sequence analysis of the hepatitis c virus non-structural 5a region (ns5a) in patients with hepatocellularcarcinoma
Other Title(s)
تحليل تتابع RNA لفيروس الإلتهاب الكبدي الوبائي سي المستخلص من الجزء NS5A في المرضى المصابين بسرطان خلايا الكبد المصاحب للإلتهاب الكبدي الوبائي سي
Joint Authors
al-Dasuqi, Halah Muhammad
Amir, Nihad Ahmad
Amir, Hana Ahmad
Shanawany, Dina A.
Hamid, Hatim Sayyid
Abd al-Fattah, Muhammad Muhammad
Source
Journal of the Arab Society for Medical Research
Issue
Vol. 3, Issue 2 (31 Dec. 2008), pp.119-126, 8 p.
Publisher
Arab Society for Medical Research
Publication Date
2008-12-31
Country of Publication
Egypt
No. of Pages
8
Main Subjects
Topics
Abstract AR
تعد أورام الخلايا الكبدية السرطانية واحدة من أكثر أنواع الأورام السرطانية انتشارا حيث تمثل أكثر من 5 % من كل أنواع السرطانات.
يهدف هذا البحث إلى دراسة التتابع النيوكليوتيدي لمنطقة NS5A لفيروس الالتهاب الكبدي الوبائي سي من المرضى المصابين بسرطان الخلايا الكبدية مع الالتهاب الكبدي الوبائي سي و مقارنته بالتتابع الجيني لنفس المنطقة للفيروس من مجموعة أخرى من المرضى المصابين بالالتهاب الكبدي الوبائي سي النشط و المزمن من أجل تحديد التشابهات و الاختلافات بين المجموعتين.
اشتملت هذه الدراسة على 20 من المرضى الذكور التي تتراوح أعمارهم من 43 إلى 74 عام و المصابين بفيروس الالتهاب الكبدي الوبائي سي من النوع (4 أ) المصاحب بأورام الخلايا الكبدية السرطانية مع عدم انتشار و تغلغل المرض خارج الخلايا الكبدية.
كما أثبت الفحوصات عدم وجود جينات مضادة فيروس الالتهاب الكبدي الوبائي بي لدى جميع المرضى.
كما تضمنت الدراسة أيضا 10 من المرضى الذكور المصابين بالالتهاب الكبدي الوبائي سي النشط و المزمن من نفس أعمار المجموعة الأولى و هم يمثلون المجموعة الضابطة.
كما تم استخلاص رنا فيروس الالتهاب الكبدي الوبائي سي من أمصال جميع المرضى و تم تكبيره بالإضافة إلى دراسة تتابعه الجيني.
أشارت النتائج إلى إن التتابع الجيني لمنطقة NS5A للفيروس لدى 55 % أي (11 من 20) من المرضى المصابين بالأورام السرطانية للخلايا الكبدية مع الالتهاب الكبدي الوبائي سي متطابق 100 % مع التتابع النيكليوتيدي لنفس المنطقة للفيروس الموجود تحت رقم (NP-751927) بينما وجدت بعض الطفرات التي تتراوح من 4-6 أي 96 % تطابق بمعدل 5 طفرات لكل حالة لدى 40 % من المرضى أي 9 مرضى المتبقيين.
كما أوضحت النتائج وجود 84 % من الطفرات في منطقة ISDR في مجموعة المرضى المصابين بالفيروس و ذلك مقارنة بالمجموعة الضابطة.
بالإضافة إلى 73.5 % من الطفرات في منطقة PKR-bd في مجموعة المرضى المصابين بالفيروس و ذلك مقارنة بالمجموعة الضابطة.
من النتائج السابقة نستخلص أن منطقة NS5A لفيروس الالتهاب الكبدي الوبائي سي قليلة التباين في المرضى المصابين بالأورام السرطانية للخلايا الكبدية مع الالتهاب الكبدي الوبائي سي كما أن الاختلافات في الأحماض الأمينية في ISDR / PKR يعد عامل أساسي نحو حدوث أورام الخلايا الكبدية السرطانية لدى المصابين بالالتهاب الكبدي المزمن.
Abstract EN
Objectives: The current study was aimed to analyze the sequence of hepatitis C virus non-structural 5A region (NS5A) from patients with hepatocellular carcinoma (HCC) on top of hepatitis C virus and compare these sequences with those of hepatitis C virus non-structural 5A region (NS5A) from patients with chronic active hepatitis C virus to characterize the similarity and/or differences between the two groups.
Subjects and Methods: This study included 20 male Egyptian patients, their age ranged from 43 to 74, with hepatitis C virus – related hepatocellular carcinoma (HCV-related HCC) and no evidence of extrahepatic metastasis.
All were negative for hepatitis B surface antigen (HBsAg).
All patients were HCV genotype-4a.
Ten Egyptian patients with chronic active hepatitis C virus with matched age and sex were also included as reference group.
Serum samples were collected for HCVRNA extraction, amplification and sequencing.
Results: Sequence analysis revealed that 11 patients out of 20 (55%) of the HCV-related HCC group harbored a wild-type strain sequence of NS5A region (Accession # NP_751927) with a 100% sequence identity, while the other 9 patient (45%) harbored mutations ranged from 4-6 with an average of 5 mutations / case with a mean sequence identity of 96.0%.
A significant increase of the mean number of mutations in the IFN-sensitivity-determining region (ISDR) in the reference group (P<0.001) compared to the patient group with 84% change.
Mutation in PKR-bd region in the reference group was (P<0.001) compared to the patient group with 73.5% change.
Conclusion: the wild type NS5A region was significantly higher in HCV-related HCC patients and the amino acid substitutions in ISDR/PKR domains could be significant factor associated with the development of HCC in long standing patients with chronic active hepatitis.
American Psychological Association (APA)
al-Dasuqi, Halah Muhammad& Amir, Hana Ahmad& Shanawany, Dina A.& Amir, Nihad Ahmad& Hamid, Hatim Sayyid& Abd al-Fattah, Muhammad Muhammad. 2008. sequence analysis of the hepatitis c virus non-structural 5a region (ns5a) in patients with hepatocellularcarcinoma. Journal of the Arab Society for Medical Research،Vol. 3, no. 2, pp.119-126.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-28400
Modern Language Association (MLA)
al-Dasuqi, Halah Muhammad…[et al.]. sequence analysis of the hepatitis c virus non-structural 5a region (ns5a) in patients with hepatocellularcarcinoma. Journal of the Arab Society for Medical Research Vol. 3, no. 2 (Dec. 2008), pp.119-126.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-28400
American Medical Association (AMA)
al-Dasuqi, Halah Muhammad& Amir, Hana Ahmad& Shanawany, Dina A.& Amir, Nihad Ahmad& Hamid, Hatim Sayyid& Abd al-Fattah, Muhammad Muhammad. sequence analysis of the hepatitis c virus non-structural 5a region (ns5a) in patients with hepatocellularcarcinoma. Journal of the Arab Society for Medical Research. 2008. Vol. 3, no. 2, pp.119-126.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-28400
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 125
Record ID
BIM-28400
