Using ISSR markers to build a phylogenetic of barley genotypes

Other Title(s)

استخدام مؤشرات التفاعل الضمني البسيط لبناء الشجرة الوراثية لأصناف الشعير

Author

al-Hadithi, Zaynah Sayf al-Din Muhammad

Source

Iraqi Journal of Science

Issue

Vol. 56, Issue 2C (30 Sep. 2015), pp.1682-1688, 7 p.

Publisher

University of Baghdad College of Science

Publication Date

2015-09-30

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

7

Main Subjects

Botany

Topics

Abstract AR

هدفت الدراسة الحالية إلى محاولة بناء شجرة السلالات الوراثية اعتمادا على تسعة مورثات لنبات الشعير العراقي، حيث استعملت المؤشرات الوراثية للتتابع الضمني لتحديد مستوى التشابه الوراثي للأصناف المدروسة.

استعملت تسع بادئات و لوحظ ظهور 41 حزمه للأصناف المدروسة، كانت 28 حزمة متباينة في الحجم الجزيئي و 13 حزمة متماثلة.

و تراوحت نسب التباينات الوراثية بين 25 % -100 % و بمتوسط 70.5 % و كان معدل الحزم المتباينة لكل بادئ 4.5.

تراوح الحجم الجزيئي للحزم المضخمه بين 140- 1600 زوج قاعدي، و قد لوحظ ظهور خمس حزم فريده في هذه الدراسة يمكن استخدامها كمؤشر وراثي لدراسة أصناف الشعير المختلفة.

أظهرت النتائج قيم الوراثي اذ تراوحت بين (0.0854-0.9897) لأصناف الشعير المدروسة.

و اعتمادا على شجرة تطور الطرز الجينية فقد تم بنام التحليل العنقودي لأصناف الشعير و الذي جمع الأصناف التسع في مجموعتين رئيستين اعتمادا على أسلافهم و سماتهم الشكلية.

استخدما لأصناف من مجاميع متنوعة و مجموعات فرعية توفر إمكانية الحصول على التباين الوراثي المناسب في المجتمع الهجين لنبات الشعير.

Abstract EN

This study is attempts to build a phylogenetic between nine Iraqi barley genotypes based on ISSR-PCR analysis by determine the level of genetic similarity among them.

Nine issr primers used in this study produced 41 bands across nine studied varieties.

Of these bands, 28 bands were polymorphic and the remaining monomorphic bands were 13.

The average polymorphic rate was 70.5 % ranged between 25 %-100 % , and average of polymorphic bands /primer was 4.5.The size of the amplified bands ranged 140-1600 bp.

It was generated a 5 unique bands in this study, these bands can be used as a DNA profiling of all studied genotypes.

The results were showed Genetic distances ranged between (0.0854-0.9897) among barley varieties.

Based on phylogenic tree, a dendrogram were constructed among studied barley varieties, cluster analysis grouped the nine varieties into two main clusters depending on their ancestors and their morphological traits.

The use of cultivars from various clusters and sub clusters offer the possibility of obtaining an appropriate genetic variability in hybrid population.

American Psychological Association (APA)

al-Hadithi, Zaynah Sayf al-Din Muhammad. 2015. Using ISSR markers to build a phylogenetic of barley genotypes. Iraqi Journal of Science،Vol. 56, no. 2C, pp.1682-1688.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-606671

Modern Language Association (MLA)

al-Hadithi, Zaynah Sayf al-Din Muhammad. Using ISSR markers to build a phylogenetic of barley genotypes. Iraqi Journal of Science Vol. 56, no. 2C (2015), pp.1682-1688.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-606671

American Medical Association (AMA)

al-Hadithi, Zaynah Sayf al-Din Muhammad. Using ISSR markers to build a phylogenetic of barley genotypes. Iraqi Journal of Science. 2015. Vol. 56, no. 2C, pp.1682-1688.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-606671

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Text in English ; abstracts in English and Arabic.

Record ID

BIM-606671