Facile, High Quality Sequencing of Bacterial Genomes from Small Amounts of DNA
المؤلفون المشاركون
Vuyisich, Momchilo
Arefin, Ayesha
Davenport, Karen
Feng, Shihai
Gleasner, Cheryl
McMurry, Kim
Parson-Quintana, Beverly
Price, Jennifer
Scholz, Matthew
Chain, Patrick
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-11-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Sequencing bacterial genomes has traditionally required large amounts of genomic DNA (~1 μ g).
There have been few studies to determine the effects of the input DNA amount or library preparation method on the quality of sequencing data.
Several new commercially available library preparation methods enable shotgun sequencing from as little as 1 ng of input DNA.
In this study, we evaluated the NEBNext Ultra library preparation reagents for sequencing bacterial genomes.
We have evaluated the utility of NEBNext Ultra for resequencing and de novo assembly of four bacterial genomes and compared its performance with the TruSeq library preparation kit.
The NEBNext Ultra reagents enable high quality resequencing and de novo assembly of a variety of bacterial genomes when using 100 ng of input genomic DNA.
For the two most challenging genomes (Burkholderia spp.), which have the highest GC content and are the longest, we also show that the quality of both resequencing and de novo assembly is not decreased when only 10 ng of input genomic DNA is used.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Vuyisich, Momchilo& Arefin, Ayesha& Davenport, Karen& Feng, Shihai& Gleasner, Cheryl& McMurry, Kim…[et al.]. 2014. Facile, High Quality Sequencing of Bacterial Genomes from Small Amounts of DNA. International Journal of Genomics،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1036691
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Vuyisich, Momchilo…[et al.]. Facile, High Quality Sequencing of Bacterial Genomes from Small Amounts of DNA. International Journal of Genomics No. 2014 (2014), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1036691
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Vuyisich, Momchilo& Arefin, Ayesha& Davenport, Karen& Feng, Shihai& Gleasner, Cheryl& McMurry, Kim…[et al.]. Facile, High Quality Sequencing of Bacterial Genomes from Small Amounts of DNA. International Journal of Genomics. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1036691
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1036691
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر