Defining a mutational panel and predicting the prevalence of cystic fibrosis in Oman

Other Title(s)

تحديد قائمة للطفرات الوراثية و تقدير انتشار التليف الكيسي في عمان

Joint Authors

Heming, Thomas
Fass, Uwe W.
al-Sulaymani, Majid
Bendahhou, Said
Shivalingam, Ganji
Norrish, Catherine
Hebal, Kallesh
Clark, Fiona
al-Khusaibi, Salih

Source

Sultan Qaboos University Medical Journal

Issue

Vol. 14, Issue 3 (31 Aug. 2014), pp.323-329, 7 p.

Publisher

Sultan Qaboos University College of Medicine and Health Sciences

Publication Date

2014-08-31

Country of Publication

Oman

No. of Pages

7

Main Subjects

Medicine

Topics

Abstract AR

الهدف : تشكل الطفرات الوراثية للبروتين المنظم للتوصيل عبر الغشائي لمرض التليف الكيسي (CFTR) قوائما محددة في الشعوب و المجموعات المختلفة.

لا تعرف نسبة الطفرات الوراثية للتليف الكيسي في عمان.

هدفت هذه الدراسة لتحديد قائمة الطفرات الوراثية و نسبة انتشار التليف الكيسي في محافظة شمال الباطنة بعُمان، و كذلك تقدير نسبة انتشار التليف الكيسي على المستوى الوطني عن طريق المسح الاستقصائي عن الحاملين للخلل الوراثي من المتطوعين الذين لا تربطهم صلة قرابة ببعضهم.

الطريقة : تضمنت الدراسة تحليلا رجعيا و تتابعيّا لحالات مرض التليف الكيسي في شمال الباطنة خلال الفترة من 1998 إلى 2012 ميلادي.

تم عمل التحليل الجيني للطفرات الوراثية المسببة للمرض عن طريق المسح الكامل للسلسلة الجينية المنتجة للبروتين و السلاسل في أطراف الإكسونات و الإنترونات.

استخدمت القائمة المستخلصة للطفرات الوراثية في البحث الاستقصائي عن الحاملين لهذه الطفرات في عدد 408 أليلات من أشخاص غير متأثرين بالمرض و لا تربطهم صلة قرابة ببعضهم.

النتائج : كانت الطفرتان S549R و F508del السائدتين، و مثّلتا نسبة 89 % من الطفرات الوراثية في مجموعة المرضى.

كما وجدت طفرتان وراثيتان منعزلتان في مجموعة المرضى ؛ و هما c.1733-1734 delTA و c.1175T>G.-وجدت الطفرتين S545R و F508del في عدد اثنين من مجموعة المتطوعين، معطيا بذلك نسبة للانتشار تقدر بـ 1 من 8.264 بينما بلغت النسبة التقديرية لحاملي التليف الكيسي في عمان 1 من 94.

كانت نسبة الحاملين في محافظة شمال الباطنة أعلى بـ 3.9 مرات من باقي السلطنة.

الخلاصة : المقدار الكبير للطفرة الوراثية S545R في محافظة شمال الباطنة و عدد الطفرات الأخرى يؤكدان الحاجة لعمل مسح استقصائي محدد للتليف الكيسي في عُمان.

اختلاف توزيع نسبة الأليلات في عمان يشير لتمركز جغرافي أكبر للتليف الكيسي في محافظة شمال الباطنة.

Abstract EN

-Objectives: Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) mutations form distinct mutational panels in different populations and subgroups.

The frequency of cystic fibrosis (CF) mutations and prevalence are unknown in Oman.

This study aimed to elucidate the mutational panel and prevalence of CF for the North Al Batinah (NAB) region in Oman and to estimate the national prevalence of CF based on the carrier screening of unrelated volunteers.

Methods: The study included retrospective and prospective analyses of CF cases in the NAB region for 1998–2012.

Genetic analysis of disease-causing mutations was conducted by screening of the entire coding sequence and exon-intron borders.

The obtained mutational panel was used for the carrier screening of 408 alleles of unrelated and unaffected Omani individuals.

Results: S549R and F508del were the major mutations, accounting for 89% of mutations in the patient population.

Two private mutations, c.1733-1734delTA and c.1175T>G, were identified in the patient cohort.

Two carriers, one for F508del and another for S549R, were identified by screening of the volunteer cohort, resulting in a predicted prevalence for Oman of 1 in 8,264.

The estimated carrier frequency of CF in Oman was 1 in 94.

The carrier frequency in the NAB region was 3.9 times higher.

Conclusion: The mutational panel for the NAB region and the high proportion of S549R mutations emphasises the need for specific screening for

American Psychological Association (APA)

Fass, Uwe W.& al-Sulaymani, Majid& Bendahhou, Said& Shivalingam, Ganji& Norrish, Catherine& Hebal, Kallesh…[et al.]. 2014. Defining a mutational panel and predicting the prevalence of cystic fibrosis in Oman. Sultan Qaboos University Medical Journal،Vol. 14, no. 3, pp.323-329.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-392423

Modern Language Association (MLA)

Fass, Uwe W.…[et al.]. Defining a mutational panel and predicting the prevalence of cystic fibrosis in Oman. Sultan Qaboos University Medical Journal Vol. 14, no. 3 (Aug. 2014), pp.323-329.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-392423

American Medical Association (AMA)

Fass, Uwe W.& al-Sulaymani, Majid& Bendahhou, Said& Shivalingam, Ganji& Norrish, Catherine& Hebal, Kallesh…[et al.]. Defining a mutational panel and predicting the prevalence of cystic fibrosis in Oman. Sultan Qaboos University Medical Journal. 2014. Vol. 14, no. 3, pp.323-329.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-392423

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 328-329

Record ID

BIM-392423