Cell growth simulation (CGS)‎ : the simulator

Other Title(s)

نظام محاكاة نمو الخلايا : اللمحاكي

Joint Authors

Abid, Siraj Yusuf
Ozkul, Uthman Shadi
al-Idrisi, Mustafa Muhammad
al-Asuli, Sufyan
Amir, Majid

Source

Journal of King Abdulaziz University : Engineering Sciences

Issue

Vol. 10, Issue 1 (31 Mar. 1998), pp.27-41, 15 p.

Publisher

King Abdulaziz University Scientific Publishing Center

Publication Date

1998-03-31

Country of Publication

Saudi Arabia

No. of Pages

15

Main Subjects

Biology

Abstract AR

نظام محاكاة نمو الخلايا هو عبارة عن مجموعة برمجيات تحاكي نمو الخلايا في المزارع الخلوية، و يمكن لهذا النظام محاكاة تأثير كثير من العوامل كالعقاقير على هذه الخلايا.

و هو نظام محاكاة عشوائي Stochastic system، يعتمد أساسا على حركيات الدورة الخلوية.

و يمكن لهذا النظام محاكاة العديد من التجارب، مثل تجارب تكوين الدنا (DNA)، إيقاف أو إحصار الإنقسام الخلوي الفتيلي، و كذلك تجارب تشعيع الخلايا أو قتلها.

و يتم ذلك من خلال محاكاة إضافة العقاقير ذات التأثيرات المختلفة مثل الثيميدين، وافيديكولين، و هيدركسي يوريا، و فنكرستين، و فنبلستين، و الكولسيميد إلى الخلايا.

و تتم المحاكاة عن طريق وصف المستخدم للتجربة طبقا للافتراضات النظرية، و حسب مرثياته الموضوعية للتجربة.

و يوفر هذا النظام للمستخدم عدة تسهيلات تمكنه من وصف التجربة، و من ثم فحص نتائجها.

و يتعامل المستخدم مع هذا النظام من خلال قوائم في شاشات مختلفة تعرض على المستخدم بطريقة أوتوماتيكية، و جميعها موجودة على حاسب شخصي من نوع AT مزود بأسطوانة صلبة.

و تركز هذه الدراسة على شرح وحدات المحاكي (Simulator modules) في هذا النظام، و التي تم تصميمها بناء على وقوع الأحداث، و بحيث تتبع دورة حياة كل خلية في المزرعة.

كما تقوم هذه الدراسة أيضا بشرح التركيب العام المحاكي، و الأحداث و خصائصها، و تصميم سلاسل الأحداث، و تجهيز المزرعة، بالإضافة إلى شرح عملية محاكاة نضوج (بلوغ) الخلايا، و عملية تكوين الدنا (DNA).

هذا إلى جانب شرح عملية تجميع البيانات الإحصائية عن التجارب التي يتم محاكاتها.

Abstract EN

Cell Growth Simulation (CGS) is a software package that simu- lates the growth of cultured cells, and the effects of different types of agents on the cell populations in vitro.

It is a stochastic simulation system and is based on the cell cycle kinetics.

Experiments involving DNA synthesis, block- ing.

mitosis inhibition, labeling and cell kill can be simulated by imitating application of drugs such as thymidine, aphidicoline, hydroxyurea, vincristine, finblistine.

colcemid and others.

The model to be simulated is described by the user according to his theoretical convictions.

The system provides numerous facilities to help the user describe an experiment and examine the simulation results.

A menu driven interactive scheme is used to communicate with the user.

CGS is implemented on AT type personal computers with hard disks.

This paper focuses on the simulator modules of CGS.

It is an event driven simulator which follows the individual cells through their life cycles.

General structure of the simulator, primary events and their attributes, chain operations, culture initializations, imitation of cell maturation and DNA synthesis are explained in the text as well as collection of statistics from the simulated experiments.

American Psychological Association (APA)

Ozkul, Uthman Shadi& Abid, Siraj Yusuf& al-Idrisi, Mustafa Muhammad& al-Asuli, Sufyan& Amir, Majid. 1998. Cell growth simulation (CGS) : the simulator. Journal of King Abdulaziz University : Engineering Sciences،Vol. 10, no. 1, pp.27-41.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-394599

Modern Language Association (MLA)

Ozkul, Uthman Shadi…[et al.]. Cell growth simulation (CGS) : the simulator. Journal of King Abdulaziz University : Engineering Sciences Vol. 10, no. 1 (1998), pp.27-41.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-394599

American Medical Association (AMA)

Ozkul, Uthman Shadi& Abid, Siraj Yusuf& al-Idrisi, Mustafa Muhammad& al-Asuli, Sufyan& Amir, Majid. Cell growth simulation (CGS) : the simulator. Journal of King Abdulaziz University : Engineering Sciences. 1998. Vol. 10, no. 1, pp.27-41.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-394599

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 39-40

Record ID

BIM-394599