Molecular identification of some aphid species (homoptera ; aphididae)‎ based on rflp-pcr technique

Other Title(s)

الكشف الجزيئي لبعض أنواع المن (Homoptera ; Aphididae)‎ باستخدام تقنية تباين أطوال قطع التقييد-تفاعل البلمرة المتسلسل

Joint Authors

Taha, Kamaran Mustafa
Muhammad, Hiru Muhyi al-Din
Mawlud, Dilzar Hamad
Mawlud, Nabil Abd al-Qadir

Source

Mesopotamia Journal of Agriculture

Issue

Vol. 50, Issue 4 (31 Dec. 2022), pp.107-116, 10 p.

Publisher

University of Mosul College of Agriculture and Forestry

Publication Date

2022-12-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

10

Main Subjects

Agriculture

Abstract AR

هذا العمل يتضمن تشخيص ثمانية أنواع من المن التي جمعت من أوراق نباتات عدة من مواقع مختلفة في محافظة أربيل، إقليم كردستان العراق و هي : ,Chaitophorus salijaponicus, Aphis fabae Macrosiphum rosae, Capitophorus carduinus, Myzus persicae, Aphis ruborum, Aphis punca, and Aphis gossypif, جين سايتوكروم المايتوكوندريا المؤكسد هو المستخدم لتحديد هذه الأنواع.

و قد تم عزل الحمض النووي الدنا، و تم تضخيم 550 قاعدة زوجية من جين mt COI باستخدام تقنية التفاعل البلمرة المتسلسل.

ثم تم هضم القطع المضخمة مع الأنزيمات القاطعة Hinf1 و Ddel.

و قد أدى هذا الهضم إلى إنتاج مجموعات توصيف محددة لكل نوع، ثم تم تحليل القطع المضخمة التي تم إنتاجها عن طريق تباين أطوال قطع التقييد بواسطة الترحيل الكهربائي بالهلام.

أوضحت النتائج أن القطع المضخمة المهضومة أعطيت حزم حسب مواقع قطع الانزيمات.

أظهرت هذه الدراسة أن دراسة حشرات المن لاكتشاف أنواعها من خلال تقنية تباين أطوال قطع التفييد- تفاعل البلمرة المتسلسل باستخدام إنزيمات القاطعة هذه يمكن أن تميز بعض الأنواع بنتائج موثوقة.

أن الإنزيمات القاطعة Hinfl و Ddel لم تتمكن التمييز بين جميع الأنواع.

انزيم القطع Hinfl ميز بين الأنواع Macrosiphum rosae و Capitophorus carduinus و Myzus persicae و Aphis gossypii ، في حين إنزيم القطع Ddel حددت الأنواع المتبقية، Chaitophorus salijaponicus Myzus persicum ،Macrosiphum rosae بينهما و داخل الأنواع الأخرى بالضبط.

اقترحت الدراسة استخدام إنزيمات القاطعة أخرى لتوفير ملف التعرف الكامل لجميع الأنواع المن.

Abstract EN

This work includes, identification eight species of aphids (homoptera : aphididae) which collected from the leaves of different plants in many localities of Erbil governorate Kurdistan region-Iraq from the period May till July 2022, these are : chaitophorus salijaponicus, aphis fabae, macrosiphum rosae, capitophorus carduinus, myzus persicae, aphis ruborum, aphis punca, and aphis gossypii.

the mitochondrial cytochrome C Oxidase subunit I (COI) gene used for identification these species.

DNA was isolated, and a band of 550 bp of mt COI gene was amplified during the PCR amplification.

the amplicons were digested with hinfl and ddel restriction enzymes.

the restricted fragments produced by RFLP technique were proved by agarose gel electrophoresis.

the results illustrated that digested amplicons were given bands according to their cut sites.

this study presented that studying aphids to detect their species through a RFLP-PCR technique by using these restriction enzymes can distinguish some species with reliable results.

Hinfl and Ddel REs could not distinguish all species, Hinfl only discriminated species macrosiphum rosae, capitophorus carduinus, myzus persicae and aphis gossypii, but ddel identified the remain species, chaitophorus salijaponicus, macrosiphum rosae, myzus persicae and aphis ruborum, within and among other species exactly.

the study suggested using other restriction enzymes to provide full recognition profile for all species.

American Psychological Association (APA)

Muhammad, Hiru Muhyi al-Din& Mawlud, Dilzar Hamad& Taha, Kamaran Mustafa& Mawlud, Nabil Abd al-Qadir. 2022. Molecular identification of some aphid species (homoptera ; aphididae) based on rflp-pcr technique. Mesopotamia Journal of Agriculture،Vol. 50, no. 4, pp.107-116.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493878

Modern Language Association (MLA)

Muhammad, Hiru Muhyi al-Din…[et al.]. Molecular identification of some aphid species (homoptera ; aphididae) based on rflp-pcr technique. Mesopotamia Journal of Agriculture Vol. 50, no. 4 (2022), pp.107-116.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493878

American Medical Association (AMA)

Muhammad, Hiru Muhyi al-Din& Mawlud, Dilzar Hamad& Taha, Kamaran Mustafa& Mawlud, Nabil Abd al-Qadir. Molecular identification of some aphid species (homoptera ; aphididae) based on rflp-pcr technique. Mesopotamia Journal of Agriculture. 2022. Vol. 50, no. 4, pp.107-116.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1493878

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 115-116

Record ID

BIM-1493878