![](/images/graphics-bg.png)
Gene flow in some oreochromis niloticus populations based on SSR linked markers to MHC loci class I
Other Title(s)
التدفق الجيني في بعض عشائر البلطي النيلي اعتمادا على بعض الواسمات المرتبطة بموقع معقد تجمع مورثات التوافق النسيجي الرئيسة (طراز1)
Joint Authors
Saad, Yasir Muhammad
al-Suudi, A. Ahmad
Ibrahim, Mahmud Mualla
Rashid, Muhammad
Source
Journal of Biological Chemistry and Environmental Sciences
Issue
Vol. 4, Issue 1 (31 Mar. 2009), pp.319-331, 13 p.
Publisher
Agricultural Chemistry and Environment Protection Society
Publication Date
2009-03-31
Country of Publication
Egypt
No. of Pages
13
Main Subjects
Topics
Abstract AR
تم استخدام أربعة من البادئات المتخصصة (GM211 و GM531 و GM538 و UNH185) للتوابع القصيرة و المتكررة للمادة الوراثية و المرتبطة بالموقع الوراثي معقد تجمع مورثات التوافق النسيجي الرئيسة (الفئة 1) في جينومات ثلاثة من العشائر المصرية من البلطي و المجمعة من مناطق مختلفة و هي أسوان (بحيرة ناصر) و الجيزة و القناطر الخيرية و ذلك بهدف قياس التدفق الجيني للموقع سالف الذكر اعتمادا على قياس معدل التدفق الجيني للواسمات الجزيئية المرتبطة به بالإضافة إلى تحديد مدى التشابه و الإختلاف بين العشائر السمكية موضع الدراسة اعتمادا على تلك الواسمات.
أظهرت النتائج ما يلي : -كل الواسمات الجزيئية (و التي تعتبر مواقع وراثية) المدروسة كانت متعددة المظاهر و بنسبة (100 %) في كل العشائر المدروسة و لقد لوحظ و بمعنوية عالية عدم تطابق التكرارات الأليلية المشاهدة في العشائر المدروسة مع التكرارات الأليلية المتوقعة.
-تم تقييم التباينات الوراثية من خلال حساب القيم المشاهدة للخليط و التي حسبت كمتوسط على المواقع الأربعة المدروسة فكانت 0.22 ± 0.45 و 0.11 ± 0.48 لكل من عشائر أسوان و الجيزة و القناطر و العشيرة الكلية على الترتيب.
و لقد وجد فروق كبيرة بين القيم المتوقعة و المشاهدة و هي تشير إلى عدم وجود عدم اتزان و قد تم تأكيد ذلك باختبار مربع كاي.
-بلغت قيمة التدفق الوراثي كتقدير لعدد الأفراد المهاجرة في الجيل الواحد بين العشائر المدروسة 6.3 و 4.3 و 4.1 بين كل زوج من أزواج العشائر التالية : أسوان مع الجيزة و أسوان مع القناطر و الجيزة مع القناطر على الترتيب و هذه القيم تعكس التدفق الجيني العالي نسبيا لعائلة جينات معقد تجمع موروثات التوافق النسيجي الرئيسية (طراز 1) حيث أن الواسمات التي تمت دراستها مرتبطة بهذا الموقع على الخريطة الجينومية لأسماك البلطي النيلي.
-وجد أن التشابه الوراثي كانت 0.60 و 0.40 و 0.35 بين كل زوج من أزواج العشائر التالية : أسوان مع الجيزة و أسوان مع القناطير و الجيزة مع القناطير على الترتيب.
و هذه القيم تشير إلى وجود قدر كبير من الاختلافات الوراثية على المستوى الجزيئي بين العشائر التي تم دراستها ذلك بالرغم من كونها تتبع نفس النوع، كذلك يلاحظ أن الاختلاف الأكبر كان بين الجيزة و القناطر بالرغم من ان المسافة الجغرافية بينهما هي الأقل نسبيا و حيث أن هذا الموقع (معقد تجمع موروثات التوافق النسيجي الرئيسية) يؤثر في النظام المناعي عامة في تلك الأسماك فإنه يمكن استنتاج الحالة المناعية لهذه الأسماك على طول نهر النيل من وجود و معدل تدفق هذا الموقع الوراثي الهام في جينومات الأسماك موضع الدراسة و من هنا تتضح أهمية دراسة هذا الموقع مع التوصية بإجراء المزيد من الدراسات الوراثية علية و إمداد قواعد البيانات العلمية بمثل هذه النتائج سوف يفيد صانع القرار في كيفية تصميم البرامج التي تهتم بصيانة و تنمية هذه الثورة السمكية.
Abstract EN
Four microsatellites linked to Major histocompatibility complex loci (MHC class I) were used to measure its flow among three Oreochromis Nilotic us populations.
Samples were collected from three different Egyptian locations namely, Aswan-Nasser Lake (As), Giza (G) and Quanater (Q).
Genotyping of 19 individuals from each population showed that all four microsatellites were polymorphic (100 %) in them.
The actual number of alleles (na) had the lowest value (na = 4 allele) at locus UNH185 in Q-population and the highest value (na = 13 allele) at several loci in the three studied populations.
The mean overall actual allele number (na = 18) was larger than the mean overall effective allele number (rie = 10).
The fixation index, genetic differentiation and gene flow were estimated among studied fish populations.
Genetic similarity was calculated for each studied population pair.
It were 0.60, 0.40 and 0.35 between (G and As), (Q and As) and (Q and G) population pairs, respectively.
The present study aimed to measure the gene flow of MHC loci class I using SSR linked markers.
In addition, to estimate the genetic diversity among the applied fish populations based on these co-dominant DNA markers.
American Psychological Association (APA)
Rashid, Muhammad& Saad, Yasir Muhammad& al-Suudi, A. Ahmad& Ibrahim, Mahmud Mualla. 2009. Gene flow in some oreochromis niloticus populations based on SSR linked markers to MHC loci class I. Journal of Biological Chemistry and Environmental Sciences،Vol. 4, no. 1, pp.319-331.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-273130
Modern Language Association (MLA)
Rashid, Muhammad…[et al.]. Gene flow in some oreochromis niloticus populations based on SSR linked markers to MHC loci class I. Journal of Biological Chemistry and Environmental Sciences Vol. 4, no. 1 (Mar. 2009), pp.319-331.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-273130
American Medical Association (AMA)
Rashid, Muhammad& Saad, Yasir Muhammad& al-Suudi, A. Ahmad& Ibrahim, Mahmud Mualla. Gene flow in some oreochromis niloticus populations based on SSR linked markers to MHC loci class I. Journal of Biological Chemistry and Environmental Sciences. 2009. Vol. 4, no. 1, pp.319-331.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-273130
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 328-329
Record ID
BIM-273130