STR's analysis of Y-chromosome among southern districts of Jordan
Dissertant
Thesis advisor
Comitee Members
Irshaid, Fawzi
Shakhanbeh, Jumah Muti
al-Tarawinah, Khalid Ahmad
University
Al albayt University
Faculty
Faculty of Sciences
Department
Department of Biological Sciences
University Country
Jordan
Degree
Master
Degree Date
2009
Arabic Abstract
إن المقاطع القصيرة المتكررة (STRs) على الكروموسوم Y و الخاص بالذكور و الذي يستخدم في الدراسات الوراثية للإنسان.
لقد تم تحليل 17 موقع على الكروموسوم الذكري Y ما عدده مائه و ستون (160) عينة دم ذكورية و التي جمعت بشكل عشوائي من المستشفيات الحكومية و العسكرية و الموجودة في محافظات إقليم جنوب الأردن (معان-الكرك-الطفيلة-العقبة) ب17 موقع على الكروموسوم الذكريY.
حيث وجد أن تكرار الأليلات (Alleles) لدى هذا المجتمع تتراوح من 61 % إلى 89.6 %.
و كذلك وجدت قيم التنوع الجيني لكل من المقاطع القصيرة المتكررة تتراوح بين 20 % إلى 80 % بمعدل 67 % حيث تم حساب التشابه بين الأنماط حسب الموقع الالكتروني لقاعدة البيانات للكروموسوم الذكري وهذا التشابه يتراوح بين 6 % إلى 100 % بمعدل 65.1 %.
لقد تم إجراء التحليل الإحصائي (P-vslue) عند مستوى 0.05 > P للمقارنة بين متوسط القيمة لكل تكرار مقطع قصير من تكرارات محافظات إقليم جنوب الأردن مع كل من إقليم الشمال و الوسط حيث وجد انه لا يوجد هناك فروق عند هذا المستوى بين جميع أقاليم المملكة.
و قد تمت مقارنة نتائج التحليل لإقليم جنوب الأردن مع إقليم شمال و وسط الأردن حيث كان معدل التشابه مع عجلون % 100 و مع اربد % 75 و مع جرش % 25 و مع المفرق % 75 و مع عمان % 75 و مع الزرقاء % 50 و مع مأدبا % 50 و مع السلط 50.
و كذلك تمت مقارنتها مع دول الخليج العربي و سوريا و لبنان حيث كان معدل التشابه مع المملكة العربية السعودية % 75 و مع العراق % 75 و مع قطر % 100 و مع الكويت % 25 و مع الإمارات العربية المتحدة % 50 و مع البحرين % 50 و مع عمان % 100 و مع اليمن % 75 و مع سوريا % 50 و مع لبنان % 0.
و كذلك تمت مقارنتها مع الدول الأفريقية حيث كان معدل التشابه مع ليبيا % 75 و مع مصر % 75 و مع موريتانيا % 75 و مع تونس % 75 و مع الجزائر % 75 و مع المغرب % 100 و مع السودان % 100 و مع الصومال % 25.
English Abstract
The Short Tandem Repeats (STRs) found on the male-specific Y-chromosome and being used in human genealogy.
Seventeen Y-Chromosome Short Tandom Repeats loci (DYS456, DYS389i, DYS390, DYS389ii, DYS458, DYS19, DYS385a, DYS385b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392, TAGA H4, DYS437, DYS438, and DYS448) were analyzed in blood samples of 160 unrelated males which were collected freshly and randomly from the governmental hospitals from the Southern Districts of Jordan (Ma'an, Karak, Tafila, Aqaba). The frequency of the alleles among Southern Districts of Jordan ranged from 0.61 to 89.6.
The genetic diversity values for each Y- chromosome STRs ranged from a minimum of 0.2 to a maximum of 0.8 The minimal haplotype (calculated manually ≥ 75 %) is composed of four STR's which were observed in the Southern Districts samples equivalent to most commonly loci which would be appear at this order, DYS392, DYS437, DYS438 and DYS439, ranged from a minimum of 75.5 % for (DYS439), 82.4 % for (DYS438), 87.5 % for (DYS437), 89.7 % for (DYS392), with mean value equal 83.8 %.
The similarity of our result to other Districts of Jordan is in the following Order : Ajloun (100 %), Irbid (75 %), Jarash (25 %), Mafraq (75 %), Amman (75 %), Zarqa (50 %), Madaba (50 %), and Salt (50 %).
The similarity of our result to other regional countries is in the following order: (Saudi Arabia (75 %), Iraq (75 %), Qatar (100 %), Kuwait (25 %), and United Arab Emirates (50 %) Bahrain (50 %), Oman (100 %), and Yemen (75 %), Syria (50 %), Lebanon (0 %), Libya (75 %), Egypt (75 %),) Mauritania (75 %), Tunis (75 %), Algeria (75 %) Morocco (100 %), Sudan (100 %),) Somali (25 %).
Main Subjects
Topics
No. of Pages
89
Table of Contents
Table of contents.
Abstract.
Chapter one : Literature review.
Chapter two : Materials and methods.
Chapter three : Result and discussion.
References.
American Psychological Association (APA)
Zurayqat, Qusayy Husayn Qasim. (2009). STR's analysis of Y-chromosome among southern districts of Jordan. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Al albayt University, Jordan
https://search.emarefa.net/detail/BIM-302962
Modern Language Association (MLA)
Zurayqat, Qusayy Husayn Qasim. STR's analysis of Y-chromosome among southern districts of Jordan. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Al albayt University. (2009).
https://search.emarefa.net/detail/BIM-302962
American Medical Association (AMA)
Zurayqat, Qusayy Husayn Qasim. (2009). STR's analysis of Y-chromosome among southern districts of Jordan. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Al albayt University, Jordan
https://search.emarefa.net/detail/BIM-302962
Language
English
Data Type
Arab Theses
Record ID
BIM-302962