Real-time PCR for direct detection of Streptococcus Pneumoniae in patients suffering from upper respiratory tract infection in Babylon Province

Other Title(s)

التشخيص المباشر لبكتريا Streptococcus pneumonia باستخدام تقنية RT-PCR للمرضى المصابين بالتهابات الجهاز التنفسي العلوية و السفلية في محافظة بابل

Author

al-Yassari, Abd al-Karim Salman

Source

Medical Journal of Babylon

Issue

Vol. 11, Issue 3 (30 Sep. 2014), pp.713-719, 7 p.

Publisher

University of Babylon College of Medicine

Publication Date

2014-09-30

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

7

Main Subjects

Medicine

Topics

Abstract AR

تعتبر بكتيريا Streptococcus pneumonia واحدة من أهم العوامل المرضية للإصابة بالالتهابات الرئوية المكتسبة و التي تظهر اعراضها السريرية من خلال التهابات و اصابة الجهاز التنفسي العلوية و السفلية و التي تم عزلها من الإفرازات التنفسية من الانف و الحنجرة، في هذه الدراسة تم استخدام تقنية PCR-RT في التشخيص المباشر للإصابات التنفسية للمرضى من عينات الافرازات التنفسية و قد تم تصميم البرايمرات الخاصة بهذه الدراسة وفق البرنامج المتبع في تصميم البرايمرات على اساس جين ribosomal RNA 16S.

أثبتت الدراسة أن تقنية PCR أكثر حساسية و خصوصية في التشخيص المباشر للعينات و وصلت النسبة في هذه الدراسة إلى 9,73 % من العينات 34 من العدد الكلي البالغ 46 عينة إفراز تنفسي من المجرى الأنفي و الحنجرة للمرضى المصابين بالتهابات الجهاز التنفسي العلوية و السفلية.

Abstract EN

Streptococcus pneumoniae is one of the main humans pathogens, it is important cause of community-acquired pneumoniae.

It causes clinical respiratory signs in lower and upper respiratory tract.

S.

pneumoniae may also occur in the upper respiratory tract, and can be detected from nasopharyngeal secretions.

In this study, we developed a Real-Time PCR specific for direct detection of Streptococcus pneumoniae to be applied from nasopharyngeal secretions in adult patients with respiratory tract infections.

The Real-Time PCR Primers were designed from the highly conserved of 16S ribosomal RNA gene of S.

pneumoniae.

Study results, were show that Real-Time PCR was highly sensitive and specific of up to 98 % in detection of S.

pneumoniae from nasopharyngeal secretions.

Where, the bacteria recorded 34 positive out of 46 specimens (73.9 %).

The study concluded that the used Real-Time PCR assay was provide a sensitive and reliable means for rapid detection of S.

pneumoniae in upper respiratory tract infection and this assay may serve a suitable molecular diagnostic tool for detection of S.

pneumoniae from nasopharyngeal secretions.

American Psychological Association (APA)

al-Yassari, Abd al-Karim Salman. 2014. Real-time PCR for direct detection of Streptococcus Pneumoniae in patients suffering from upper respiratory tract infection in Babylon Province. Medical Journal of Babylon،Vol. 11, no. 3, pp.713-719.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-410016

Modern Language Association (MLA)

al-Yassari, Abd al-Karim Salman. Real-time PCR for direct detection of Streptococcus Pneumoniae in patients suffering from upper respiratory tract infection in Babylon Province. Medical Journal of Babylon Vol. 11, no. 3 (2014), pp.713-719.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-410016

American Medical Association (AMA)

al-Yassari, Abd al-Karim Salman. Real-time PCR for direct detection of Streptococcus Pneumoniae in patients suffering from upper respiratory tract infection in Babylon Province. Medical Journal of Babylon. 2014. Vol. 11, no. 3, pp.713-719.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-410016

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 718-719

Record ID

BIM-410016