A Novel Framework Based on ACO and PSO for RNA Secondary Structure Prediction
المؤلفون المشاركون
Wang, Gang
Zhang, Wen-yi
Ning, Qiao
Chen, Hui-ling
المصدر
Mathematical Problems in Engineering
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-09-11
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Prediction of RNA structure is a useful process for creating new drugs and understanding genetic diseases.
In this paper, we proposed a particle swarm optimization (PSO) and ant colony optimization (ACO) based framework (PAF) for RNA secondary structure prediction.
PAF consists of crucial stem searching (CSS) and global sequence building (GSB).
In CSS, a modified ACO (MACO) is used to search the crucial stems, and then a set of stems are generated.
In GSB, we used a modified PSO (MPSO) to construct all the stems in one sequence.
We evaluated the performance of PAF on ten sequences, which have length from 122 to 1494.
We also compared the performance of PAF with the results obtained from six existing well-known methods, SARNA-Predict, RnaPredict, ACRNA, PSOfold, IPSO, and mfold.
The comparison results show that PAF could not only predict structures with higher accuracy rate but also find crucial stems.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Gang& Zhang, Wen-yi& Ning, Qiao& Chen, Hui-ling. 2013. A Novel Framework Based on ACO and PSO for RNA Secondary Structure Prediction. Mathematical Problems in Engineering،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1010771
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Gang…[et al.]. A Novel Framework Based on ACO and PSO for RNA Secondary Structure Prediction. Mathematical Problems in Engineering No. 2013 (2013), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1010771
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Gang& Zhang, Wen-yi& Ning, Qiao& Chen, Hui-ling. A Novel Framework Based on ACO and PSO for RNA Secondary Structure Prediction. Mathematical Problems in Engineering. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1010771
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1010771
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر