Molecular characterization and antibiotic susceptibility of diarrheagenic
Other Title(s)
التوصيف الجزيئي و الحساسية تجاه المضادات لبكتريا القوقون الأشريكية المسببة للإسهال في الأطفال
Joint Authors
al-Dulaimi, Tasahil Hamid
Aziz, Hawraa Wahhab
Abd al-Aziz, Sad
Muhsin, Suad Abd al-Mahdi
al-Marzuqi, Ali Husayn Muhammad
Source
Issue
Vol. 12, Issue 2 (30 Jun. 2015), pp.541-550, 10 p.
Publisher
University of Babylon College of Medicine
Publication Date
2015-06-30
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
10
Main Subjects
Topics
Abstract AR
هناك العديد من الدراسات ذات العلاقه أجريت في ذي قار انجزت حول كشف التصنيف لسلالات بكتريا الإشريكية القولونية Escherichia coli المترافقه مع حالات الاسهال (DEC Escherichia coli Diarrheagenic) في الاطفال المصابين بالاسهال.
ركزت هذه الدراسة على التحري عن حالات DEC جينيا في الاطفال بعمر دون السنتين للراقدين في المستشفيات.
من بين ..2 طفل مصابين بحالات الاسهال و75طفل سليم (مجموعة سيطره) اخذت عينات الخروج وزرعت على اوساط الماكونكي و الايوسين حيث تم عزل وتشخيص coli .E كما تمت دراسة الحساسيه للمضادات الحيويه كما أن جينات الضراوه تم تشخيصها بواسطه تفاعل البلمره المتسلسل PCR l of و ذلك باستخدام بواديء متخصصه لتعيين كل جين و حسب وزنه بلنسبه إلى حالات DEC حيث تم تشخيص (EHEC) enterohemorghagic (EIEC) enteroinvasive ,(ETEC) enterotoxigenic ,(EPEC) enteropathogenic.
تم تشخيص حالات DEC في هذه الدراسة و التي تم عزلها من خروج الاطفال الراقدين في المستشفيات حيث كانت النسب 8.44 % مقارنه مع حالات السيطره 4.16 %، كما أن نسب مجاميع الإشريكية القولونية Escherichia coli كانت كالاتي : EPEC ,(% 5.l9) ETEC ,(% 73.64) EAEC (% 27.5) and EHEC (% 5.l0).
كانت نسب جينات الضراوه لكلمن حالات DEC و مجموعة السيطره كالاتي : % 3.87 , 6.93 % pCVD432 % 3.l ,% l4.8 (ST) stable-heat estAl ; % 0 ,% 6.l8 stx2 ;% 8.0 ,% 8.22 stxl ;% 05.2 ,% l.59 bfpA ;% 5.8 ,% 2.64 eaeA %4.0 ,%l.43 (LT) labile-heat eltB ;% 2.0 ,% 6.l4 (ST) stable-heat 4-estA2 على التوالي.
كشفت هذه الدراسة عن مدى تأثير عالي من حالات DEC حيث كانت نسب بكتريا coli .E عاليه بمختلف مجاميعها حيث كانت هناك نسبه عاليه من حالات المقاومه للمضاد الحيوي و بالاخص حالات كلمن EAEC وEPEC حيث كانت هي السائده.
كان لاستخدام نوعين من البواديء لتشخيص جين ST مفيدا لغرض تحديد حساسية تشخيص الجين المذكور في حالات الاسهال المرتبطة ب- DEC.
Abstract EN
In Thi Qar there are relatively few studies have been done to reveal and classify diarrheagenic Escherichia coli (DEC) strains among children with diarrhea.
This study focused genetically at investigating DEC among hospitalized children under 2 years in Thi Qar city.
A total of 200 children (Below 12 years) with diarrhea and 75 without diarrhea were their stools investigated using culture on MacConkey and EMB agar, and E.
coli isolates were examined for detection of diarrheagenic E.
coli types, antimicrobial susceptibility pattern.
Virulence genes detected using PCR.
A multiplex PCR system method was used to detect a species specific gene for E.coli and ten different virulence genes for detection of five pathogroups of DEC namely enteroaggregative- (EAEC), enteropathogenic- (EPEC), enterotoxigenic- (ETEC), enteroinvasive- (EIEC) and enterohemorghagic- Escherichia coli (EHEC).
The study has indicated that diarrheagenic E.
coli isolates were found mostly in stools of children with diarrhea.
DEC diarrhoeagenic E.
coli was significantly detected among diarrheic children (44.8%) compared with control children (16.
4 %).
Of the DEC pathotypes examined, EAEC was found in (64.
73 %), ETEC in (19.5%), EPEC in (10.
5 %) and EHEC in (5.
27 %) of diarrheic.
Virulence-gene factors in DEC isolated from children with diarrhea and from controls.
The distribution of virulence gene was; pCVD432 93.6%, 87.3%; eaeA 64.
2 %, 8.
5 % ; bfpA 59.
1 %, 2.
05 %; stx1 22.
8 %, 0.
8 % ; stx2 18.
6 %, 0%; estA1 heat-stable (ST) 8.
14 %, 1.3 % ; estA2-4 heat-stable (ST) 14.
6 %, 0.
2 % ; eltB heat-labile (LT) 43.
1 %, 0.4% in DEC and control children respectively.
This study revealed high incidence of diarrheagenic E.
coli isolates and high prevalence of antimicrobial resistance among normal intestinal E.
coli with typical EAEC and typical EPEC predominating.
The use of primers for both variants of ST useful to detect the sensitivity for detection of ETEC strains of hospitalized children in Thi Qar.
American Psychological Association (APA)
al-Dulaimi, Tasahil Hamid& Aziz, Hawraa Wahhab& al-Marzuqi, Ali Husayn Muhammad& Abd al-Aziz, Sad& Muhsin, Suad Abd al-Mahdi. 2015. Molecular characterization and antibiotic susceptibility of diarrheagenic. Medical Journal of Babylon،Vol. 12, no. 2, pp.541-550.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-593793
Modern Language Association (MLA)
al-Dulaimi, Tasahil Hamid…[et al.]. Molecular characterization and antibiotic susceptibility of diarrheagenic. Medical Journal of Babylon Vol. 12, no. 2 (2015), pp.541-550.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-593793
American Medical Association (AMA)
al-Dulaimi, Tasahil Hamid& Aziz, Hawraa Wahhab& al-Marzuqi, Ali Husayn Muhammad& Abd al-Aziz, Sad& Muhsin, Suad Abd al-Mahdi. Molecular characterization and antibiotic susceptibility of diarrheagenic. Medical Journal of Babylon. 2015. Vol. 12, no. 2, pp.541-550.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-593793
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 548-550
Record ID
BIM-593793
