Molecular identification of rhizosphere Trichoderma spp. and their antagonistic impact against some plant pathogenic fungi
Other Title(s)
التشخيص الجزيئي للترايكوديرما المعزولة من التربة المحيطة بالجذور و فعلها التضادي تجاه بعض الفطريات الممرضة للنبات
Joint Authors
Ulwan, Adil Hamdan
al-Qaysi, Safa al-Din Ahmad Shantir
Source
Issue
Vol. 13, Issue 1 (31 Mar. 2016), pp.53-65, 13 p.
Publisher
University of Baghdad College of Science for Women
Publication Date
2016-03-31
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
13
Main Subjects
Topics
Abstract AR
الهدف الرئيسي من هذه الدراسة هو التعريف على المستوى الجزيئي و تحديد الفعالية التضادية لقطر Trichoderma spp.
المعزولة من التربة المحيطة لجذور النباتات تجاه بعض الممرنات الفطرية للنبات و التي تضمنت(Magnaporthe grisea) Macrophomina phisolina, Rhizoctonia solani Py'ricularia oryzae.عزلت أربعة عزلات من.Trichoderma spp من التربة المحيطة لجذور بعض النباتات المضيفة من مواقع مختلفة من محافظات مختلفة في مصر.
تم نشخيص عزلات .Trichoderma spp اعتمادا على المظهر الخارجي ضلا عن تعريفها على المستوى الجزيئي من خلال مقارنة نتائج تسلسل الحمض النووي على أساس تعريف المنطقة (ITS1-5.8S-ITS2) و مقارنة نتائج تسلسل الحامض النووي (DNA) لمنطقة ITS مع نتائج عزلات املية.
أوضحت نتائج التعريف أن عزلة واحدة من بين العزلات الأربعة تعود إلى (T.
asperellum T1)، عزلة واحدة تعود إلى (t2 T.
longibrachiatum) و عزلتين تم تعريفها على أنها (T.
harzianum T3,T4) أوضحت التعريف الجزيئي نسبة شبه 99 % لتسلسل المنطقة S-ITS5.8 للعزلتينT.
harizanum) T3T4) و كذلك نسبة شبه (99 %) لكل من (T.
asperellum T1 .T longibrachiatum T2) من جهة أخرى نتيجة التعريف الجزيئي للعزلات الفطرية للمرضة للنبات أوضحت نسبة شبه عالية و تم تعريفها على أنها (P.
oryzae, M.
phisolina, R.
solani) و بنسبة شبه (99، 96، % 99) على التوالي.
بالنسبة للعلاقة الوراثية بين عزلات الترايكوديرما الأربعة تم باستخدام تقنية (RAPD) و لعشرة بادئات تم اختيارها بصورة عشوائية.
تم اختبار الفعل التضادي و المقاوم للعزلالت الأربعة لفطر Trichoderma تجاه القطريات الممرنة قيد الدراسة و بينت النتائج أن T.
harizanum كانت اكثرة قوة و فعالية في تثبيط القطريات الممرنة عنه بالنسبة لفطر T.
asperellum وT.
longibrachiatum.
نسبة التثبيط بالنسبة لفطر T.
harzianum كانت متغايرة كثيرا حيث بلغت (44.8 إلى 91.6 %).
التأثير التثبيطي لفطر T.
asperellum تراوح بين (42.2 إلى 86.0 %)، بينما اظهر الفطر T.
longibrachiatum فعلا تثبيطيا تراوح بين (47.5 إلى 83.8 %).
Abstract EN
The main aim of this study was to molecular identification and determine the antagonistic impact of rhizosphere Trichoderma spp.
against some phytopathogenic fungi, including (Magnaporthe grisea) pyricularia oryzae, Rhizoctonia solani and Macrophomina phasolina.
Four Trichoderma isolates were isolated from rhizosphere soils of the different host plants in different locations of Egyptian governorates.
The morphological characterization of isolated Trichoderma as well as using of (ITS1-5.8S-ITS2) ribosomal gene sequence acquisition and data analyses.
By comparing the results of DNA sequences of ITS region, the fungi represented one isolate were positively identified as T.
asperellum (1 isolate T1) and one as T.
longibrachiatum (1 isolate T2) and two as Trichoderma harzianum (2 isolates T3 and T4).
The results showed similarity value of (5.8S-ITS) region sequence of the two isolates, T1 (T.
asperellum) and T2 (T.
longibrachiatum) of (99%, 99%), respectively.
The similarity value of (5.8S-ITS) region sequence with isolates of T3, T4 (T.
harzianum) of (99%).
On the other side, the results of molecular identification of phytopathogenic fungi represented high similarity value of (5.8S-ITS) region sequence and were identified as P.oryzae, R.
solani and M.
phasolina (99, 96 and 99%) respectively.
Variations and genetic relationships among 4 Trichoderma isolates were investigated by using the Rapid Amplification of Polymorphic DNA (RAPD) profiles using ten random primers.
All Trichoderma isolates were assessed for their antagonistic impact on phytopathogens P.
oryzae, R.
solani and M.
phasolina.
Though T.
harzianum isolates were more affects than T.
longibrachiatum and T.
asperellum isolates, the percent inhibitory effect among T.
harzianum isolates were vary much (44.8 to 91.6 %).
The inhibitory effect of T.
asperellum isolates ranged from 42.2 to (86.0 %), while T.
longibrachiatum exhibiting affect ranged between (47.5 %) to (83.8 %).
American Psychological Association (APA)
al-Qaysi, Safa al-Din Ahmad Shantir& Ulwan, Adil Hamdan. 2016. Molecular identification of rhizosphere Trichoderma spp. and their antagonistic impact against some plant pathogenic fungi. Baghdad Science Journal،Vol. 13, no. 1, pp.53-65.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-688080
Modern Language Association (MLA)
al-Qaysi, Safa al-Din Ahmad Shantir& Ulwan, Adil Hamdan. Molecular identification of rhizosphere Trichoderma spp. and their antagonistic impact against some plant pathogenic fungi. Baghdad Science Journal Vol. 13, no. 1 (2016), pp.53-65.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-688080
American Medical Association (AMA)
al-Qaysi, Safa al-Din Ahmad Shantir& Ulwan, Adil Hamdan. Molecular identification of rhizosphere Trichoderma spp. and their antagonistic impact against some plant pathogenic fungi. Baghdad Science Journal. 2016. Vol. 13, no. 1, pp.53-65.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-688080
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Text in English ; abstracts in English and Arabic.
Record ID
BIM-688080
