Genetic restriction map for nonrepeating region of tcdB toxin gene in Clostridium difficile
Other Title(s)
رسم خارطة القطع الجيني للمنطقة عديمة التكرار للجين السمي tcdB لبكتريا c. difficile
Joint Authors
Mustafa, Jalal Yasin
al-Idani, Thair Abd Ali
Ali, Suhaylah Fadil
Source
Journal of Basrah Researches : Sciences
Issue
Vol. 40, Issue 4A (31 Dec. 2014), pp.115-123, 9 p.
Publisher
University of Basrah College of Education for Pure Sciences
Publication Date
2014-12-31
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
9
Main Subjects
Topics
Abstract AR
أجريت هذه الدراسة لرسم خارطة القطع الجيني للجين السمي tcdB للعزلة التابعة إلى المجموعة A-B+ لبكتريا Clostridium difficile المعزولة من المرضى المصابين بالالتهابات المعوية و الراقدين في مستشفى البصرة العام بواسطة الإنزيمات القاطعة AluI و DraI وScaI ، إذ جمعت 200 عينة براز من مرضى مصابين بالإسهال خلال المدة بين شهري شباط و تموز لعام .2010 تم الحصول على 16 عزلة من بكتريا C.
difficile فبعد التأكد من التشخيص المظهري الزراعي و المجهري و الكيموحيوي أجري التشخيص الجيني بواسطة تقنية تفاعل السلسلة المتعددة ((PCR Polymerase chain reaction باستعمال الجين16S rRNA ، و البادئ NK9-NK11 المشتق من منطقة التكرار للجين السمي tcdA و عن طريق هذا البادئ تم تصنيف البكتريا المعزولة إلى ثلاث مجاميع بكتيرية من بكتريا C.
difficile و هي A+B+و A-B+ و A-B- .
درس الجين السمي tcdB باستعمال البادئ NK105-NK104 المشتق من المنطقة عديمة التكرار (Nonrepeating region) لهذا الجين إذ كانت نتيجة تقنية تفاعل السلسلة المتعددة نوعين من النواتج: الأول حزمة بحجم 204 bp تابعة إلى العزلة 56 المشخصة ضمن المجموعة A+B+ و حزم بحجم 250 bp تابعة إلى العزلات المشخصة ضمن المجموعة .A-B+ تم تحديد خارطة القطع الجيني عن طريق تحديد مواقع قطع الإنزيمات و علاقة أحدهم بالآخر إذ أظهر AluI ثلاث قطع بالأحجام 60 bp و 90 bp و 100 bp بينما أعطت الإنزيمات DraI و ScaI قطعتين بحجم 125 bp لكل منهما إذ أشارت الدراسة إلى تغييرات كبيرة في عزلة البكتريا التابعة إلى المجموعة A-B+ نتيجة للإضافة في قطعة الحامض النووي منقوص الأوكسجين DNA .
Abstract EN
This study was carried out for detected of the genetic restriction map of tcdB gene for A-B+ isolates that isolated from patients with a colitis disease in General Basrah Hospital by AluI, DraI, ScaI restriction enzymes.
A total of n = 200 diarrhea stool samples were collected from February until July-2010, 16 isolates were classified as Clostridium difficile according to morphological and biochemical tests.
16S rRNA gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR) and NK9-NK11 primer was used which was derived from repeating sequences of tcdA gene.
By NK9-NK11 primer the isolates were classified as three groups of C.
difficile ; A+B+, A-B+ and A-B-.
tcdB gene was amplified by using NK104-NK105 primer which was derived from nonrepeating sequences of tcdB gene, by this primer a variety was detected between A+B+ and A-B+ groups ; 204 bp for A+B+, while the 250 bp for A-B+ isolates.
The genetic restriction map was detected by determining the locations of a number of restriction endonuclease cleavage sites on the DNA relative to each other.
AluI enzyme showed three bands (100 bp, 90 bp and 60 bp) revealing there were two sites of this enzyme.
DraI and ScaI gave two bands (125 bp) for each enzyme revealing there was a single site of these enzymes.
American Psychological Association (APA)
al-Idani, Thair Abd Ali& Mustafa, Jalal Yasin& Ali, Suhaylah Fadil. 2014. Genetic restriction map for nonrepeating region of tcdB toxin gene in Clostridium difficile. Journal of Basrah Researches : Sciences،Vol. 40, no. 4A, pp.115-123.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-524181
Modern Language Association (MLA)
al-Idani, Thair Abd Ali…[et al.]. Genetic restriction map for nonrepeating region of tcdB toxin gene in Clostridium difficile. Journal of Basrah Researches : Sciences Vol. 40, no. 4A (2014), pp.115-123.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-524181
American Medical Association (AMA)
al-Idani, Thair Abd Ali& Mustafa, Jalal Yasin& Ali, Suhaylah Fadil. Genetic restriction map for nonrepeating region of tcdB toxin gene in Clostridium difficile. Journal of Basrah Researches : Sciences. 2014. Vol. 40, no. 4A, pp.115-123.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-524181
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 122-123
Record ID
BIM-524181
