![](/images/graphics-bg.png)
Molecular characterization of selected rice genotypes for the major QTL phosphorus uptake one (pup1)
Other Title(s)
الوصف الجزيئي لموقع صفة كمية يتعلق بامتصاص الفوسفور (Pup1) في تراكيب وراثية منتخبة لمحصول الرز
Joint Authors
Johnson, David
Price, Adam H.
al-Aqidi, Faiz Fayyd
Source
The Iraqi Journal of Agricultural Science
Issue
Vol. 45, Issue 8(s) (31 Dec. 2014), pp.956-967, 12 p.
Publisher
University of Baghdad College of Agriculture
Publication Date
2014-12-31
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
12
Main Subjects
Topics
Abstract AR
تعد التربية بالاستعانة بالمعلمات الجزيئية أداة مفيدة جدا لمربي النبات و لكن لا تزال بحاجة إلى الكثير من العمل البحثي لأن المعلومات عن تأثير مواقع الصفات الكمية (QTLs) في تراكيب وراثية مختلفة هي غير مؤكده و لا توجد هناك معلمات جزيئيه مثالية, و عليه بعض الجهود البحثية باتجاه التحقيق و التثبت من موقع الصفة الكمية فيما يختص الفوسفور (Pup1) الذي يمنح صفة مقاومة شحة الفوسفور في الرز (Oryza sativa L.) كانت قد عُملت من خلال تقييم تأثير تباين الاليلات في الموقع Pup1 على صفات النمو المقاسة في تراكيب منتخبة من الرز.
لقد تم اختيار ستة معلمات جزيئية لتستهدف جينات مفترضة و محفوظة جزئيا في جينوم صنف الرز نيبونباري (Nipponbare) و كذلك تستهدف الجينات الخاصة بصنف الكزلاث (Kasalath) و أن هذه الجينات الأخيرة هي غير موجودة في صنف الـ Nipponbare و تقع في موقع جينومي كبير يحتوي على مسح أو و إدخال (INDEL).
بعد اختبار 30 صنف لمحصول الرز بواسطة المعلمات أظهرت النتائج بأن الأصناف التي تمتلك لاليلات الصنف كزلاث في كل مواقع الصفة الكمية المدروسة من غير صنف الكزلاث كانت IAC 165, FR 13A, Black Gora, Azucena و كذلك IAC 25 أما الأصناف التي تمتلك لاليلات كزلاث بشكل جزئي فهي ثلاث فقط و هي Li-Jiang-Xin-Tuan-Hei-Gu, Dular و M202 بينما باقي الأصناف لا تمتلك لاليلات كزلاث في كل المواقع المدروسة.
ثم بعد ذلك تمت زراعة هذه الأصناف المتباينة باليلاتها في تربتين تفتقر لعنصر الفوسفور و قد أضيف عنصر الفوسفور إلى المعاملات بأسلوبين مختلفين و بتجربتين (إما بشكل سائل كمحلول يوشيدا (Yoshida) المغذي أو بشكل صلب على شكل الفوسفات الصخري و الذي أضيف هو الآخر بطريقتين إما خُلط بشكل متجانس مع كل التربة أو اقتصر على 10 سم من الطبقة السطحية فقط).
لقد أظهرت النتائج بأنه تحت ظروف شحة الفوسفور استطاعت الأصناف التي تمتلك لاليلات صنف الكزلاث في Pup1 أن تديم وزن جاف للمجموع الخظري عالي بشكل معنوي مقارنتاً بالأصناف الغير مقاومة التي تمتلك اليلات صنف النيبونباري في هذا الموقع للصفة الكمية.
بشكل عام إن البيانات تثبت بأن لـ Pup1 أثر و بشكل معنوي على رفع الوزن الجاف للمجموع الخضري لأصناف من الرز تختلف في تركيبها الوراثي في ظروف شحة الفوسفور.
Abstract EN
Marker-assisted breeding is a very useful instrument for breeders but still needs much research work because information on the effect of quantitative trait loci (QTLs) in different genetic backgrounds is uncertain and ideal molecular markers are unavailable.
Therefore, some research efforts toward the investigation and validation of the major rice QTL Phosphate uptake 1 (Pup1) that confers tolerance of phosphorus (P) deficiency in rice (Oryza sativa L.) have been made throughout assessing the effect of the presence of the Pup1 allele on growth parameters of selected genotypes.
Six markers were selected that target firstly putative genes that are partially conserved in the Nipponbare reference genome and secondly Kasalath-specific genes that are located in a large insertion-deletion (INDEL) region that is absent in Nipponbare.
Testing these markers in 30 diverse rice genotypes showed that those genotypes possess Kasalath alleles at all analysed loci, apart from Kasalath, were Azucena, Black Gora, FR 13A, IAC 165 and IAC 25.
Genotypes that partially possessed Kasalath alleles were only three (Dular, Li-Jiang-Xin-Tuan-Hei-Gu and M 202) while the other genotypes lacked Kasalath alleles at all loci analysed.
These contrasting Pup1 genotypes were subsequently grown in two different P deficient soils and environments.
Whether P applied in liquid form as Yoshida’s nutrient solution (YNS) or solid form as rock phosphate added either homogenously or in 01 cm shallow layer, genotypes with the Kasalath alleles in Pup1 locus maintained significantly higher shoot dry weight (SDW) plant-1 under P deprivation in comparison with intolerant genotypes with the Nipponbare alleles in this locus.
Overall, the data provide evidence that Pup1 has the potential to improve SDW in P-deficient conditions and in diverse genetic backgrounds.
American Psychological Association (APA)
al-Aqidi, Faiz Fayyd& Price, Adam H.& Johnson, David. 2014. Molecular characterization of selected rice genotypes for the major QTL phosphorus uptake one (pup1). The Iraqi Journal of Agricultural Science،Vol. 45, no. 8(s), pp.956-967.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-542996
Modern Language Association (MLA)
al-Aqidi, Faiz Fayyd…[et al.]. Molecular characterization of selected rice genotypes for the major QTL phosphorus uptake one (pup1). The Iraqi Journal of Agricultural Science Vol. 45, no. 8 (2014), pp.956-967.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-542996
American Medical Association (AMA)
al-Aqidi, Faiz Fayyd& Price, Adam H.& Johnson, David. Molecular characterization of selected rice genotypes for the major QTL phosphorus uptake one (pup1). The Iraqi Journal of Agricultural Science. 2014. Vol. 45, no. 8(s), pp.956-967.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-542996
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 966-967
Record ID
BIM-542996