Variation in hyoscyamus spp. Populations from Jordan using morphological traits and RAPD markers

Other Title(s)

التباين الوراثي في عشائر البنج البري hyoscyamus spp. من الأردن باستخدام الصفات الشكلية والبصمة الوراثية RAPD

Joint Authors

Abd al-Ghani, Adil Hasan Mahmud
Abu Isba, Samir M.
al-Quran, Salih Ahmad

Source

Jordan Journal of Agricultural Sciences

Issue

Vol. 3, Issue 4 (31 Dec. 2007), pp.411-428, 18 p.

Publisher

University of Jordan Deanship of Academic Research (DAR)

Publication Date

2007-12-31

Country of Publication

Jordan

No. of Pages

18

Main Subjects

Botany

Topics

Abstract AR

تمت دراسة التباين الوراثي لإثنتي عشرة عشيرة من Hyoscyamus aurus و أربع عشائر من H.

desertorum و عشيرتين من H.

reticulatus، باستخدام بعض الصفات الشكلية و على مستوى الحمض الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) باستخدام البصمة الوراثية RAPD.

تم رصد ستة عشر صفة شكلية بعد مئة يوم من الزراعة، حيث تبين وجود فروقات معنوية في اثنتي عشرة صفة من اصل ست عشرة.

أعطت ثلاث من البادئات عالية التباين باستخدام البصمة الوراثية RAPD ستين قطعة من DNA و كان ما نسبته 39.50 % من القطع متباينة.

تم استخدام تحليل التباين المتعدد لتصنيف العشائر التي تم جمعها على أساس الصفات الشكلية، و قطع DNA.

كان هنالك توافق في نتائج التصنيف النتاج عن الصفات الشكلية و تقنية RAPD، و بشكل عام كان استخدام شجرة العائلة و تحليل العامل الرئيسي (PCoA) فعالا في فصل العشائر على مستوى النوع.

أشارت نتائج التصنيف للعشائر باستخدام الصفات الشكلية و البصمة الوراثية RAPD إلى تجمع عشائر H.

aurus و عشائر H.

desertorum في مجموعة واحدة، مما يدل على قرب العلاقة الوراثية بين هذين النوعين مقارنة بالنوع H.

reticulates.

و كان المدى للمسافة الوراثية واسعا بين العشائر في النوع نفسه، و ذلك قد يكون عادا للاختلافات البيئية-الجغرافية بين مواقع الجمع.

تعتبر هذه الدراسة دراسة أولية لمعرفة علاقة القرابة و العلاقة بين المورثات داخل الجنس Hyoscyamus.

Abstract EN

Variation of twelve Hyoscyamus aureus, four H.

desertorum and two H.

reticulatus populations from Jordan were investigated at the phenotypic level with morphological characters and at DNA level using the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique.

Sixteen morphological traits were measured after 100 days from planting.

There was a significant difference among the collected populations in 12 out of 16 morphological traits.

The three highly polymorphic selected primers generated 60 RAPD bands with 39.5% mean level of the proportion of polymorphic loci.

Multivariate procedures using dendograms and Principle Coordinate Analysis (PCoA) were used to classify the collected populations on the basis of phenotypic traits and RAPD fragments.

RAPD estimate of genetic relationships among Hyoscyamus species was consistent with morphological study results.

From the cluster analyses using dendograms and PCoA, it appears that morphological traits and RAPD markers were useful to separate the populations at the species level.

Cluster analysis of the morphological and RAPD data indicates that H.

aureus and H.

desertorum populations were grouped with each other, revealing closer genetic relationships of the two species with each other than with H.

reticulatus.

A wide range of genetic distances was observed among populations within the same species, which might be due to high degree of ecogeographical heterogeneity among collection sites.

In conclusion, the present study serves as a base knowledge of the phylogenetic relationships for future studies among and within the genus Hyoscyamus

American Psychological Association (APA)

Abu Isba, Samir M.& Abd al-Ghani, Adil Hasan Mahmud& al-Quran, Salih Ahmad. 2007. Variation in hyoscyamus spp. Populations from Jordan using morphological traits and RAPD markers. Jordan Journal of Agricultural Sciences،Vol. 3, no. 4, pp.411-428.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-276816

Modern Language Association (MLA)

Abu Isba, Samir M.…[et al.]. Variation in hyoscyamus spp. Populations from Jordan using morphological traits and RAPD markers. Jordan Journal of Agricultural Sciences Vol. 3, no. 4 (Dec. 2007), pp.411-428.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-276816

American Medical Association (AMA)

Abu Isba, Samir M.& Abd al-Ghani, Adil Hasan Mahmud& al-Quran, Salih Ahmad. Variation in hyoscyamus spp. Populations from Jordan using morphological traits and RAPD markers. Jordan Journal of Agricultural Sciences. 2007. Vol. 3, no. 4, pp.411-428.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-276816

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 427-428

Record ID

BIM-276816