Usage mitochondrial 16S r RNA gene as molecular marker in taxonomy of cyprinin fish species (cyprinidae : teleostei)
Other Title(s)
استخدام جين 16 S r RNA المايتوكندري كمؤشر جزيئي في تصنيف أنواع أسماك الشبوطيات من العائلة الثانوية cyprininae
Joint Authors
Faddagh, Mustafa Sami
Husayn, Najah Abbud
al-Badran, Adnan Isa
Source
Journal of King Abdul Aziz University : Marine Science
Issue
Vol. 23, Issue 1 (31 Mar. 2012), pp.39-49, 11 p.
Publisher
King Abdulaziz University Scientific Publishing Center
Publication Date
2012-03-31
Country of Publication
Saudi Arabia
No. of Pages
11
Main Subjects
Topics
Abstract AR
لتأكيد الحالة التصنيفية لسبعة أنواع أسماك الشبوطيات من العائلة الثانوية Cyprininae و هي : سمكة الكطان Batbus xanthopterus, و سمكة الجصان B.
kersin و سمكة النباش B.
barbulus, و سمكة الشبوط B.
grypus, و سمكة البني B.
sharpeyi و سمكة الحمري B.
luteus و سمكة الكارب الشائع Cyprinus carpio .
استخدمت قطعة جين 16 S r RNA المايتوكونيري كمؤشر جزيئي و تم تحوير بادئ ليتضمن قطعة محددة ب 120 زوج قاعدي.
فحص ناتج تضخيم الجين بتقنية PCR بترحيله كهربائياً على هلام الأكروز 2.0% و قدر حجم الحزم الظاهرة في الصورة باستخدام المسطرة الجزئية 100 زوج قاعدي و قد كان الارتباط عالياً حيث كانت قيمة معامل الإرتباط 0.99 < R2.
استجابت أنوع جنس Barbus الستة فضلاً عن الكارب الشائع للبادئ و أنتجت عملية التضخيم قطعة جين 120 زوج قاعدي.
بينما تبين في هلام الأكروز بأن سمكتي الخشني Liza Abu و سمكة البياح الأخضر Liza klunzingeri اللتان تعوادن إلى عائلة Mugilidae و اللذان استخدما كمجموعة خارجية من عائلة أخرى, و سمكة الشلك Asqiux vorax التي تعود إلى عائلة الشبوطيات ذاتها للعائلة الثانوية Leuciscinae كمجموعة خارجية من عائلة ثانوية أخرى لم تستجب للبادئ, في الوقت الذي استجابت فيه السمكة الذهبية Carassius auratus التي تعود إلى ذات العائلة الثانوية Cyprininae.
استنتجت الدراسة بأن الأنواع الستو من جنس Barbus كما هو الحال في الكارب الشائع عائدة إلى العائلة الثانوية Cyprininae.
Abstract EN
To confirm the taxonomical status of seven cyprinin fish species in Iraqi inland waters: Barbus xanthopterus, B.
kersin, B.
barbulus, B.
grypus, B.
sharpeyi, B.
luteus and Cyprinus carpio, the mitochondrial 16S rRNA gene fragment was used as a molecular marker.
The primer was modified to include limited 120 bp fragment.
PCR product tested on 2% agarose gel electrophoresis.
The size of bands was estimated using the 100 bp ladder, while the correlation between the size of 100 bp ladder bands and the migrated distance was high since the R2> 0.99.
Molecular profile of mtDNA 16S rRNA gene fragment appeared that the six Barbus species and Cyprinus carpio had responded similarly to the modified primer.
Whereas the second profile showed that the muglid Liza abu and Liza klunzingeri (used as out-group family) and leuciscin A.
vorax (out-group sub-family) did not respond to the modified primer but the cyprinin Carassius auratus responded and the marker band of 120 bp length proved that this species also belongs to sub-family Cyprininae.
American Psychological Association (APA)
Faddagh, Mustafa Sami& Husayn, Najah Abbud& al-Badran, Adnan Isa. 2012. Usage mitochondrial 16S r RNA gene as molecular marker in taxonomy of cyprinin fish species (cyprinidae : teleostei). Journal of King Abdul Aziz University : Marine Science،Vol. 23, no. 1, pp.39-49.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-301065
Modern Language Association (MLA)
al-Badran, Adnan Isa…[et al.]. Usage mitochondrial 16S r RNA gene as molecular marker in taxonomy of cyprinin fish species (cyprinidae : teleostei). Journal of King Abdul Aziz University : Marine Science Vol. 23, no. 1 (2012), pp.39-49.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-301065
American Medical Association (AMA)
Faddagh, Mustafa Sami& Husayn, Najah Abbud& al-Badran, Adnan Isa. Usage mitochondrial 16S r RNA gene as molecular marker in taxonomy of cyprinin fish species (cyprinidae : teleostei). Journal of King Abdul Aziz University : Marine Science. 2012. Vol. 23, no. 1, pp.39-49.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-301065
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 46-47
Record ID
BIM-301065
