Characterization of escherichia coli isolates from patients with urinary tract infections from Thabet Hospital-Tulkarm, Palestine
Other Title(s)
توصيف الإشريكية القولونية المعزولة من المرضى الذين يعانون من التهابات المسالك البولية في مستشفى ثابت-طولكرم-فلسطين
Joint Authors
Source
An-Najah University Journal for Research-A : Natural Sciences
Issue
Vol. 30, Issue 1 (30 Jun. 2016), pp.31-52, 22 p.
Publisher
An-Najah National University Deanship of Scientific Research
Publication Date
2016-06-30
Country of Publication
Palestine (West Bank)
No. of Pages
22
Main Subjects
Abstract AR
هدفت هذه الدراسة إلى تحليل المجموعات التطورية، و إيجاد المجموعة الأولى و الثانية و الثالثة للانتجرونات (integrons) و البحث عن مقاومة الإشريكية القولونية للمضادات الحيوية، في خمسين عينة معزولة من البول، و التي تم الحصول عليها من الحالات المشتبه فيها بوجود التهابات للمسالك البولية في مستشفى ثابت، خلال شهر أيار إلى كانون الأول .2012 و تم إجراء فحص الحساسية للمضادات الحيوية لهذه السلالات عن طريق انتشار القرص.
المجموعات التطورية و المجموعة الأولى و الثانية و الثالثة للانتجرونات تم تحديدها باستخدام تقنية سلسلة تفاعل البلمرة المتعدد(Multiplex PCR) .
وقد تم إجراء التحليل الإحصائي باستخدام اختبار مان و يتني U- (Mann-Whitney U-Test)، مربع كاي (χ2) أو اختبار فيشر الدقيق .(Fisher exact test) و أظهرت النتائج أن 36 (%72) من هذه السلالات تنتمي إلى مجموعةD ، و (26%) من السلالات 13 تنتمي إلى المجموعة (A)، في حين تنتمي إحدى السلالات (2%) إلى المجموعة .(B1) وكانت إحدى و عشرون (42%) من سلالات الإشريكية القولونية تحمل المجموعة الأولى للانتجرونات، 44.4٪ من سلالات المجموعة (D) و30.8 ٪ من سلالات المجموعة (A)كانت تحمل المجموعة الأولى للانتجرونات.
و أظهرت النتائج أيضا أنه لا يوجد فرق إحصائي معنوي في متوسط سجل النقاط لمقاومة المضادات الحيوية للسلالات التي تنتمي إلى مجموعة(D) وتحمل المجموعة الأولى للانتجرونات و المجموعة (A)التي تحمل نفس مجموعة الانتجرونات.
و تراوحت المقاومة للمضادات الحيوية من 24 ٪ للجنتاميسين إلى 100 ٪ لسيفازولين و الاريثروميسين.
و تبين أن هناك فرقا كبيرا في متوسط سجل النقاط لمقاومة المضادات الحيوية للسلالات التي تنتمي إلى مجموعة (8.4) DوالمجموعةA (6.5) .(P = 6.2 × 10-4) أظهرت النتائج في مخطط الشجرة(Dendrogram) تكون مجموعتين كبيرتين تعتمدان على المقاومة/الحساسية لسلالات الإشريكية القولونية لفلوروكينولونات، و كان ارتباط مقاومة العزلات لمضاد ميثوبريم-السلفاميثوكسازول مع المجموعة(D) ذا فرق معنوي إحصائي مقارنة مع عزلات المجموعة (A) .(P < 0.05) و أظهر التحليل الجزيئي ل50 من سلالات الإشريكية القولونية انتشارا عاليا للمجموعة الأولى للانتجرونات، وارتفاعاً في نسبة انتشار المجموعة التطورية (D)، وارتفاعاً في متوسط سجل النقاط لمقاومة المضادات الحيوية للسلالات التي تنتمي إلى مجموعة .(D) و صفوة القول أن التهابات المسالك البولية التي تسببها مثل هذه السلالات تمثل مشكلة سريرية بسبب الخيارات العلاجية المحدودة.
Abstract EN
This study aimed to analyze phylogenetic groups, the presence of class I, II, III integrons and resistance phenotype in a collection of fifty E.
coli strains isolated from urine specimens obtained from suspected cases with urinary tract infections at Thabet Hospital, During May-December 2012.
The antibiotic susceptibility testing for these isolates was done by disk diffusion method.
The phylogenetic groups and class I, II and III integrons were determined by multiplex PCR.
Statistical analysis was done by using Mann-Whitney U-Test (Two-tailed), Chi-square (χ2) test or Fisher exact test.
The results showed that 36 (72%) of the studied strains, belonged to group D, 13 (26%) strains to group A, and 1 (2%) strain belonged to group B1.
Twenty one (42%) of E.
coli strains carried class I integrons.
Prevalence of class I integrons in group D and group A was 44.4% and 30.8%, respectively.
There was no significant difference in the mean of antibiotic resistance score for strains belonged to group D and carried class I integrons and those belonged to group A and harbored the same integron class.
Antibiotic resistance has ranged from 24% for Gentamicin to 100% for Cefazolin and Erythromycin.
There is a significant difference in the mean of antibiotic resistance scores for strains belonged to group D (8.4) and group A (6.5) (P = 6.2 x 10-4).
Results showed that 2 large clusters depend on resistance/sensitive of strains to fluoroquinolones.
Association of Trimethoprim/Sulphamethoxazole resistance with the D group showed statistically significant difference (P < 0.05) compared to group A.
In conclusion, molecular analysis of 50 E.
coli urine isolates exhibited a greater prevalence of class I integrons, a greater prevalence of phylogenetic group D, which possessed a higher resistance scores than group A.
Urinary tract infections caused by such strains represent a clinical problem because of limited therapeutic options
American Psychological Association (APA)
Adwan, Ghalib& Isa, Buthaynah. 2016. Characterization of escherichia coli isolates from patients with urinary tract infections from Thabet Hospital-Tulkarm, Palestine. An-Najah University Journal for Research-A : Natural Sciences،Vol. 30, no. 1, pp.31-52.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-819619
Modern Language Association (MLA)
Adwan, Ghalib& Isa, Buthaynah. Characterization of escherichia coli isolates from patients with urinary tract infections from Thabet Hospital-Tulkarm, Palestine. An-Najah University Journal for Research-A : Natural Sciences Vol. 30, no. 1 (2016), pp.31-52.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-819619
American Medical Association (AMA)
Adwan, Ghalib& Isa, Buthaynah. Characterization of escherichia coli isolates from patients with urinary tract infections from Thabet Hospital-Tulkarm, Palestine. An-Najah University Journal for Research-A : Natural Sciences. 2016. Vol. 30, no. 1, pp.31-52.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-819619
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 47-52
Record ID
BIM-819619
