Detection of fim A and fim C genes of salmonella isolates by using polymerase chain reaction
Joint Authors
al-Hamdani, Adnan Hamad Ubayd
Jawad, Ala Abd al-Kazim
Source
Journal of Basrah Researches : Sciences
Issue
Vol. 37, Issue 4E (30 Sep. 2011), pp.27-36, 10 p.
Publisher
University of Basrah College of Education for Pure Sciences
Publication Date
2011-09-30
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
10
Main Subjects
Abstract AR
جمعت 480 براز من الأطفال دون سن ثلاث سنوات من الذكور و الإناث الراقدين و المراجعين إلى مستشفى النسائية و الأطفال التعليمي و كانوا يعانون من الإسهال.
أجريت الدراسة للمدة من تشرين الثاني 2008 و لغاية شهر تشرين الأول 2009.
تم عزل بكتيريا السالمونيلا من خلال الزرع البكتيري للعينات على أوساط زرعية أغنائئية و انتقائية و شخصت من خلال الاختبارات الكيموحيوية و استعمل Mini API20E و كنا تم استخدام اختبار باستعمال المصول المضادة أحادية التكافؤ.
استعملت تقنية التضاعفي لسلسلة الدنا (PCR) للكشف عن وجود الجين (fimA) المشفر للأهداب الخاصة بجنس السالمونيلا Salmonella spp.
و الجين (fimC) المشفر للأهداب الخاصة بالنمط S.
typhimurium.
أظهرت النتائج أن نسبة عزل بكتيريا السالمونيلا Salmonella spp.
من عينات براز الأطفال كانت % 7.9( 38 / 480)، إذ وجدت فروق معنوية عند مستوى احتمالية (P < 0.01) في نسبة العزل عند استخدام الطريقة المظهرية التقليدية و الجينية (PCR).
أظهرت نتائج التنميط المصلي لعزلات السالمونيلا باستعمال المصل المضاد أحادي التكافؤ أن 30 من أصل 34 عزلة جرثومية مختبرة (88 %) في الأطفال تعود إلى النمط المصلي S.typhimurium و عزلتين تعود إلى كل من S.
entritidis و S.
muenchen.
أظهرت تقنية ال PCR المفردة للكشف عن الجين المشفر لتصنيع الهدب (fimA) أن جيمع عزلات السالمونيلا تمتلك هذا الجين فقد ظهرت حزمة واحة ناتجة من عملية التضخيم ل DNA و كان حجمها 85 زوج قاعدي على هلام الاكاروز، فيما تبين من خلال الكشف عن الجين المشفر لتصنيع الهدب fimC إن 32 عزلة سالمونيلا تعود إلى S .typhimurium لاحتوائها على هذا الجين إذ ظهرت حزمة واحدة ناتجة من عملية التضخيم ل DNA و كان حجمها 257 زوج قاعدي.
كشفت نتائج هذه الدراسة إن تقنية PCR أظهرت نوعية (Specificity) عالية (100 %) في الكشف عن السالمونيلا S.
typhimurium ,(Salmonella spp.) مقارنة بالفحوصات الأخرى الزرعية و الكيموحيوية، فحص Mini API 20E و كذلك الفحوصات المصلية.
Abstract EN
A total of 480 fecal samples were collected from children under 3 years of age of both sexes, suffering from diarrhea who admitted to the Teaching Hospital of Maternity and Pediatrics, in Al-Diwaniya governorate from November 2008 till the end of October 2009.
Salmonella spp.
were isolated and identified using bacterial culturing on selective media, in addition to, biochemical, Mini API 20 E system and serotyping monovalent antisera.
Polymerase chain reaction (PCR) was used to detect fim A gene encoding for biosynthesis of fimbriae A of Salmonella spp., and fim C gene encoding for biosynthesis of fimbriae C of Salmonella typhimurium.
The results revealed that the rate of Salmonella isolates in fecal samples was (38 / 480) 7.9 %.
The results of serotyping Salmonella isolates by using monovalent antisera revealed that 30 out of 34 isolates that belong to S typhimurium, while the remain belongs to S.
enteritidis ( 2 isolates) and S.
menschen (2 isolate).
The PCR technique revealed that 34 isolates of Salmonella spp.
contained fim A gene DNA amplification showed one distinct band with molecular weight of 85 bp when electrophorised on agarose gel), while for fim C gene, 32 Salmonella isolates were S.
typhimurium appeared to contain this gene ( DNA amplification showed one distinct band with M.
Wt.
of 257 bp).The results of this study revealed that the PCR technique had a high specifity (100 %) in the detection of Salmonella spp., Salmonella typhimurium in comparison to culture and biochemical test, Mini API 20 E and serological tests.
American Psychological Association (APA)
Jawad, Ala Abd al-Kazim& al-Hamdani, Adnan Hamad Ubayd. 2011. Detection of fim A and fim C genes of salmonella isolates by using polymerase chain reaction. Journal of Basrah Researches : Sciences،Vol. 37, no. 4E, pp.27-36.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-285840
Modern Language Association (MLA)
Jawad, Ala Abd al-Kazim& al-Hamdani, Adnan Hamad Ubayd. Detection of fim A and fim C genes of salmonella isolates by using polymerase chain reaction. Journal of Basrah Researches : Sciences Vol. 37, no. 4E (Sep. 2011), pp.27-36.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-285840
American Medical Association (AMA)
Jawad, Ala Abd al-Kazim& al-Hamdani, Adnan Hamad Ubayd. Detection of fim A and fim C genes of salmonella isolates by using polymerase chain reaction. Journal of Basrah Researches : Sciences. 2011. Vol. 37, no. 4E, pp.27-36.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-285840
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 34-35
Record ID
BIM-285840
