Cloning of copper resistance gene (copA)‎ that presence in novel genomic Island of Acinetobacter baumannii A92

Other Title(s)

كلونه جين النحاس المتواجد في الجزيرة الوراثية الفريدة المتواجدة في بكتريا Acinetobacter baumannii A92

Joint Authors

Duhiyah, Ali Husayn
kumar, kumar Raja
al-Ujayli, Suhad Sad Mahmud
Melconian, Alice Krikur Agop

Source

Iraqi Journal of Science

Issue

Vol. 55, Issue 2B (sup) (31 Dec. 2014), pp.722-728, 7 p.

Publisher

University of Baghdad College of Science

Publication Date

2014-12-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

7

Main Subjects

Biology

Topics

Abstract AR

أجريت الدراسة للكشف عن تواجد جين مقاومة عنصر النحاس في موروث (جينوم) بكتريا Acinetobacter baumannii A92.

بسبب عدم تواجد التتابعات الكاملة لجينوم A.baumannii A92 في موقع NCBI لذلك تم الاعتماد على تتابعات بكتريا Gene bank-A.baumannii IS-116 (AMGF0100000.1) حيث وجد تشابه بين تتابعات المادة الوراثية للعزلتين لتصميم البادئات التي استخدمت في تضخيم الجين.

حيث تم تصنيع بادئين يحتويان على موقعين للأنزيمات القاطعة (KpnI, XohI) و كذلك تم استخدام الناقل PWSK29 كناقل استنسال، بعد إكمال عملية الهضم للجين المراد استنساله و ناقل الكلونة تم إجراء تفاعل الربط بين الجين و الناقل لتكوين الجزيئة الهجينة ثم بعد ذلك تم إدخال الجزيئة الهجينة إلى خلايا بكتريا E.

coli DH5α المؤهلة بواسطة عملية التحول (transformation) و أخيرا تم حضن الخلايا البكتيرية المتحولة لمدة 16-18 ساعة في 73 م و بعد انتهاء مده الحضن تم الحصول على خلايا بيضاء اللون الحاملة للجزيئة الهجينة.

للتأكد من نجاح عملية الاستنسال و تواجد الجزيئة الهجينة، تم استخدام تضاعف السلسة للخلايا باستخدام بادئ cop-R و البادئ العام M13-R(universal primer) و قد بينت نتائج التفاعل للـ colony-PCR على الجل وجود الجين المحشور من خلال ظهور حزمة (2484 زوج قاعدي) الجين المحشور.

Abstract EN

-This study was aimed to detect weather copA gene(copper resistance gene ) presence in A.baumannii A92 genome(AbaR genomic islands).

The full genomic sequence of A.baumannii A92 not published in NCBI genome similarity was detected between two strains so the sequence of A.baumanniiIS-116(Genebank-AMGF0100000.1 ) was used to design the primers that were used for amplify of copA gene of A.baumannii A92.

Two primers contain two sites for restriction enzymes (KpnI,XohI) and PWSK29 vector were used in the cloning, double digestion has been performed for vector and gene.

Then the re-ligation was completed to form recombinant molecule,after that, transformation have been performed for the recombinant molecule by using chemical competent E.coli DH5α.

Finally ,the transformant cells were incubated for 16-18hr at 37°C, the white positive colony that contain recombinant vector was appeared .

After that, the success of cloning was confirmed by using colony PCR method for white colony by using copA-F with M13-R(universal primer) primers ,the results of colony PCR confirmed the presence of insert gene by appearing of inserted band.

American Psychological Association (APA)

al-Ujayli, Suhad Sad Mahmud& Melconian, Alice Krikur Agop& Duhiyah, Ali Husayn& kumar, kumar Raja. 2014. Cloning of copper resistance gene (copA) that presence in novel genomic Island of Acinetobacter baumannii A92. Iraqi Journal of Science،Vol. 55, no. 2B (sup), pp.722-728.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-566585

Modern Language Association (MLA)

Melconian, Alice Krikur Agop…[et al.]. Cloning of copper resistance gene (copA) that presence in novel genomic Island of Acinetobacter baumannii A92. Iraqi Journal of Science Vol. 55, no. 2B (Supplement) (2014), pp.722-728.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-566585

American Medical Association (AMA)

al-Ujayli, Suhad Sad Mahmud& Melconian, Alice Krikur Agop& Duhiyah, Ali Husayn& kumar, kumar Raja. Cloning of copper resistance gene (copA) that presence in novel genomic Island of Acinetobacter baumannii A92. Iraqi Journal of Science. 2014. Vol. 55, no. 2B (sup), pp.722-728.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-566585

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 728

Record ID

BIM-566585