Used nasted-pcr detection of phytoplasma causing big bud disease on tomato in Iraq

Other Title(s)

استخدام طريقة تضاعف البلمرة المتسلسل-المتداخل Nested-PCR للكشف عن الفايتوبلازما المسببة لمرض تضخم البراعم على الطماطة في العراق

Joint Authors

Yunus, Layth Qays
Ali, Hamid Hammud

Source

Mesopotamia Journal of Agriculture

Issue

Vol. 50, Issue 4 (31 Dec. 2022), pp.10-18, 9 p.

Publisher

University of Mosul College of Agriculture and Forestry

Publication Date

2022-12-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

9

Main Subjects

Agriculture

Abstract AR

تمت ملاحظة أعراض شبيهة بالأعراض الفايتوبلازمية على محصول الطماطة Solanium ycopersicum/ المزروعة في حقول مختارة من مدينة الموصل العراق، في مرحلة تكوين البراعم و بداية التزهير و تمثلت تلك الأعراض بالتفاف و تقزم و تجعد الأوراق، تشوه البراعم الزهرية، تورق للأزهار، بالإضافة الى تضخم كأس الزهرة و التحام البتلات على شكل جرس، تم جمع بحدود 30 عينة ممثلة لتلك الأعراض و عينيتين سليمتين للمقارنة تم اثبات وجود الفايتوبلازما خلال فحص PCR و Nested-PCR بعشرة عينات و باستخدام بادئات عامة و متخصصة بأنواع P1/P7 الفايتوبلازما تعود الى مجموعة تورق البرسيم (الجت) Clover proliferation و تحت المجموعة 16Sr VI-A) Candidatuse phytoplasma trifolii).

و كشف التسلسل و التحليل الوراثي Phylogeny tree أن العزلة المحلية من مدينة الموصل لها هوية تسلسلية بنسبة < 99.2% مع Candidatus Phytoplasma trifolii 16Sr VI و هي عضو في مجموعة فرط النمو الورقي للبرسيم (16Sr VI).

مع 27 تسلسل وراثي تابع لنفس المجموعة من حول العالم.

و يعد هذا البحث التسجيل الأول في الموصل لمثل هذا النوع من الفيتوبلازما التي تصيب الطماطة في العراق.

Abstract EN

Symptoms similar to those produced by the phytoplasma disease "Big bud" were observed on tomatoes (Solanum lycopersicum L.) grown in the field in Mosul city, Iraq.

diseased plants were characterized by twisting, corrugated, yellowing or reddening of leaves.

the sepals of the flowers acquired hypertrophied form, were fused together and created a bell-shaped sterile bud (phyllody) of green or anthocyanin color.

the stems of the plants were lignified, and phloem necrosis was observed on the stem.

in mid-september 2020, samples of 30 diseased and 2 healthy (control) tomato plants were collected from the fields.

phytoplasmas were detected by PCR and Nested-PCR in 10 diseased samples, use universal and specific primers.

the results of a phylogenetic tree consisting of 27 genetic sequences of the 16 S ribosomal RNA gene of candidatus phytoplasma trifolii, locally isolated from Iraq/Mosul, showed a sequence identity with a high percentage of genetic similarity of 99% with candidatus phytoplasma trifolii 16Sr member VI-A.

Clover proliferation group (16Sr VI), with various isolates from around the world.

American Psychological Association (APA)

Yunus, Layth Qays& Ali, Hamid Hammud. 2022. Used nasted-pcr detection of phytoplasma causing big bud disease on tomato in Iraq. Mesopotamia Journal of Agriculture،Vol. 50, no. 4, pp.10-18.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493803

Modern Language Association (MLA)

Yunus, Layth Qays& Ali, Hamid Hammud. Used nasted-pcr detection of phytoplasma causing big bud disease on tomato in Iraq. Mesopotamia Journal of Agriculture Vol. 50, no. 4 (2022), pp.10-18.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493803

American Medical Association (AMA)

Yunus, Layth Qays& Ali, Hamid Hammud. Used nasted-pcr detection of phytoplasma causing big bud disease on tomato in Iraq. Mesopotamia Journal of Agriculture. 2022. Vol. 50, no. 4, pp.10-18.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493803

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 16-18

Record ID

BIM-1493803