Differentiate of ten pea cultivars (Pisum sativum L.) by RAPD markers and seed storage proteins
Other Title(s)
التفريق بين عشرة أصناف من البازيلاء (Pisum sativum L.) بواسطة تقنية RAPD و بروتينات البذور الخاصة بالتخزين
Joint Authors
Tahir, Nawruz Abd al-Razzaq
Hamakarim, Hero Fathi
Amin, Bestwn Umar Hama
Source
Jordan Journal of Agricultural Sciences
Issue
Vol. 11, Issue 1 (31 Mar. 2015), pp.95-107, 13 p.
Publisher
University of Jordan Deanship of Academic Research (DAR)
Publication Date
2015-03-31
Country of Publication
Jordan
No. of Pages
13
Main Subjects
Topics
Abstract AR
شملت الدراسة الحالية توصيف المعلمة الوراثية (التضخيم العشوائي لتعدد أشكال الحامض النووى الريبى منقوص الأوكسجين) و تركيب البروتين في بعض أصناف البازلاء.
استخدم عشرون بادئا لتقدير التنوع الوراثي في عشرة أصناف مختلفة.
أظهرت نتائج التحليلات وجود 89 معلمة منها 53 كانت متعددة الأشكال (59.55 ٪)، و اثنان من المعلمات كانت فريدة من نوعها.
و كان متوسط الحمض النووى المنقوض الأوكسجين المتضخمة و متعددة الأشكال 4.45 و2.65 على التوالي.
وجد أعلى متعدد الأشكال في بادئ 2 ،1 و7، في حين أن أقل عدد من متعدد الأشكال التي عثر عليها في بادئ 13 ،11 ،10 ،6 ،4 و14.
كانت المسافة الوراثية أو الاختلاف الوراثي بمدى 0.333- 0.774.
وان أعلى مسافة وراثية وجدت بين صنفين O-P622 وO-P234، بينما أقل مسافة وراثية كانت بين صنفين O-P923 وO-P888.
تم استخدام المسافة الوراثية لتكوين شجرة التنوع الوراثي.
و استنادا إلى نتائج شجرة التنوع الوراثي، قسمت أصناف البازلاء إلى مجموعتين رئيسيتين.
و أشارت النتائج أن الأصناف من المجموعة الثانية هي الأكثر بعدا وراثيا من الأصناف في المجموعة الأولى.
وظهر في تحليل الفصل الكهربائي لهلام الحامض متعدد الاكريلامايد وجود 23 قطعة بروتنية منها خمسة متعددة الأشكال.
تراوح الاختلاف الوراثي بين 0.75-0.00.
في هذا التحليل، قسمت شجرة التنوع الوراثي أصناف البازلاء إلى مجموعتين.
أثبتت النتائج قدرة عالية لطريقة التضخيم العشوائي لتعدد أشكال الحامض النووى الريبى منقوص الأوكسجين (RAPD) للتمييز بين أصناف البازلاء، في حين أظهر تحليل الفصل الكهربائي لهلام الحامض متعدد الاكريلامايد أقل اختلافاً بين الأصناف.
Abstract EN
The present study involved characterization of variability of random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers and protein patterns in some Pisum sativum cultivars.
Twenty RAPD primers were used to estimate the genetic diversity in ten pea cultivars.
A total of 89 bands were scored, of which 53 bands (59.55 %) were polymorphic and two of polymorphic band were unique bands.
The average of amplified and polymorphic bands was 4.45 and 2.65, respectively.
The highest polymorphic bands found at locus C10, R11 and V03 (5 bands), whereas the lowest number of polymorphic bands found at locus OPA-09, OPA13, OPA-07, P19, N7 and N20 (1 band).
Distance matrix based on Jaccard coefficient ranged from 0.333 to 0.774.
The highest value was found between O-P622 and O-P234, while the lowest genetic distance was observed between O-P923 and O-P888.
A dendrogram revealed two major clusters: cluster I and cluster II.
The results of dendrogram indicated that the groups of cluster II is most genetically distant from groups of cluster I.
The SDS-PAGE patterns of seed storage proteins, showed that among 23 electrophoretic protein bands, only five bands were recorded to be polymorphic.
The distance matrix values ranged from 0.00 to 0.75.
At distance 23, cluster analysis sorting the cultivars into two major groups.
The dendrogram constructed from both methods divided pea cultivars into two clusters.
In this study, analysis using RAPD markers provide more information about genetic diversity among pea cultivars and the results of SDS-PAGE show low variation among pea cultivars.
American Psychological Association (APA)
Tahir, Nawruz Abd al-Razzaq& Hamakarim, Hero Fathi& Amin, Bestwn Umar Hama. 2015. Differentiate of ten pea cultivars (Pisum sativum L.) by RAPD markers and seed storage proteins. Jordan Journal of Agricultural Sciences،Vol. 11, no. 1, pp.95-107.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-531515
Modern Language Association (MLA)
Tahir, Nawruz Abd al-Razzaq…[et al.]. Differentiate of ten pea cultivars (Pisum sativum L.) by RAPD markers and seed storage proteins. Jordan Journal of Agricultural Sciences Vol. 11, no. 1 (2015), pp.95-107.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-531515
American Medical Association (AMA)
Tahir, Nawruz Abd al-Razzaq& Hamakarim, Hero Fathi& Amin, Bestwn Umar Hama. Differentiate of ten pea cultivars (Pisum sativum L.) by RAPD markers and seed storage proteins. Jordan Journal of Agricultural Sciences. 2015. Vol. 11, no. 1, pp.95-107.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-531515
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 105-106
Record ID
BIM-531515