Planomonospora sp. pm 18 : isolation and taxonomy of new actinobacterial strain isolated from Algerian Saharan soil
Other Title(s)
Planomonospora sp. pm 18 : isolement et taxonomie d’une nouvelle souche d’actinobactérie isolée du sol Saharien Algérien
Joint Authors
Chaabane Chaouch, Fawziyah
Bu Znada, Khawlah
Bu Ras, Nur al-Din
Tata, Samirah
Meklat, Atika
Mokrane, Salim
Lamari, Lynda
Florenc, Mathieu
Sabaou, Nasserdine
Kemassi, Abd Allah
Source
Algerian Journal of Arid Environment
Issue
Vol. 6, Issue 2 (31 Dec. 2016), pp.16-23, 8 p.
Publisher
Publication Date
2016-12-31
Country of Publication
Algeria
No. of Pages
8
Main Subjects
Abstract EN
An actinobacterial strain, designated PM18, was isolated from a Saharan soil sample by agar plate dilution method on chitin-vitamin agar supplemented with polymyxin after pretreatment of the soil sample at 120°C (dry heat) for 1 h.
The taxonomic status of this strain was determined basis on morphological and physiological characteristics and phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence.
Strain PM18 developed an extensively branched and non-fragmented substrate mycelium.
The isolate was characterized by the presence of cylindrical monosporous sporangia, which were produced only on the aerial mycelium.
Sporangia were arranged closely in parallel double rows.
The monosporous sporangia were motile.
The morphological features of this isolate corresponded to those of members of the genus Planomonospora.
Furthermore, phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence revealed that strain PM18 is a member of the genus Planomonospora.
The 16S rRNA gene sequence similarity showed that this strain was most closely related to Planomonospora sphaerica JCM 9374T (99.2%) and Planomonospora parontospora subsp.
antibiotica JCM 3094T (98.8%).
Based on phenotypic differences and the separate position of strain PM18 in the phylogenetic tree, this strain may be a representative of a putative novel species in the genus Planomonospora.
Abstract FRE
Une souche d’actinobactérie, désignée PM18, est isolée d'un échantillon de sol saharien par la méthode de suspensions-dilutions sur milieu chitine-vitamines agar additionné de polymyxine, après un prétraitement de l'échantillon de sol à 120°C (chaleur sèche) pendant 1 h.
La position taxonomique de cette souche est déterminée sur la base des caractéristiques morphologiques et physiologiques, ainsi que sur l’analyse phylogénétique après séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S.
La souche PM18 produit un mycélium du substrat ramifié et non fragmenté et un mycélium aérien portant des sporanges cylindriques monosporés disposés en une double rangée parallèle.
Les sporangiospores sont mobiles.
Les caractéristiques morphologiques de cette souche correspondent à ceux des membres du genre Planomonospora.
L’appartenance à ce genre a été confirmée par l’analyse phylogénétique.
L’alignement de la séquence de la souche PM18 a montré un pourcentage de similarité de 99,2% avec Planomonospora sphaerica JCM 9374T et 98,8% avec Planomonospora parontospora.
sous espèce antibiotica JCM 3094T.
En se basant sur les différences phénotypiques et sur sa position distincte dans l'arbre phylogénétique, la souche PM18 pourrait une nouvelle espèce du genre Planomonospora.
American Psychological Association (APA)
Chaabane Chaouch, Fawziyah& Bu Znada, Khawlah& Bu Ras, Nur al-Din& Tata, Samirah& Meklat, Atika& Mokrane, Salim…[et al.]. 2016. Planomonospora sp. pm 18 : isolation and taxonomy of new actinobacterial strain isolated from Algerian Saharan soil. Algerian Journal of Arid Environment،Vol. 6, no. 2, pp.16-23.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-757984
Modern Language Association (MLA)
Chaabane Chaouch, Fawziyah…[et al.]. Planomonospora sp. pm 18 : isolation and taxonomy of new actinobacterial strain isolated from Algerian Saharan soil. Algerian Journal of Arid Environment Vol. 6, no. 2 (Dec. 2016), pp.16-23.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-757984
American Medical Association (AMA)
Chaabane Chaouch, Fawziyah& Bu Znada, Khawlah& Bu Ras, Nur al-Din& Tata, Samirah& Meklat, Atika& Mokrane, Salim…[et al.]. Planomonospora sp. pm 18 : isolation and taxonomy of new actinobacterial strain isolated from Algerian Saharan soil. Algerian Journal of Arid Environment. 2016. Vol. 6, no. 2, pp.16-23.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-757984
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 22-23
Record ID
BIM-757984