Expression of xylose reductase enzyme from spathaspora passalidarum in saccharomyces cerevisiae

Other Title(s)

كلونة و تعبير إنزيم Xylose Reductase من passalidarum في Saccharomyces cerevisiae

Joint Authors

al-Jilawi, Majid Husayn
Mamuri, Yasin Ismail
Yahya, Abd al-Ghani Ibrahim

Source

Iraqi Journal of Science

Issue

Vol. 54, Issue 2 (30 Jun. 2013), pp.316-323, 8 p.

Publisher

University of Baghdad College of Science

Publication Date

2013-06-30

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

8

Main Subjects

Biology

Abstract AR

خميرة الخبز Saccharomyces cerevisiae حورت وراثيا لتخمر الزايلوز السكر الخماسي الموجود في الكتلة الحيوية اللكنوسيليلوزية.

أحد التفاعلات المسيطرة على استغلال الزايلوز يتم بواسطة إنزيم Xylose Reductase.

الدراسة الحالية توصف إنزيم Xylose Reductase من Spathaspora passalidarum مع تفضيل لل NADH.

طبقا لموقع jGl فإن الجين المشفر لهذا الإنزيم يحتوي 954 قاعدة نايتروجينية و يحتوي على 317 حامض أميني.

صممت مواقع القطع للأنزيمين SacII و NotI الواقعة في الطرف النهائي 5 لكل من البادئ الأمامي و الخلفي بواسطة برنامج Lasergen 9.0.

عزل الدنا الجينومي و نقي من S.

passalidarum.

ضخم هذا الجين بواسطة PCR.

كلون الجين المضخم في البلازميد pSN303 لينتج البلازميد pYIM1 و حول إلى بكتيريا Escherichia coli.

عزل البلازميد مرة أخرى من E.coli و حدد تعاقبع و أخيرا حول إلى S.

cerevisiae.

المتحولات التي تحمل البلازميد pYIM1 سميت YJTY1.

الفعالية النوعية للإنزيم كانت 1.55 و 0.48 وحدة / ملغم على NADH و NADPH على التعاقب للسلالة YJTY1.

هذا الإنزيم له تفضيل طبيعي ل NADH الذي يجعله مرشح جيد لمزجه مع xylitol dehydrogenase المعتمد على NAD+ الذي يمكن أن يجعل S.

cerevisiae قادرة على استغلال الزايلوز في الظروف اللاهوائية و تحويله إلى ايثانول.

Abstract EN

Baker’s yeast (Saccharomyces cerevisiae) has been genetically engineered to ferment the pentose sugar xylose present in lignocellulosic biomass.

One of the reactions controlling the rate of xylose utilization is catalyzed by xylose reductase (XR).The current study describes xylose reductase from Spathasporapassalidarum with NADH preference.

According to JGI site the gene coding for this enzyme contains 954 nucleotides and it consists of 317 amino acids.

The restriction sites for the enzymes SacII and NotI located on the 5P P termini for both the forward and reverse specific primers were designed using Lasergen 9.0 program.

The genomic DNA was isolated and purified from S .passalidarum.

Polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify this gene.

The amplified gene was cloned into pSN303 plasmid resulting of the pYIM1 plasmid and then transformed into Escherichia coli.

This plasmid was reisolated from E.

coli, sequenced, and finally transformed into S.

cerevisiae.

The yeast transformants carrying pYIM1 plasmid named YJTY1.

The specific activity of enzyme was 1.55 and 0.48 U / mg on NADH and NADPH respectively for YJTY1.

This enzyme has a natural preference for NADH which makes it a good candidate for combination with NADP + Pdependent xylitol dehydrogenase which may enable S.

cerevisiae to utilize xylose under anaerobic conditions and convert it to ethanol.

American Psychological Association (APA)

Mamuri, Yasin Ismail& Yahya, Abd al-Ghani Ibrahim& al-Jilawi, Majid Husayn. 2013. Expression of xylose reductase enzyme from spathaspora passalidarum in saccharomyces cerevisiae. Iraqi Journal of Science،Vol. 54, no. 2, pp.316-323.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-336924

Modern Language Association (MLA)

Mamuri, Yasin Ismail…[et al.]. Expression of xylose reductase enzyme from spathaspora passalidarum in saccharomyces cerevisiae. Iraqi Journal of Science Vol. 54, no. 2 (2013), pp.316-323.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-336924

American Medical Association (AMA)

Mamuri, Yasin Ismail& Yahya, Abd al-Ghani Ibrahim& al-Jilawi, Majid Husayn. Expression of xylose reductase enzyme from spathaspora passalidarum in saccharomyces cerevisiae. Iraqi Journal of Science. 2013. Vol. 54, no. 2, pp.316-323.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-336924

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 322-323

Record ID

BIM-336924