Viral pathogens associated with lower respiratory tract infection in adults and children at Assiut university hospitals
Other Title(s)
الفيروسات المسببة لعدوى الجهاز التنفسي السفلي بمستشفيات جامعة أسيوط
Joint Authors
Bdari, Muhammad Sad
Thabit, Amani Jamal
Embarek, Muna Salam
Schweiger, brunhilde
Brune, wolfram
Uthman, Ahmad Hamid
Source
Issue
Vol. 35, Issue 1 (31 Jan. 2011), pp.17-34, 18 p.
Publisher
Assiut University Faculty of Medicine
Publication Date
2011-01-31
Country of Publication
Egypt
No. of Pages
18
Main Subjects
Topics
Abstract AR
- تعتبر عدوى الجهاز التنفسي السفلي من أكثر الأمراض انتشارا حيث لا يمكن التحكم في انتقالها من شخص لأخر و هناك الكثير من الأشخاص المصابين بعدوى الجهاز التنفسي السفلي بمستشفيات أسيوط الجامعية سواء من مرضى الأقسام الداخلية أو المترددين على العيادات الخارجية.
- و تعتبر الفيروسات من أهم الميكروبات المسببة لعدوى الجهاز التنفسي مثل الالتهاب الرئوي الحاد و ذلك كعامل وحيد مباشر أو كعامل مشترك مع البكتريا.
- لذلك كان الهدف الرئيسي من إجراء هذا البحث هو معرفة دور أهم الفيروسات في الأشخاص المصابين بعدوى الجهاز التنفسي السفلي.
- إن هذه الدراسة تعتبر الأولى من نوعها التي تعتمد على استخدام كل من الطرق التقليدية في عزل الفيروسات المسببة لأمراض الجهاز التنفسي السفلي و كذلك الطرق الجزيئية في تشخيص هذه الفيروسات و ذلك في ثلاثة مواسم شتوية متتالية.
و أكثر من ذلك تم عمل تصنيف للأحماض النووية الموجودة في الفيروسات من أجل تصنيف النشوء و التطور (Phylogenetic analysis) مع الفيروسات الموجودة في بنك الجينات.
- تضمن هذا البحث 520 مريضا مصابين بعدوى الجهاز التنفس السفلي من الأطفال و البالغين و الذين تتراوح أعمارهم ما بين 40 يوما – 80 عاما و كان عدد الأطفال المشاركين في هذه الدراسة 70 طفلا بينما بلغ عدد البالغين 450 مريضا.
البعض من هؤلاء المرضى كانوا من المترددين على العيادات الخارجية و البعض الآخر كانوا من مرضى القسم الداخلي بقسم أمراض الصدر بمستشفيات جامعة أسيوط.
- و قد تم أخذ التاريخ المرضي و التشخيص الإكلينيكي لهؤلاء المرضى كما تم أخذ عينات بصاق و مسحات من الأنف و البلعوم من جميع المرضى.
تضمن هذا البحث ثلاث مواسم شتوية متتالية منذ عام 2005 و حتى عام 2008م.
تم حفظ العينات في درجة حرارة -80 درجة مئوية حتى ميعاد شحنها إلى مؤسسة روبوت كوخ ببرلين – ألمانيا.
الدراسة كانت على عامين متتالين في مؤسسة روبرت كوخ من 2007 و حتى 2009م.
• للكشف عن وجود فيروسات و كذلك لتحليل هذه الفيروسات تم ما يلي : 1- الكشف عن وجود أحماض نووية خاصة بالفيروسات عن طريق تفاعل البلمرة المتسلسل و دراسة العلاقة بين هذه الفيروسات مع عوامل مختلفة مثل عوامل خطورة مثل التدخين و غيرها.
2- عزل الفيروسات على المزارع الخلوية الخاصة بكل فيروس.
3- تحديد معيار فيروس الأنفلونزا و كذلك عمل التصنيف الانتيجيني لهذا الفيروس عن طريق اختبار منع تجلط كرات الدم الحمراء.
4- التصنيف الجيني لفيروس الأدينو و ذلك عن طريق تحليل منحنى الذوبان الفلوريسيني.
5- التصنيف التسلسلي و كذلك تصنيف النشوء و التطور لفيروسات الجهاز التنفسي.
• و قد أظهرت النتائج الآتي : 1- تم تشخيص فيروسات الجهاز التنفسي في 79 مريض بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل.
2- كانت نسبة العدوى في الأطفال 46 % بينما كانت النسبة في البالغين 10,4 %.
3- فيروس الأنفلونزا كان أكثر الفيروسات المتواجدة في الحالات الإيجابية حيث وجد في 22 مريض بينما وجد فيروس HMPV في 21 مريض.
فيروس الأدينو تم تشخيصه في 20 مريض أما فيروس RSV فقد تم تشخيصه في 16 مريض.
4- كان التهاب الشعبيات الهوائية (Bronchiolitis) هو الأكثر تشخيصا بين الأطفال بينما كان الالتهاب الرئوي الحاد (Pneomonia) هو الأكثر تشخيصا بين البالغين.
5- تم تصنيف فيروس الأدينو إلى مجموعتين بي (B) و سي (C) باستخدام تحليل منحنى الذوبان الفلوريسيني للحمض النووي.
6- ست من الفيروسات الموجودة في المرضى تم عزلها على المزارع الخلوية، منها أربع فيروسات أنفلونزا و أثنان من فيروس الأدينو.
7- تم تصنيف الفيروسات الموجودة بواسطة التحليل الفيولوجيني بعد مقارنتها بفيروسات أخرى في بنك الجينات.
• من هذه الدراسة نستنتج الآتي : 1- لا زالت الفيروسات من أهم المسببات لعدوى الجهاز التنفسي السفلي في الأطفال.
كما أنها تتسبب في حالات عدوى الجهاز التنفسي السفلي في البالغين أيضا.
2- على الرغم أن عزل الفيروسات على المزارع الخلوية هي الطريقة المثلى للكشف عن وجود هذه الفيروسات في حالات عدوى الجهاز التنفسي السفلي إلا أنها تستغرق وقتا طويلا بالإضافة إلى عدم حساسيتها الفعالة بالمقارنة بالطرق الأخرى مثل الكشف عن الأحماض النووية بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل.
3- بعد تحليل النشوء و التطور للفيروسات الموجودة تبين أنها شبيهة إلى حد كبير بنفس أنواع الفيروسات المنتشرة في نفس الفترة في معظم دول العالم مما يبين أن هذه الفيروسات تنتقل في أنحاء الكرة الأرضية ما بين دولة و أخرى في نفس المواسم الشتوية.
4- هذه الدراسة تبين أهمية استخدام الطرق التشخيصية الجيدة مثل تفاعل البلمرة المتسلسل للبحث عن وجود فيروسات في عينات الجهاز التنفسي.
فهذه الطرق سريعة و ذات حساسية عالية.
• من هذا البحث نوصي بالاهتمام بالبحث عن الفيروسات في عدوى الجهاز التنفسي السفلي فهي تقف جنبا إلى جنب مع البكتريا كأهم المسببات لعدوى الجهاز التنفسي السفلي.
Abstract EN
Infection of the lower respiratory tract causes significant morbidity at Assiut University Hospitals in Assiut, Egypt among children and adults.
Respiratory viruses play an important role in lower respiratory tract infection affecting individuals of all age groups Aim of the study : to determine the contribution of viruses to lower respiratory tract infection in patients presented or admitted at Assiut University Hospitals, with typing, subtyping, and phylogenetic analysis of the detected viruses.
Materials and Methods : A two-year study was conducted from 2007 to 2009 at the National Influenza Centre (Robert Koch Institute, Berlin, Germany).
Respiratory samples obtained from 520 patients suffered from lower respiratory tract infection were collected.
Detection and characterization of the causative viruses was performed using both the conventional methods of viral isolation and molecular methods of real-time polymerase chain reaction and phylogenetic analysis.
Results : Seventy nine positive cases were detected with real-time polymerase chain reaction (representing a ratio of 15.2 % of the total number of cases) for one or more of the main respiratory viruses (influenza viruses, respiratory syncytial viruses, adenoviruses, and human metapneumoviruses).
Twenty two were children (accounting for 46 % of the total number of children included in the study) and 47 were adults (accounting for 10.4 % of the adult group).
Conclusion : viruses are the main cause of lower respiratory tract infection in children and can cause lower respiratory infection in adults hospitalized or presented at Assiut University Hospitals, Egypt.
Characterization of the detected viruses revealed that, they were similar to those reported from other parts of the world during the same period.
This proves worldwide spread of these viruses during winter-spring seasons.
American Psychological Association (APA)
Thabit, Amani Jamal& Bdari, Muhammad Sad& Uthman, Ahmad Hamid& Embarek, Muna Salam& Schweiger, brunhilde& Brune, wolfram. 2011. Viral pathogens associated with lower respiratory tract infection in adults and children at Assiut university hospitals. Assiut Medical Journal،Vol. 35, no. 1, pp.17-34.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-262300
Modern Language Association (MLA)
Thabit, Amani Jamal…[et al.]. Viral pathogens associated with lower respiratory tract infection in adults and children at Assiut university hospitals. Assiut Medical Journal Vol. 35, no. 1 (Jan. 2011), pp.17-34.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-262300
American Medical Association (AMA)
Thabit, Amani Jamal& Bdari, Muhammad Sad& Uthman, Ahmad Hamid& Embarek, Muna Salam& Schweiger, brunhilde& Brune, wolfram. Viral pathogens associated with lower respiratory tract infection in adults and children at Assiut university hospitals. Assiut Medical Journal. 2011. Vol. 35, no. 1, pp.17-34.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-262300
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 29-33
Record ID
BIM-262300
