Modifying plaque assay and clearance test as tools in determination of phage typing for E. coli bacterial interspecies

Other Title(s)

طريقة تبقع الفاج المحورة و فحص الشفافية كأدوات في تحديد نمط الفاج لبكنيريا اي كولاي تحت الأنواع

Author

Muhammad, Muhammad Abd al-Rahman

Source

Baghdad Science Journal

Issue

Vol. 10, Issue 1 (31 Mar. 2013), pp.161-167, 7 p.

Publisher

University of Baghdad College of Science for Women

Publication Date

2013-03-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

7

Main Subjects

Biology

Topics

Abstract AR

فاجات بكتريا تحت النوع اي كولاي من عينات مياه المجاري، العينة الأولى جمعت من عينة مياه الجاري لجامعة بغداد و العينة الثانية أخذت من مياه مجاري منزلية، العينة الأولى كانت تحتوي على ثلاث أنواع فاجات خاصة لل اي كولاي لتحت أنواع مختلفة (الطبق الأول) و نوعين لفاجات ال اي كولاي لتحت النوع (الطبق الثاني)، بينما العينة الثالثة كانت تحتوي كذلك فاجين خاص لل اي كولاي دراسة مظهر فاجات بكتريا ال اي كولاي من العينة الأولى كانت تحتوي على ثلاث أنواع من الفاجات مع أحجام مختلفة لحلقات تثبيط (1، 0.5، 0.7) سنتمتر للطبق الأول، بينما فاجات ال اي كولاي كانت تحوي نوعين من حلقات التثبيط (0.5، 0.4) سنتمتر (الطبق الثاني) و كذلك أظهرت العينة الثانية نوعين من اي كولاي معى حلقة تثبيط (1، 0.8) نحن صممنا تجربة و التي عرضت طريقة محورة لتحليل الفاج لتحدد (نوع البكتريا باستخدام الفاج) تنميط الفاج من مصادر مختلفة بينما المحلول القياسي تمثل بمضيف المتمثل ببكتريا التي عزل منها الفاج.

و من خلال قياس الكثافة الضوئية لكل من الفحوصات و المحلول القياسي يتم تحديد نوع البكتريا و عائدتها إلى فاج معين أو لا و هذا الفحص سمي (فحص الشفافية).

النتائج عرضت الكثافة الضوئية للفحوص 3، 2، 1 كانت (1.6،1.2،1.7) لبكتريا ال اي كولاي و الشكلا و السريشيا بينما أظهرت نتائج الضابطة النسب التالية (0.3، 0.2، 0.4) للأنماط المعزولة من العينة الأولى (الطبق الأول و الطبق الثاني) و العينة الثانية بأنماط مختلفة على التوالي من النتائج تبين وجود خصوصية عالية لتنميط الفاج للبكتريا المختلفة و منه نستطيع أن نقيس نسبة الشفافية للبكتريا باستخدام فاجات مختلفة و ممكن أن يعوض طريقة الأطباق.

Abstract EN

Bacteriophage of E.

Coli interspecies from sewage samples were isolated , the phage particles were isolated from two different sewage samples .

The first sample was collected from sewage sample of Baghdad university and the second sample was isolated from domestic sewage sample , first sample showed phages specialized for three E.

Coli interspecies bacteria (first plate ) and two E.

Coli interspecies bacteria (second plate ) , meanwhile second sample showed phage specialized for two E.

Coli.

interspeciesThe study of appearance of E coli phages from first sample showed three types of E.

coli phages with different size of inhibition zone ( 1 , 0.7,0.5 )Cm respectively ( first plate ) , meanwhile E.

Coli interspecies bacteria showed phages related with two interspecies with size of inhibition zone ( 0.5 ,0.4) Cm respectively ( second plate ), on other hand , the second sample showed also two interspecies E.

coli with inhibition zone (1,0.8)Cm .

experimental method has been designed which showed the modifying method of phage assay to determine phage typing assay .

phage has been tested particles with different bacterial strains ( E.

coli , shagilla and Serratia ) from different sources and the control was the host of each bacteriophages by taking the O.D for all the tests and controls , to setup new criteria for phage typing .:and this test is called ( Clearance Test ) The result showed that O.D for Test 1 , 2 , 3, was ( 1.6 , 1.2 .

1.7) for ( E.

coli , shagilla and Serratia ) bacterial strains , meanwhile the control tests was ( 0.3 , 0.2, 0.4 ) for strains isolated from first sample (first and second plate ) and second samples with different interspecies respectively .

This result can predict high specificity of phage strain and this method can be used to determine interspecies strains .So from this experiment we can identify only Clearance Test by measuring only O.D.

of bacterial strain with different phages instead of going through plaque assay .

American Psychological Association (APA)

Muhammad, Muhammad Abd al-Rahman. 2013. Modifying plaque assay and clearance test as tools in determination of phage typing for E. coli bacterial interspecies. Baghdad Science Journal،Vol. 10, no. 1, pp.161-167.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-323575

Modern Language Association (MLA)

Muhammad, Muhammad Abd al-Rahman. Modifying plaque assay and clearance test as tools in determination of phage typing for E. coli bacterial interspecies. Baghdad Science Journal Vol. 10, no. 1 (2013), pp.161-167.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-323575

American Medical Association (AMA)

Muhammad, Muhammad Abd al-Rahman. Modifying plaque assay and clearance test as tools in determination of phage typing for E. coli bacterial interspecies. Baghdad Science Journal. 2013. Vol. 10, no. 1, pp.161-167.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-323575

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 165-166

Record ID

BIM-323575