Genetic characteristics of Egyptian Buffalo using DNA microsatellite markers

Other Title(s)

التوصيف الوراثى للجاموس المصرى باستخدام واسمات التوابع الدقيقة

Joint Authors

Atiyyah, Muhammad A.
Makkawi, Wajdi
Abu Bakr, Sami
Abd al-Salam, Samih Abd al-Fattah Muhammad
Hafiz, Yasin Muhammad
Ibrahim, Muhammad Abd al-Aziz Muhammad

Source

Egyptian Journal of Animal Production

Issue

Vol. 49, Issue 2 (31 May. 2012), pp.121-126, 6 p.

Publisher

Egyptian Society of Animal Production

Publication Date

2012-05-31

Country of Publication

Egypt

No. of Pages

6

Main Subjects

Zoology

Topics

Abstract AR

لتقييم تعدد المظاهر الوراثية لعدد من واسمات التوابع الدقيقة في الجاموس المصري، تم الفحص الوراثي لعدد 471 من الجاموس المصري ليس بينها قرابة باستخدام عدد 11 من واسمات التوابع الدقيقة.

تم تحليل البيانات باستخدام برنامج الـ GeneAlex.

أشارت النتائج أن تسعة (82 %) من واسمات التوابع الدقيقة كانت متعددة المظاهر الوراثية و أن اثنين (18 %) منها كانت أحادية المظاهر الوراثية.

تم تحديد عدد 198 أليل، و تراوح عدد الأليلات لكل واسم من الواسمات ما بين 17 (RM28, BM415) إلى 29 (BMC4203) حيث كان المتوسط العام للأليلات لكل واسم وراثي هو 1.302±22 .

العدد الفعال للأليلات كان أقل من القيمة الملحوظة بمتوسط 1.137±16.502 لكل واسم وراثي.

تراوحت تكرارات الأليلات الأكثر تكرارا في العشيرة ما بين 0.086 (BMC4203) إلى 0.127 (BM415).

تراوح متوسط قيمة التجانس الملحوظ و المتوقع ما بين 0.113 و 0.063، على الترتيب.

بينما تراوح متوسط عدم التجاسن و الملحوظ و المتوقع بين 0.887، 0.937 على الترتيب.

تراوح قيمة تعدد المظاهر بين 0.909 (BM415) إلى 0.949 (ILSTS093, ILST097) كان متوسط دليل التثبيت لتسعة من واسمات التوابع الدقيقة 0.052.

أشار نجاح التوصيف الوراثي للجاموس المصري باستخدام واسمات التوابع الدقيقة إلى إمكانية استخدامها في التحليل الوراثي للجاموس المصري.

Abstract EN

Unrelated Egyptian buffalo were genotyped with 11 microsatellite markers.

The data were analyzed with GenALEx6 software.

Nine (82 %) of the microsatellite markers were polymorphic and two (18 %) were monomorphic.

A total 198 alleles were detected, with the number of alleles per marker ranging from 17 (RM28 and BM415) to 29 (BMC4203), giving a mean number of 22 ± 1.302 alleles per marker.

The effective number of alleles was lower than the observed values with a mean value of 16.502 ± 1.137 per marker.

The most frequent alleles were ranged from 0.086 (BMC4203) to 0.127 (BM415).

The mean observed and expected homozygosis was 0.113 and 0.063, respectively, while the observed and the expected heterozygosis was 0.887 and 0.937, respectively, over all loci.

Polymorphism information content values were ranged from 0.909 (BM415) to 0.949 (ILSTS093 andILSTS097).

At the nine microsatellite loci, the mean of fixation index was 0.052.

Successful genotyping of Egyptian buffalo using these DNA microsatellite markers suggests that the latter can be a valuable resource for genome analysis in Egyptian buffalo.

American Psychological Association (APA)

Abu Bakr, Sami& Ibrahim, Muhammad Abd al-Aziz Muhammad& Hafiz, Yasin Muhammad& Atiyyah, Muhammad A.& Abd al-Salam, Samih Abd al-Fattah Muhammad& Makkawi, Wajdi. 2012. Genetic characteristics of Egyptian Buffalo using DNA microsatellite markers. Egyptian Journal of Animal Production،Vol. 49, no. 2, pp.121-126.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-346714

Modern Language Association (MLA)

Abu Bakr, Sami…[et al.]. Genetic characteristics of Egyptian Buffalo using DNA microsatellite markers. Egyptian Journal of Animal Production Vol. 49, no. 2 (May. 2012), pp.121-126.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-346714

American Medical Association (AMA)

Abu Bakr, Sami& Ibrahim, Muhammad Abd al-Aziz Muhammad& Hafiz, Yasin Muhammad& Atiyyah, Muhammad A.& Abd al-Salam, Samih Abd al-Fattah Muhammad& Makkawi, Wajdi. Genetic characteristics of Egyptian Buffalo using DNA microsatellite markers. Egyptian Journal of Animal Production. 2012. Vol. 49, no. 2, pp.121-126.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-346714

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes appendices : p. 125-126

Record ID

BIM-346714