Existence, molecular identification and genetic variation of new isolates of seed gall nematode Anguina tritici parasitizing on wheat and barley in Iraq

Other Title(s)

التواجد و التشخيص الجزيئي و التباين الوراثي لعزلات جديدة من نيماتودا تثالل الحبوب Anguina tritici المتطفلة على الحنطة و الشعير في العراق

Joint Authors

Ammi, Sulayman Nayif
Kuri, Rahmah Sabah

Source

Mesopotamia Journal of Agriculture

Issue

Vol. 51, Issue 1 (31 Mar. 2023), pp.32-47, 16 p.

Publisher

University of Mosul College of Agriculture and Forestry

Publication Date

2023-03-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

16

Main Subjects

Agriculture

Abstract AR

هدفت هذه الدراسة إلى التحري عن نيماتودا تثلل حبوب الحنطة Anguina tritici المسببة لمرض تثالل الحبوب في سايلوات وبعض حقول الحنطة في محافظة دهوك / إقليم كوردستان-العراق و تشخيص أربع عزلات جديدة من هذه النيماتودا على الحنطة و عزلة واحدة منهاعلى الشعير جمعت من مناطق مختلفة من العراق.

أظهرت النتائج تلوث عينات شوائب حبوب الحنطة بثاليل الحبوب بنسبة 66٪ كأعلى نسبة تلوث في عام 2020 في سايلو مدينة فايدة، فيما سجلت اقلها (6٪) في سايلو زاخو خلال السنة ذاتها.

أما عن نسبة الإصابة في حقول الحنطة فقد سجلت أعلاها (34.6٪) في حقول مدينة عقرة و اقلها (2٪) في حقول مدينة سميل.

أظهر الترحيل الكهربائي لنواتج تضخيم الحامض النووي DNA باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) لعزلات هذه النيماتودا على الحنطة و الشعير حزما متشابها (≈ 750 bp زوج قاعدة)، كما أثبتت نتائج تحليل التتابع النيكليوتيدات أن جميع عزلات هذه النيماتودا تنتمي إلى النوع Anguina tritici و تبين من مقارنة تسلسل النيكليوتيدات لمنطقة التباعد الداخلي(ITS) للحامض النووي لعزلات هذه النيماتودا باستخدام برنامج BLAST من بنك الجينات الدولي و تأكيدها بالمخطط التنقيطي (DNA Dot Plot) أنها متشابهة وراثيا بنسبة 100%.

أظهرت نتائج تحليل شجرة النشوء و التطور أو الشجرة الوراثية أن عزلات النيماتودا المشخصة في هذه الدراسة تشكلت في مجموعة متماثلة مع بعضها البعض و مع عزلتين من نفس النوع من العراق، بينما ازدادت الفروقات النوكليوتيدية مع أنواع النيماتودا الأخرى من نفس الجنس و ازداد التباين الوراثي بوتيرة اكثر مع الأنواع الأخرى من نفس العائلة (Anguinidae).

Abstract EN

This study aimed to investigate the existence of wheat seed gall nematode Anguina tritici in the silos and some wheat fileds in Duhok province / Kurdistan Region - Iraq.,and diagnose four new isolates of this nematode on wheat and one isolate on barley collected from different loactions in Iraq.The results indiacted that wheat impurities samples were infested with seed galls by 66 % as the highest percentager in silo of Faidia during 2020, while the lowest (6%) recoded in the silo of Zakho during the same year.The highest disease incidence was recorded in the wheat fields of Akre by 34.6%,while the lowest (2%) in the wheat fields of Semel.

Molecular identification results revealed that the bands of amplified DNA products of all nematode isolates were visualized by agarose gel electrophoresis in the same position ("~" up to 750 bp).Sequencing of the partial gene 5.8S rRNA gene confirmed that all nematode isolates belong to seed gall nematode A.tritici, also a description of their accession number by blast program showed the same percentage identitiy (100 %), and their comparision by a DNA Dot Plot emphasized that they are genetically similar.

Results of phylogenetic tree analysis showed grouping of nematode isolates with each other and with the other two isolates of the same species from Iraq,whilst nucleotide variations increased with other nematode species of the same genus,and increased more with other nematode species of the same family (Anguinidae).

American Psychological Association (APA)

Ammi, Sulayman Nayif& Kuri, Rahmah Sabah. 2023. Existence, molecular identification and genetic variation of new isolates of seed gall nematode Anguina tritici parasitizing on wheat and barley in Iraq. Mesopotamia Journal of Agriculture،Vol. 51, no. 1, pp.32-47.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493696

Modern Language Association (MLA)

Ammi, Sulayman Nayif& Kuri, Rahmah Sabah. Existence, molecular identification and genetic variation of new isolates of seed gall nematode Anguina tritici parasitizing on wheat and barley in Iraq. Mesopotamia Journal of Agriculture Vol. 51, no. 1 (2023), pp.32-47.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493696

American Medical Association (AMA)

Ammi, Sulayman Nayif& Kuri, Rahmah Sabah. Existence, molecular identification and genetic variation of new isolates of seed gall nematode Anguina tritici parasitizing on wheat and barley in Iraq. Mesopotamia Journal of Agriculture. 2023. Vol. 51, no. 1, pp.32-47.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493696

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 46-47

Record ID

BIM-1493696