SeedSeq: Off-Target Transcriptome Database
المؤلفون المشاركون
Kozak, Karol
Das, Shaoli
Ghosal, Suman
Chakrabarti, Jayprokas
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-08-29
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Detection of potential cross-reaction between a short oligonucleotide sequence and a longer (unintended) sequence is crucial for many biological applications, such as high content screening (HCS), microarray nucleotide probes, or short interfering RNAs (siRNAs).
However, owing to a tolerance for mismatches and gaps in base-pairing with target transcripts, siRNAs could have up to hundreds of potential target sequences in a genome, and some small RNAs in mammalian systems have been shown to affect the levels of many messenger RNAs (off-targets) besides their intended target transcripts (on-targets).
The reference sequence (RefSeq) collection aims to provide a comprehensive, integrated, nonredundant, well-annotated set of sequences, including mRNA transcripts.
We performed a detailed off-target analysis of three most commonly used kinome siRNA libraries based on the latest RefSeq version.
To simplify the access to off-target transcripts, we created a SeedSeq database, a new unique format to store off-target information.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Das, Shaoli& Ghosal, Suman& Chakrabarti, Jayprokas& Kozak, Karol. 2013. SeedSeq: Off-Target Transcriptome Database. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005375
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Das, Shaoli…[et al.]. SeedSeq: Off-Target Transcriptome Database. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005375
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Das, Shaoli& Ghosal, Suman& Chakrabarti, Jayprokas& Kozak, Karol. SeedSeq: Off-Target Transcriptome Database. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005375
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1005375
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر