Conventional and molecular typing of salmonella enterica serotype typhi locally isolated In Baghdad
Other Title(s)
دراسة التنميط الجيني و التنميط المظهري لبكتريا Salmonella enterica serotype Typhi في بغداد
Joint Authors
Salih, Wafa Hazim
Faiq, Ashna Jamal
Latif, Kawthar Riyad
Source
Issue
Vol. 9, Issue 4 (31 Dec. 2012), pp.632-639, 8 p.
Publisher
University of Baghdad College of Science for Women
Publication Date
2012-12-31
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
8
Main Subjects
Topics
Abstract AR
أجريت هذه الدراسة لإيجاد مميزات التنميط المظهري و التنميط الجيني لـ 29 عزلة لبكتيريا Salmon ellaenterica serotype Typhi جمعت في عام 2007.
شمل التنميط المظهري : التنميط الحيوي (Biotype) و التنميط للمضادات الحياتية.
التنميط الجيني و قد شمل : المحتوى البلازميدي (plasmid content) و استخدم إحدى مؤشرات الدنا (DNA Markers) المعتمدة على الـ PCR و هي مؤشرات التفاعل التضاعفي العشوائي المتعدد الأشكال لسلسلة الدنا أو الـ Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) حيث اختير لهذا الغرض بادئان (primer) لتحديد الحزم المتباينة Polymorphic bands.
أظهرت الفحوص الكيموحياتية للسالمونيلا التايفي 29 (% 100) تحت نمط واحد باستعمال نظام API-20E اعتمادا على قابلية البكتيريا لاختزال مجموعة الكربوكسيلية لـ لايسين و كان جميعها (+) و اعتمادا على حساسية العزلات للمضادات الحياتية, وجد أن 29 (% 100) عزلة كانت حساسة لجميع مضادات الحياة المستعملة.
كذلك عند استخدام الترحيل الكهربائي لل DNA البلازميدي حيث أظهرت جميع العزلات المدروسة عدم امتلاكها للبلازميدات، عند إجراء التجارب الأولية لإيجاد الظروف المثلى لتفاعلات الـ PCR باستخدام دنا القالب و البادئات تم الكشف عن التباينات بين القطع المتضاعفة كلك عزلة (أعدادها و أحجامها الجزيئية) عند ترحيل نواتج التضاعف للعينات على هلامم الاكاروز بعد تصبيغها ببروميد الاثيديوم.
أعطت النتائج RAPD-PCR عند استخدام لبادئ 784 ستة أنماط جينية مختلفة و عند استخدام البادئ 787 أظهرت النتائج أربعة أنماط جينية مختلفة.
لم يظهر التنميط المظهري و كذلك تحليل المحتوى البلازمي (plasmid profile) إمكانية التفريق بين العزلات لغرض المقارنة و تحديد الأنماط بين العزلات المدروسة.
بينما أظهرت طريقة RAPD-PCR وجود القدرة التمييزية لتحديد الأنماط الجينية بين العزلات المدروسة و بهذا أثبتت هذه الطريقة فاعليتها كوسيلة تنميط وبائية مقارنة بالطرق الأخرى مثل التنميط الحيوي (Biotype) و التنميط للمضادات الحياتية و طريقة الكشف على المحتوى البلازميدي.
Abstract EN
Phenotypic And genotypic characteristics of Salmonella enterica serotype Typhi have been determined for 29 isolates, from Baghdad in 2007.
Conventional typing methods were performed by biochemical tests, and antimicrobial susceptibility test.
Molecular typing performed by analysis plasmid DNA beside using the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD-PCR).
For the latter, two universal primers that have selected for the high discriminatory power were used for RAPD analysis.
All isolates were belong one biotype according to the different ion by their ability to decarboxylat lysine, 29 (100 %) were lysine (+).
All the isolates were susceptible to the Antibiotics used.
However, all the strains free of plasmids.
RAPD was capable of grouping the strains in 6 genotypic patterns using primer 784, in 4 genotypic patterns using primer 787.
Conventional phenotypic typing methods, as well as the DNA plasmid analysis, presented non-significant discriminatory power; however, RAPD-PCR analysis showed discriminatory power, reproducibility, and easy interpretation and can be considered as a promising alternative typing method for S.
Typhi.
American Psychological Association (APA)
Faiq, Ashna Jamal& Salih, Wafa Hazim& Latif, Kawthar Riyad. 2012. Conventional and molecular typing of salmonella enterica serotype typhi locally isolated In Baghdad. Baghdad Science Journal،Vol. 9, no. 4, pp.632-639.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-316683
Modern Language Association (MLA)
Latif, Kawthar Riyad…[et al.]. Conventional and molecular typing of salmonella enterica serotype typhi locally isolated In Baghdad. Baghdad Science Journal Vol. 9, no. 4 (2012), pp.632-639.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-316683
American Medical Association (AMA)
Faiq, Ashna Jamal& Salih, Wafa Hazim& Latif, Kawthar Riyad. Conventional and molecular typing of salmonella enterica serotype typhi locally isolated In Baghdad. Baghdad Science Journal. 2012. Vol. 9, no. 4, pp.632-639.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-316683
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 636-638
Record ID
BIM-316683
