Genetic diversity in Corchorus Olitorius L. grown in South-West Nigeria inferred from RAPD data
Other Title(s)
التنوع الوراثي في نبات الملوخية (Corchorus olitorius) في الجنوب الغربي من نيجيريا باستخدام طريقة (RAPD)
Joint Authors
Abati, Abraham
Adeyemo, Oyenike
Source
Jordan Journal of Agricultural Sciences
Issue
Vol. 11, Issue 2 (30 Jun. 2015), pp.329-337, 9 p.
Publisher
University of Jordan Deanship of Academic Research (DAR)
Publication Date
2015-06-30
Country of Publication
Jordan
No. of Pages
9
Main Subjects
Topics
Abstract AR
تم في هذه الدراسة التنوع الوراثي ما بين l7 صنفا من نبات الملوخية (olitorius Corchorus) و الذي ينمو في الجنوب الغربي من نيجيريا بأستخدام طريقة ال (RAPD).
عند استخدام 22 نوع من البادئات تم التعرف على 96 من أليات المتعددة الأشكال (بمتوسط 36.4 لكل بادئ) بالاضافة لعدد كبير من الأليلات الفريدة (بمتوسط 29 ٪) في ثمانية أصناف.
استنادا إلى نتائجال RAPD وجد أن المسافة الجينية تراوحت ما بين 05٬0 الى 53٬0 بمتوسط 23.0، مما يدل على وجود تباين وراثي منخفض ما بين الأصناف.
باستخدام أسلوب المزاوجة الحسابي المتوسط (UPGMA) على نتائج ال RAPD، تم تقسيم الأصناف المدروسة إلى مجموعتين رئيسيتين حيث احتوت المجموعة الاولى l5 صنفا و التي تم جمعها من نفس المكان أو اماكن مختلفة.
في حين تألفت المجموعة الثانية من صنفين فقط (EW05 وEW06) و اللذان تم جمعها من نفس المكان.
بالأضافة تم تحليل المكونات الرئيسة باستخدام ال (PCA) على أساس المسافة الوراثية، حيث تم ايضا فصل الأصناف إلى مجموعتين.
إن النتائج المعروضة تبين وجود خسارة في التنوع الوراثي في هذه الأصناف مما يدل على وجود تأثيرات لعمليات تدجين و اختيار في مناطق الجنوب الغربي من نيجيريا.
Abstract EN
In this study, we investigated the genetic diversity and relationships in some Corchorus olitorius L.
grown in South-West Nigeria.
We used random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers in a total of 17 Corchorus olitorius L.
cultivars.
Twenty-two RAPD markers detected 96 polymorphic alleles (average, 4.36) and a high number of unique alleles (29%) in eight lines.
Genetic distance based on RAPD data (Euclidean distance) ranged from 0.05 to 0.53 with a mean of 0.23, indicating low detected genetic diversity among the cultivars.
Cluster analysis of RAPD data based on unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) grouped Corchorus olitorius L.
cultivars into two main groups.
Majority of the lines (15) were assigned into Group I which included lines collected from the same or different places.
The second group consisted of two cultivars (EW05 and EW06) collected from the same place.
Principal Component Analysis (PCA) based on genetic distance also separated the cultivars into two groups.
Genetic diversity has been narrowed in these cultivars suggesting possible effects of domestication and selection processes.
American Psychological Association (APA)
Adeyemo, Oyenike& Abati, Abraham. 2015. Genetic diversity in Corchorus Olitorius L. grown in South-West Nigeria inferred from RAPD data. Jordan Journal of Agricultural Sciences،Vol. 11, no. 2, pp.329-337.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-593189
Modern Language Association (MLA)
Adeyemo, Oyenike& Abati, Abraham. Genetic diversity in Corchorus Olitorius L. grown in South-West Nigeria inferred from RAPD data. Jordan Journal of Agricultural Sciences Vol. 11, no. 2 (2015), pp.329-337.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-593189
American Medical Association (AMA)
Adeyemo, Oyenike& Abati, Abraham. Genetic diversity in Corchorus Olitorius L. grown in South-West Nigeria inferred from RAPD data. Jordan Journal of Agricultural Sciences. 2015. Vol. 11, no. 2, pp.329-337.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-593189
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 336
Record ID
BIM-593189
