STRs analysis of Y- chromosome among Arabian populations in Africa

Dissertant

Said, Milad al-Hadi

Thesis advisor

al-Mahasinah, Ihsan

Comitee Members

Jaran, Adnan S.
al-Mansi, Kamal
Shakhanbeh, Jumah Muti

University

Al albayt University

Faculty

Faculty of Sciences

Department

Department of Biological Sciences

University Country

Jordan

Degree

Master

Degree Date

2008

Arabic Abstract

العديد من جينات الـY كروموسوم تحتوي على محدادت الجنس الدكري، و التي تعتبر مساحة نشطة للعلماء المختصين.

كروموسوم Y : هو قطعه من الـ DNA، هذه القطع تعرف بالعلامات (Markers) و التي تحتوي على وحدات قصيرة من الـ DNA (عادة بين 3-7 قواعد) و هي تكون مكرره بشكل ثابت عدة مرات تعرف بالمقاطع القصيرة المتكررة (STRs).

تكرار الأليلات لدى المجتمعات العربية في أفريقيا يتراوح بين 25 % إلى 93.3 % بمعدل 59.4 % حيث تم حساب التشابه بين الأنماط (as conducted by Y Search Database configuration ) و هذا التشابه يتراوح بين 17.6 % إلى 82.3 % بمعدل 50 % و أعلى تشابه 82.3 % (يكون عند Eg2، Eg3، T2) و أقل تشابه 17.6 % عند (Ly3).

التشابه بين الأنماط لدى المجتمعات العربية في أفريقيا يتراوح بين 4 اليلات إلى 15 اليل لكل من الصومال و السودان على التوالي.

و في الخلاصة تم تحليل 33 عينة دم من دكور المجتمعات العربية في أفريقيا بـ 17 موقع على كروموسوم Y، و لوحظ وجود 33 نمط مختلف على النحو الأتي : 6 أنماط في ليبيا، 5 أنماط في مصر، 4 أنماط لكل من تونس، المغرب، الجزائر، السودان، 3 أنماط لكل من موريتانيا و الصومال.

تم إجراء التحليل الإحصائي (P-value) عند مستوى 0.05 > P للمقارنة بين متوسط القيمة لكل STR لكل دولة مع بقية الدول حيث وجد انه لا يوجد هناك فروق عند هذا المستوى بين كل دولة مع الدول الأخرى، و هذا يدل على أن معدل حدوث الطفرة لدى المجتمعات العربية في أفريقيا قليل جدا.

English Abstract

Many of the genes on Y-chromosome are involved in male sexual determination and development.

Identifying genes on each chromosome is an active area of genetic research.

The Y-chromosome is a segment of the DNA ; these segments are known as markers, which contain short units of DNA (usually 3 to 7 bases long), that are repeated in a tandem several times.

They are called microsatellites or short tandem repeats (STRs).

The frequency of the alleles in the Arabian population in Africa ranged from (22 %) to (96 %) with mean value of (59 %).

The allele similarity to the model haplotype (as conducted by Y Search Database configuration) ranged from (17.6 %) to (82.3 %) with the mean value of (50 %).The highest similarity (82.3 %) was for (Ly7 and Mu2) and lowest similarity (17.6 %) was for (Ly3).

The minimal haplotype in Arabian population in Africa ranged from (4 alleles matches) to (15 alleles matches) for Somali and Sudan respectively In conclusion, Fifty-one samples of the Arabian populations in African males were analyzed for 17 Y-STR loci, Fifty-one different haplotypes were observed.

which were distributed as follows : 16 haplotypes among Libyan, 5 haplotypes among Egyptian, 4 haplotypes among Mauritanian, 4 haplotypes among Tunisian, 4 haplotypes among Algerian, 11 haplotypes among Morocco, 4 haplotypes among Sudani, 3 haplotypes among Somali.

The P–value at the level of P ≤ 0.05 was determined for comparison purpose between the mean values of each STRs of each country with other countries.

There were no significant differences at (P ≤ 0.05) level between the mean of each STR for each country with others.

This indicates that the mutation rate among the Arabian countries population are less frequent as it is clear from the narrow range of the SD value for each marke.

Main Subjects

Biology

Topics

• Africa

No. of Pages

78

Table of Contents

• APA
• MLA
• AMA

Language

English

Data Type

Arab Theses

Record ID

BIM-302931