Dna fingerints of tilapia species in Shatt al-Areb river using rapd markers

Other Title(s)

بصمة DNA لأنواع أسماك البلطي في نهر شط العرب باستخدام المؤشرات الجينية العشوائية

Joint Authors

al-Khafaji, Taha Yasin
Masad, Marwah Kazim
Faddagh, Mustafa Sami

Source

The Iraqi Journal of Agricultural Science

Issue

Vol. 51, Issue 4 (31 Aug. 2020), pp.1082-1087, 6 p.

Publisher

University of Baghdad College of Agriculture

Publication Date

2020-08-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

6

Main Subjects

Biology
Zoology

Topics

Abstract AR

في العقد الأخير، انتشرت أنواع من أسماك البلطي في المياه الداخلية في العراق.

و قد سجل منها ثلاث أنواع هي : البلطي النيلي Oreochromis niloticus (Linnaeus، 1758) و البلطي الأزرق Oreochromis aureus (Steindachner، 1864) و البلطي الأحمر Coptedon zillii (Gervais، 1848) وهي تقطن نهر شط العرب.

و هي تنتمي إلى عائلة Cichlidae.

وأن هذه الأنواع الثلاثة متشابهة مظهريا بحيث يصعب التفريق فيما بينها باستخدام الصفات المظهرية.

استخدمت المؤشرات الجينية للتفريق بين الأنواع.

أتبعت تقنية التضخيم العشوائي للحامض النووي DNA.

فحصت التغيرات الجينية فيما بين الأنواع الثلاثة و تحديد بصمة DNA للأنواع الثلاثة.

جمعت 62 عينة من أسماك البلطي من نهر شط العرب في محافظة البصرة.

استخدمت سبع بادئات عشوائية عشرية النيوكليوتيدات (OPA08، OPA10، OPA13، OPA17، OPA19، OPB08 and OPC02).

أجريت تجربة التضخيم العشوائي و هجرت نواتج تفاعل PCRكهربائيا بالترافق مع مسطرة جزيئية مقسمة لكل 100 زوج قاعدي.

حسبت حزم DNA و قدر الوزن الجزيئي باستخدام برنامج Photocapt-MW.

رسم هستوكرام مماثل للصور باستخدام نظام الإكسل.

أظهرت صور الترحيل الكهربائي DNA العشوائية اختلافا بين الأنواع الثلاث.

حسبت 67 حزمة في المعاملات الثلاث وأن حجم الحزم تراوح من 64-2344 زوج قاعدي.

و قد أظهر البحث أن طريقة المؤشرات الجينية كفوءة للتميز بين الأنواع الثلاثة من أسماك البلطي.

و يمكن أن تستخدم النتائج في برامج حفظ الأنواع في المستقبل.

Abstract EN

In the last decade, tilapia fish species distributed in the Iraqi inland waters.

Three species; Nile tilapia Oreochromis niloticus (Linnaeus, 1758), Blue tilapia Oreochromis aureus (Steindachner, 1864) and Redbelly tilapia Coptedon zillii (Gervais, 1848) inhibiting Shatt Al-Arab River.

They belong to family Cichlidae.

They are very similar to differentiate among them using biometry.

So, genetic markers used for species discrimination.

Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) protocol used to examine genetic variation and to generate DNA fingerprints of tilapia fish species in Shatt Al-Arab River.

Sixty-two specimens of tilapia fish collected from Shatt Al-Arab River at the governorate of Basrah.

Seven universal decamer primers selected (OPA08, OPA10, OPA13, OPA17, OPA19, OPB08 and OPC02) to create RAPD DNA fingerprint.

RAPD-PCR amplification carried out and electrophoresed with 100 bp ladder.

DNA bands scored and molecular weight was calculated using PhotocaptMW software.

Analog histogram drew using MS-Excel.

The three RAPD DNA profiles apparently were different.

DNA bands scored in the three species were 67 bands.

The size of DNA bands was ranged from 64 bp to 2344 bp.

RAPD fingerprints were efficient to distinguish the three species of tilapia fish.

DNA markers of the three species of tilapia fish can use to achieve conservation programs of fish species in the future.

American Psychological Association (APA)

Faddagh, Mustafa Sami& al-Khafaji, Taha Yasin& Masad, Marwah Kazim. 2020. Dna fingerints of tilapia species in Shatt al-Areb river using rapd markers. The Iraqi Journal of Agricultural Science،Vol. 51, no. 4, pp.1082-1087.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-977440

Modern Language Association (MLA)

Faddagh, Mustafa Sami…[et al.]. Dna fingerints of tilapia species in Shatt al-Areb river using rapd markers. The Iraqi Journal of Agricultural Science Vol. 51, no. 4 (2020), pp.1082-1087.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-977440

American Medical Association (AMA)

Faddagh, Mustafa Sami& al-Khafaji, Taha Yasin& Masad, Marwah Kazim. Dna fingerints of tilapia species in Shatt al-Areb river using rapd markers. The Iraqi Journal of Agricultural Science. 2020. Vol. 51, no. 4, pp.1082-1087.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-977440

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Text in English ; abstracts in English and Arabic.

Record ID

BIM-977440