Molecular identification of some surrounding species of family Boraginaceae within Elba mountain

Other Title(s)

التعريف الجزيئي لبعض أنواع النباتات المحيطة بالعائلة الحمحامية في جبل علبة

Author

al-Shirbini, Isra Atiyyah

Source

Egyptian Journal of Desert Research

Issue

Vol. 72, Issue 1 (30 Jun. 2022), pp.107-120, 14 p.

Publisher

Desert Research Center

Publication Date

2022-06-30

Country of Publication

Egypt

No. of Pages

14

Main Subjects

Agriculture

Topics

Abstract AR

تم استخدام تقنية باركود الحمض النووي DNA في تحديد أنواع النباتات البرية و الغير مؤكدة.

في هذه الدراسة تم عمل استكشاف و مسح للنباتات البرية السائدة في منطقة جبل علبة الواقع في الركن الجنوبي الشرقي من مصر.

تم جمع العينات و استخلاص الحمض النووي، و عمل PCR و التسلسل باستخدام منطقتين جزيئيتين (كلوروبلاست rbcL وITS النووية).

حيث تم دراسة تسعة أنواع تنتمي إلى ثلاث عائلات نباتية (Capparaceae و Lamiaceace و Moraceace) استنادا إلى كل من بحث بلاست و تحليل النشوء و التطور، تم تحديد الأنواع و التحليل المقارن و عرضها أثناء اتخاذ قرار تحديد الهوية.

و أخيرا تم التمكن من تحديد ستة أنواع من أصل تسعة، و تم تحديد خمسة بناء على تسلسل رمز شريطي واحد للحمض النووي و آخر بناء على منطقتي الجينين rbcL وITS حيث أن هذه الدراسة جزء من دراسات متسلسلة تستهدف تحديد و تعريف و توصيف أنواع النباتات البرية بجبل علبة في مصر.

Abstract EN

Floral identification has expanded to include additional aspects including the DNA barcoding technique to aid in the identification and delimitation of wild and uncertain plant species.

in the current study an area with little focus, Elba mountain in the far southern east corner of Egypt that have been explored and surveyed for the dominant plant species.

the samples were collected, and were subjected to DNA extraction, PCR and sequencing using two molecular regions (chloroplast RBCL and nuclear ITS).

a total of nine species belong to three plant families are reported in this work (i.

e., the Capparaceae, Lamiaceace and Moraceace).

based on both BLAST search and phylogenetic analysis, the species identification procedure and comparative analysis were explained and shown while the identification decision was taken.

in conclusion, six out of the nine species were identified, five were identified based on one DNA barcode sequence, and one based on the two regions.

the identified and identified cases are shown and discussed in detail.

this is a part of serial studies targeting the identification and delimitation of floral species dominating Elba mountain of Egypt.

American Psychological Association (APA)

al-Shirbini, Isra Atiyyah. 2022. Molecular identification of some surrounding species of family Boraginaceae within Elba mountain. Egyptian Journal of Desert Research،Vol. 72, no. 1, pp.107-120.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1443631

Modern Language Association (MLA)

al-Shirbini, Isra Atiyyah. Molecular identification of some surrounding species of family Boraginaceae within Elba mountain. Egyptian Journal of Desert Research Vol. 72, no. 1 (2022), pp.107-120.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1443631

American Medical Association (AMA)

al-Shirbini, Isra Atiyyah. Molecular identification of some surrounding species of family Boraginaceae within Elba mountain. Egyptian Journal of Desert Research. 2022. Vol. 72, no. 1, pp.107-120.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1443631

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 116-119

Record ID

BIM-1443631