Polymerase chain reaction amplification of the ITS-1 region and sequencing of the amplified products of most pathogenic Aspergillus spp. (A.fumigatus, A.flavus & A.niger)
Other Title(s)
تطبيق اختبار البلمرة المتسلسل لتكبير منطقة الأي تي اس و سلسلة المنتج من التفاعل لأكثر أنواع الأسبراجلس المسببة للأمراض (أسبراجلس فيوماجيتس- فلافس-نيجر)
Joint Authors
Khafaji, Ahmad Ahmad Rifat
Eidarus, Nada Husayn
Anani, Muhammad al-Sayyid
Source
Suez Canal Veterinary Medicine Journal
Issue
Vol. 17, Issue 1 (30 Jun. 2012), pp.1-8, 8 p.
Publisher
Suez Canal University Faculty of Veterinary Medicine
Publication Date
2012-06-30
Country of Publication
Egypt
No. of Pages
8
Main Subjects
Topics
Abstract AR
تحتوي منطقة الأي تي اس على متغيرات كثير تسمح بتحديد أنواع الأسبراجلس عن طريقة التسلسل.
في هذه الدراسة تم الحصول على ناتج من عملية البلمرة المتسلسل وزنه الجزيئي 521 من 6 عينات تم عزلها من آفات حبيبية على رئات بعض الدجاج و تم تصنيفها بالطرق التقليدية إلى اسبراجلس فيوماجيتس و فلافس و نيجر و تيرريس باستخدام بريمر أو بادئ لتكبير منطقة الأي تي اس.
تم عمل سلسلة لثلاثة من نواتج عملية البلمرة المتسلسل و تم موائمة النتائج مع المنشورة على بنك الجينات و أعطت أول عينة موائمة مع الاسبراجلس فيوماجيتس و ثاني عينة مع الاسيراجلس فلافس و الاسبراجلس نيجر و أعطت ثالث عينة موائمة مع الاسبراجلس نيجر فار فيشيم.
تم عمل تحليل الفيلوجوني و قد خلصت النتائج إلى أن درجة التشابه بين كل من اسبراجلس فيوماجيتس و فلافس و نيجر في منطقة الأي تي اس أقل من 50 % و بذلك يمكننا استنتاج أهمية هذه المنطقة في التفريق بين الأنواع المختلفة من الاسبراجلس.
Abstract EN
The internal transcribed spacer region (ITS) contain variable elements that allow sequence-based identification of genus Aspergillus.
In this study, a PCR products of 521 b.p.
were successfully amplified from 6 Aspergillus spp.
isolated from granulomatous lesions of lungs of chickens which were identified by traditional methods to A.fumigatus (2), A.flavus (1) , A.niger (2) and A.terreus (1) with pan Aspergillus primer for amplification of the ITS1 region.
Three PCR products of A.fumigatus, A.flavus and A.niger were sequenced and the results were aligned with the sequences published on the gene bank.
The first sample gave alignment with A.fumigatus, 2nd sample gave alignment with A.flavus and A.oryzae and the 3rd sample gave alignment with A.niger var ficuum.
The phyelogenetic analysis revealed that the degree of similarity between the isolated strains of A.niger, A.flavus and A.fumigatus was less than 50 % so, we could conclude that the importance of ITS-1 region sequence to distinguish between the different Aspergillus species.
American Psychological Association (APA)
Khafaji, Ahmad Ahmad Rifat& Anani, Muhammad al-Sayyid& Eidarus, Nada Husayn. 2012. Polymerase chain reaction amplification of the ITS-1 region and sequencing of the amplified products of most pathogenic Aspergillus spp. (A.fumigatus, A.flavus & A.niger). Suez Canal Veterinary Medicine Journal،Vol. 17, no. 1, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-316447
Modern Language Association (MLA)
Khafaji, Ahmad Ahmad Rifat…[et al.]. Polymerase chain reaction amplification of the ITS-1 region and sequencing of the amplified products of most pathogenic Aspergillus spp. (A.fumigatus, A.flavus & A.niger). Suez Canal Veterinary Medicine Journal Vol. 17, no. 1 (2012), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-316447
American Medical Association (AMA)
Khafaji, Ahmad Ahmad Rifat& Anani, Muhammad al-Sayyid& Eidarus, Nada Husayn. Polymerase chain reaction amplification of the ITS-1 region and sequencing of the amplified products of most pathogenic Aspergillus spp. (A.fumigatus, A.flavus & A.niger). Suez Canal Veterinary Medicine Journal. 2012. Vol. 17, no. 1, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-316447
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 6-7
Record ID
BIM-316447