Molecular characterization of Newcastle disease (variable gene) in chickens
Other Title(s)
تحديد التركيب الجزيئي لجينات فيروس مرض النيوكاسل المتغير
Dissertant
Thesis advisor
Abd al-Ghani, Adil Hasan Mahmud
al-Tarawinah, Khalid Ahmad
Comitee Members
Atruz, Umar Muhammad Falih
al-Zaraini, Wail Ali
al-Nuaymat, Sulayman Muhammad
University
Mutah University
Faculty
Faculty of Science
Department
Department of Biological Sciences
University Country
Jordan
Degree
Master
Degree Date
2014
Arabic Abstract
مرض نیوكاسل هو مرض معد یسببه فیروس من الفیروسات ذات الحمض النووي الرایبوزي RNA و ینتمي إلى المجموعة الفیروسیة (paramyxovirus-1).
یعتبر مرض نیوكاسل شدید العدوى، مع وجود تباین كبیر في شدة المرض الناجم عن سلالات مختلفة من هذا الفیروس.
تم اختیار 48 عینة من الدجاج من 15 مزرعة دجاج لاحم من مناطق مختلفة من محافظة الطفیلة و محافظة الكرك جنوب الأردن.
تم جمع عینات أنسجة من طیور مصابة بهذا المرض من هذه المزارع.
تم استخلاص المادة الوراثیة RNA و معالجتها عن طریق الناسخ العكسي لسلسلة البلمرة RT-PCR و ذلك لإنتاجcDNA .
تم إكثار العینات الناتجة من تفاعل البلمرة.
تم الحصول على 33 عینة إیجابیة و قد تم تحدید تسلسل نیوكلیوتیدات 10 عینات منها.
واحدة من هذه العینات تبین أنها تعود إلى العترة الضاریة للمرض GRQRRF.
هذه الطفرة تختلف عن السلالة المحددة في مزارع شمال الأردن و تشبهها بنسبة 88.9 %.
الواضح من هذه الدراسة أن هناك اختلاف في حمضین أمینین هما الآرجنیین و اللیسین و هذا ما یدل على حصول طفرة في فیروس النیوكاسل في المناطق قید الدراسة.
أظهرت هذه الدراسة اكتشاف سلالة جدیدة من فیروس النیوكاسل.
English Abstract
Newcastle disease (ND) is an infectious disease causing by RNA virus which belongs to paramyxovirus-1 group.
ND is highly contagious, with a great variation in the severity of disease caused by different strains of this virus.48 samples of chickens were selected from 15 broiler farms in the Al-Tafila and Al-Karak regions of southern Jordan.
Infected tissue samples were collected from infected birds from these farms.
The RNA genome of the ND virus was extracted and amplified by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT_PCR).
The resulting cDNA samples were amplified.
33 positive samples were obtained and 10 samples were sequenced.
One of the positive samples showed a velogenic mutation with GRQRRF in fusion gene cleavage motif.
This mutant showed 88.9% similarity to avelogenic strain isolated from the north of Jordan farms.
Two amino acids, Arginine and Lysine, are different from the consensus sequence of fusion cleavage motif RRQKRF.
This study showed the discovery of a novel velogenic strain of NDV
Main Subjects
Topics
No. of Pages
52
Table of Contents
Table of contents.
Abstract.
Abstract in Arabic.
Chapter One : Theoretical background.
Chapter Two : Literature review.
Chapter Three : Design and methodology.
Chapter Four : Results, discussion and recommendation.
References.
American Psychological Association (APA)
al-Mmsidin, Basil Zaydan. (2014). Molecular characterization of Newcastle disease (variable gene) in chickens. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Mutah University, Jordan
https://search.emarefa.net/detail/BIM-545269
Modern Language Association (MLA)
al-Mmsidin, Basil Zaydan. Molecular characterization of Newcastle disease (variable gene) in chickens. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Mutah University. (2014).
https://search.emarefa.net/detail/BIM-545269
American Medical Association (AMA)
al-Mmsidin, Basil Zaydan. (2014). Molecular characterization of Newcastle disease (variable gene) in chickens. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Mutah University, Jordan
https://search.emarefa.net/detail/BIM-545269
Language
English
Data Type
Arab Theses
Record ID
BIM-545269
