Protein Binding Site Prediction by Combining Hidden Markov Support Vector Machine and Profile-Based Propensities
المؤلفون المشاركون
Wang, Xiaolong
Liu, Bin
Liu, Bingquan
Liu, Fule
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-07-13
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Identification of protein binding sites is critical for studying the function of the proteins.
In this paper, we proposed a method for protein binding site prediction, which combined the order profile propensities and hidden Markov support vector machine (HM-SVM).
This method employed the sequential labeling technique to the field of protein binding site prediction.
The input features of HM-SVM include the profile-based propensities, the Position-Specific Score Matrix (PSSM), and Accessible Surface Area (ASA).
When tested on different data sets, the proposed method showed promising results, and outperformed some closely relative methods by more than 10% in terms of AUC.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Liu, Bin& Liu, Bingquan& Liu, Fule& Wang, Xiaolong. 2014. Protein Binding Site Prediction by Combining Hidden Markov Support Vector Machine and Profile-Based Propensities. The Scientific World Journal،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1049716
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Liu, Bin…[et al.]. Protein Binding Site Prediction by Combining Hidden Markov Support Vector Machine and Profile-Based Propensities. The Scientific World Journal No. 2014 (2014), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1049716
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Liu, Bin& Liu, Bingquan& Liu, Fule& Wang, Xiaolong. Protein Binding Site Prediction by Combining Hidden Markov Support Vector Machine and Profile-Based Propensities. The Scientific World Journal. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1049716
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1049716
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر