Rapd marker to screening genetic diversity of local chicken
Other Title(s)
التنوع الجيني للدجاج المحلي باستخدام RAPD-PCR
Author
Source
Mesopotamia Journal of Agriculture
Issue
Vol. 50, Issue 4 (31 Dec. 2022), pp.45-53, 9 p.
Publisher
University of Mosul College of Agriculture and Forestry
Publication Date
2022-12-31
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
9
Main Subjects
Abstract AR
إجمالي 500 دجاج محلية من مختلف مناطق العراق، تم تقسيمها إلى خمس مجموعات حسب المناطق التي أخذت منها و هي : الشرق (E)، الغرب (W)، الشمال (N)، الجنوب (S)، و المنطقة الوسطى (C) من العراق.
تم جمع عينات الدم في أنابيب تحتوي علىEDTA ، و تم إجراء استخراج الحمض النووي و تحديد تركيز الحمض النووي و نقاوته النسبية بواسطة مطيافNano Drop ، و تراوحت درجة نقاء عينات الحمض النووي من 1.8 إلى 1.9 و من ثم إجراء التضخيم العشوائي للحمض النووي متعدد الأشكال (RAPD-PCR) باستخدام 20 بادئة منGen Script USA ، كان لتفاعل PCR حجم نهائي قدره 25 ميكروليتر، أن التضخيم إجمالي 473 موقعا تتراوح بين 200 و 1800 وزن جزيئي.
أعلى عدد الحزم في مجموعة الدجاج المحلية الشمالية (N) (101) ثم المجموعات الأخرى, أظهرت العصابات متعددة الأشكال عددا أعلى في النمط الظاهري للمجموعة الشرقية (E) و الجنوبية (S) و نسبة تعدد الأشكال (6.2%) في المجموعة الشرقية (E)، تم تسجيل أعلى تشابه وراثي (0.893) بين المجموعتين الشمالية (N) و الغربية(W)، بناء على المسافة الجينية التي تم إنشاؤها لإظهار علاقات النشوء و التطور بين مجموعات الدجاج المحلية.
كان من الواضح أنمجموعة الجنوب (S) يبدو أكثر بعدا عن المجموعات الأخرى بينما الغرب (W) و الشمال (N) كانا مرتبطين ارتباطا وثيقا مع أعلى تشابه وراثي و التطابق الوثيق بين الغرب (غرب)، شمال (شمال).
أن أهداف الدراسة الحالية تقييم الخصوصية الوراثية للدجاج الموجود في العراق بناء على تحليل RAPD PCR و لتقييم الارتباط الوراثي بين مجموعات الدجاج و فهم مدى الاختلاف الجيلي بين مجموعات الدجاج المحلية في العراق Song.
Abstract EN
A total of 500 local chickens from different regions of Iraq, which were divided into five groups according to the regions from which they were taken, namely, the East (E), West (W), North (N), South (S), and Central (C) regions of Iraq.
The blood samples were collected into tubes containing an EDTA, DNA extraction was carried.
using 20 primers from gen script USA, random amplification of polymorphic DNA (RAPD PCR) was carried out.
the reaction of PCR had a final volume of 25 μl.
A total of 473 loci ranging between 200 and 1800 bp were amplified.
the higher numbers of bands shown in north(N) local chicken group (101) than the other groups.
East (E) and South (S) groups phenotypic revealed higher numbers of the polymorphic bands.
the polymorphism percent (%6.2) in East (E).
between the north (N) and west (W) groups, the genetic similarity score was found to be the highest (0.893).
dendogram It was clear that the South(S) appeared to be most distant from the other groups whereas the West (W), North (N) were related closely together whose genetic closeness is highest.
the main aim of present study is to assess the genetic specificity chickens in Iraq independs on RAPD analysis, to assess phylogenetic relatedness between groups of chickens, is to understand the extent of genetic variation between local chickens groups in Iraq.
American Psychological Association (APA)
Abd al-Razzaq, Huriyyah Sabir. 2022. Rapd marker to screening genetic diversity of local chicken. Mesopotamia Journal of Agriculture،Vol. 50, no. 4, pp.45-53.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493873
Modern Language Association (MLA)
Abd al-Razzaq, Huriyyah Sabir. Rapd marker to screening genetic diversity of local chicken. Mesopotamia Journal of Agriculture Vol. 50, no. 4 (2022), pp.45-53.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493873
American Medical Association (AMA)
Abd al-Razzaq, Huriyyah Sabir. Rapd marker to screening genetic diversity of local chicken. Mesopotamia Journal of Agriculture. 2022. Vol. 50, no. 4, pp.45-53.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493873
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 51-53
Record ID
BIM-1493873
