Molecular diagnosis of lumpy skin disease by polymerase chain reaction and dna sequencing
Joint Authors
Ghanim, F. M.
Mahmud M. M.
Yunus E.
al-Hajj M. M.
Source
Suez Canal Veterinary Medicine Journal
Issue
Vol. 14, Issue 1 (30 Jun. 2009), pp.233-244, 12 p.
Publisher
Suez Canal University Faculty of Veterinary Medicine
Publication Date
2009-06-30
Country of Publication
Egypt
No. of Pages
12
Main Subjects
Topics
Abstract AR
في صيف 2005 ظهر في مصر وباء خطير لمرض الجلد العقدي.
تم فحص 23 عينة دم و أنسجة الجلد المصابة المجمعة من الأبقار المصابة في دمياط و ذلك بالكشف عن الفيروس باستخدام الزرع النسيجي و تفاعل البلمرة المتسلسل.
تفاعل البلمرة المتسلسل أظهر حساسية عالية في الكشف عن الفيروس بنسبة (65.2 %) مقارنة بالزرع النسيجي ( 34.8%).
و قد تم اختبار الفيروسات المسببة للمرض من وباء 1989 بالإسماعيلية و 2005 بدمياط و كذلك التحصين المستخدم في مصر (جدري الأغنام) باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل الذي أظهر أنه لا يوجد اختلاف بينهم على الجيل و عليه للوصول إلى اختلاف بينهم تم عمل تسلسل الحمض النووي لهم و مقارنة التسلسل النووي لما هو منشور في البنك الجيني و أظهرت النتائج أنه يوجد اختلافات بين كل من فيروس 1989 و 2005 و أيضا له القدرة على التفريق بين فيروس الجلد العقدي و جدري الأغنام.
فيروس المعزول من دمياط مختلف عن الإسماعيلية يدل على اختلاف منشأ الفيروس بينما يوجد 100 % تماثل بين عترة دمياط و الخوالي الموجودة في البنك النووي و ذلك لأنهم من نفس المنشأ و الوباء.
Abstract EN
During summer 2005 there was severe outbreak of lumpy skin disease (LSD) in Demiatta, Egypt.
Twenty three samples (18) buffy coats and (5) skin biopsies were collected from infected cows and submitted to laboratory examination for Neethling virusl agent using tissue culture and polymerase chain reaction (PCR).
PCR was superior in detection of Neethling virus (65.2 %) while, tissue culture was lower (34.8 %).
PCR products was used to compare of LSD virus of Ismaillia strain (1989 outbreak), Demiatta strain (2005 outbreak) and sheep pox vaccine, Kenyan strain (SPV) using sequence analysis to determine molecular differences.
Nucleotide sequencing and phylogenetic analysis of 192 bp fragment indicated a close relationship of Capri poxviruses, and there were molecular difference based upon nucleotide sequences with ability to differentiate between sheep pox and LSD.
Ismaillia and Demiatta isolates appeared to be in a separate clad, suggesting that both isolates derived from different origin.
In contrast isolate of Egypt 2005 outbreak is 100 % identical to ELkholy strain (published in gene bank of accession number EU807974, Egypt 2006).
American Psychological Association (APA)
Mahmud M. M.& Yunus E.& Ghanim, F. M.& al-Hajj M. M.. 2009. Molecular diagnosis of lumpy skin disease by polymerase chain reaction and dna sequencing. Suez Canal Veterinary Medicine Journal،Vol. 14, no. 1, pp.233-244.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-89440
Modern Language Association (MLA)
Mahmud M. M.…[et al.]. Molecular diagnosis of lumpy skin disease by polymerase chain reaction and dna sequencing. Suez Canal Veterinary Medicine Journal Vol. 14, no. 1 (Jun. 2009), pp.233-244.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-89440
American Medical Association (AMA)
Mahmud M. M.& Yunus E.& Ghanim, F. M.& al-Hajj M. M.. Molecular diagnosis of lumpy skin disease by polymerase chain reaction and dna sequencing. Suez Canal Veterinary Medicine Journal. 2009. Vol. 14, no. 1, pp.233-244.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-89440
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 242-244
Record ID
BIM-89440