NPHS2 gene mutation screening in Palestinian children with steroid-resistant nephrotic syndrome
Other Title(s)
الكشف عن طفرات في جين NPHS2 لدى الأطفال الفلسطينيين المصابين بمتلازمة الكلائية المقاومة لعلاج الستيرويد
Dissertant
Dayf Allah, Ata Jabir Muhammad
Thesis advisor
University
Islamic University
Faculty
Faculty of Science
Department
Department of Biological Science
University Country
Palestine (Gaza Strip)
Degree
Master
Degree Date
2017
Arabic Abstract
المقدمة: تعتبر المتلازمة الكلائية NS) ) اضطرابا غير شائع يصيب الأطفال، ومن أعراضه الاستسقاء، البول البروتيني، نقص ألبومين الدم، ارتفاع الدهون في الدم، ويمكن أن يؤدي الى فشل الكلوي.
ويمكن تقسيمه إلى قسمين بالنظر إلى مدى استجابته للعلاج بالستيرويدات المتلازمة الكلائية المستجيبة للستيرويد (SSNS) والمتلازمة الكلائية المقاومة للستيرويد SRNS))، حيث لا يستجيب المريض في النوع الثاني للعلاج بالبريدنيزون.
وتورّث المتلازمة الكلائية المقاومة للستيرويد ( (SRNSكاضطرابات صبغية جسدية متنحية (صفة متنحية)، حيث تتشكل الطفرات الجينية غالبا في جين ((NPHS2، حيث يتم تشفير بروتين (podocin) والذي له دور مهم في ترشيح التليف الكبيبي والتحكم بنفاذية الغشاء الفلعي.
هدف الدراسة: تهدف الدراسة إلى استكشاف مدى انتشار طفرات (NPHS2) بين السكان الفلسطينيين، وذلك من خلال فحص 20 مصابا بالمتلازمة الكلائية المقاومة للستيرويد (SRNS)، ومقارنة النتائج التي تم التوصل إليها مع الطفرات الموثقة دوليا في مجموعات أخرى من السكان.
منهجية الدراسة: تم اختيار عشرين مريضا بالمتلازمة الكلائية من مستشفى الرنتيسي للأطفال، حيث تم فحص الاكسونات الثمانية الخاصة بجين NPHS2))، حيث تم مضاعفتها باستخدام تقنية البلمرة المتسلسلة ( (PCR) لفحص الحمض النووي للمرضى باستخدام البادئات المناسبة.
وتم بعد ذلك تحليل التتابعات المباشر للأجزاء المنقاة بواسطة تقنية (PCR) باستخدام طريقة (Sanger)، وذلك لملاحظة مدى وجود أية تغيرات نوكليوتيدية من خلال مقارنة التتابعات التي تمت ملاحظتها مع تلك الموجودة في الجين المرجعي، والمخزنة في قاعدة بيانات (NCBI).
النتائج: أكدت نتائج تحليل التتابعات التي تم الحصول عليها وجود طفرات جينية معروفة مسبقا في 3 مرضى (15% من العينة) من المرضى، حيث كانت اثنتان منها (وهما G130K و(R229Q من ضمن الطفرات المغلطة، بينما كانت الثالثة R138X) ) طفرة هرائية.
وكانت جميع الطفرات موجودة في شكل متماثل.
الاستنتاجات: توصلت الدراسة إلى تحديد وجود طفرات (G130K وR229Q و(R138X في جين (NPHS2) لدى مرضى المتلازمة الكلائية المقاومة للستيرويد (SRNS) في غزة - فلسطين.
ومن شأن الطفرات التي تم تحديدها أن توفر على المرضى عناء اللجوء إلى استرويدات المثبطة للمناعة كونها غير ضرورية مما يساعد الأطباء وعائلات المرضى على اتخاذ القرارات المناسبة فيما يتعلق بإدارة حياة المرضى وأبنائهم في المستقبل.
English Abstract
Background: Nephrotic syndrome (NS), an uncommon childhood disorder, is characterized by edema, massive proteinuria, hypoalbuminemia, hyperlipidemia, and may progress to end stage renal disease.
Based on the response to steroid therapy, NS is divided into steroid-sensitive (SSNS) and steroid-resistant (SRNS).
SRNS is where the patient does not respond to prednisone treatment.
SRNS inherited, as an autosomal recessive disorder with NPHS2 being the most frequently mutated gene.
NPHS2 gene encodes podocin protein, which has an important role in glomerular ultrafiltration and controlling slit membrane permeability.
Objective: The spectrum and frequency of NPHS2 mutations in the Palestinian population have not been explored before.
The aim of this study is to screen 20 SRNS Palestinian patients for NPHS2 mutations and to compare our findings with those reported in other populations.
Methods: Twenty SRNS patients were recruited from the Ranteesy pediatric hospital.
All the eight exons of the NPHS2 gene were PCR-amplified from patients genomic DNA using appropriate primers.
Direct sequencing of the purified PCR fragments was then ensued by automated Sanger sequencing method.
Nucleotide changes were verified by comparing obtained sequences with the reference gene sequence stored in the NCBI database.
Results: Analysis of the obtained sequences identified previously known mutations in 3 (15%) of the patients.
Two of the mutations, G130K and R229Q were missense mutations and the third, R138X was a nonsense mutation.
All mutations were present in homozygous form.
Conclusions: The current study reports the identification of G130K, R138X, and R229Q NPHS2 mutation in SRNS patients in Gaza-Palestinian.
The mutations thus identified would spare patients from the unnecessary and harmful immunosuppressive steroids and help physicians and patients' families take proper decisions regarding patient management and their future offspring.
Main Subjects
No. of Pages
48
Table of Contents
Table of contents.
Abstract.
Abstract in Arabic.
Chapter One : Introduction.
Chapter Two : Literature review.
Chapter Three : Materials and methods.
Chapter Four : Results.
Chapter Five : Discussion.
Chapter Six : Conclusion and rrecommendations.
References.
American Psychological Association (APA)
Dayf Allah, Ata Jabir Muhammad. (2017). NPHS2 gene mutation screening in Palestinian children with steroid-resistant nephrotic syndrome. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Islamic University, Palestine (Gaza Strip)
https://search.emarefa.net/detail/BIM-900705
Modern Language Association (MLA)
Dayf Allah, Ata Jabir Muhammad. NPHS2 gene mutation screening in Palestinian children with steroid-resistant nephrotic syndrome. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Islamic University. (2017).
https://search.emarefa.net/detail/BIM-900705
American Medical Association (AMA)
Dayf Allah, Ata Jabir Muhammad. (2017). NPHS2 gene mutation screening in Palestinian children with steroid-resistant nephrotic syndrome. (Master's theses Theses and Dissertations Master). Islamic University, Palestine (Gaza Strip)
https://search.emarefa.net/detail/BIM-900705
Language
English
Data Type
Arab Theses
Record ID
BIM-900705
