوعة العالية، وتكرار إعادة العدوى، وزيادة المقاومة للأجسام المضادة وحيدة النسيلة.

تبدأ عملية التشخيص في العراق باختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل لتأكيد الإصابة، ومع ذلك، إذا كانت النتيجة سلبية مع استمرار الأعراض، يجب اتباع فحص PCR والتصوير المقطعي المحوسب CT، وهو الإجراء الأكثر دعما لتشخيص العدوى، تصنف العدوى إلى ثلاثة أنواع اعتمادا على أعراض التليف الكيسي إذا كانت عالية، متوسطة أو منخفضة.

إجراءات تشخيص العدوى يمكن تلخيصها بوجوب إجراء جميع الاختبارات التشخيصية حتى لو كانت نتائج تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) سلبية.

Abstract EN

The new Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 is responsible for the current global pandemic.

the emergence of COVID-19 variants on different continents has caused great concern in global human health.

These variants affected many places around the world including China, Europe, U.K., and United States.

The most variant of concern is Beta (lineage B.1.351), Epsilon (lineage B.1.429), and Kappa (lineage B.1.617).

these variants allowed the virus to become higher transmissible in the population, and undetected because a large number of mutations accumulate in the spike (S) protein, especially within the amino-terminal domain (NTD) and receptor-binding domain (RBD).

the consequences of these variants are stimulated high virulence, frequent re-infection, and increased resistance for monoclonal antibodies.

in Iraq the diagnosing process starts with a PCR test to confirm the infection, however, if the result comes up negative with persistence symptoms, the PCR need to be followed by CT the most supportive procedure for diagnosing the infection, where the infection is classified into three types depends on symptoms of cystic fibrosis as High confidence, intermediate confidence, and low confidence.

the diagnosis procedure infection summaries that all series of diagnostic tests need to be done even if the PCR results are negative.

American Psychological Association (APA)

Musafir, Hadil Karim& Abd al-Razzaq, Raghad Abd al-Latif& al-Bayati, Majid Ahmad& al-Kabi, Sadiq Abd al-Rida Qatia& Abd al-Latif, Bashshar K.. 2022. Most concern strains of Coronavirus-2 and diagnostic protocol in Iraqi's hospitals: a review. Rafidain Journal of Science،Vol. 31, no. 1, pp.77-87.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1343006

Modern Language Association (MLA)

al-Kabi, Sadiq Abd al-Rida Qatia…[et al.]. Most concern strains of Coronavirus-2 and diagnostic protocol in Iraqi's hospitals: a review. Rafidain Journal of Science Vol. 31, no. 1 (2022), pp.77-87.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1343006

American Medical Association (AMA)

Musafir, Hadil Karim& Abd al-Razzaq, Raghad Abd al-Latif& al-Bayati, Majid Ahmad& al-Kabi, Sadiq Abd al-Rida Qatia& Abd al-Latif, Bashshar K.. Most concern strains of Coronavirus-2 and diagnostic protocol in Iraqi's hospitals: a review. Rafidain Journal of Science. 2022. Vol. 31, no. 1, pp.77-87.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1343006

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references: p. 85-86

Record ID

BIM-1343006