![](/images/graphics-bg.png)
Constructing a Genome-Wide LD Map of Wild A. gambiae Using Next-Generation Sequencing
المؤلفون المشاركون
Wang, Xiaohong
Afrane, Yaw A.
Yan, Guiyun
Li, Jun
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-09-03
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Anopheles gambiae is the major malaria vector in Africa.
Examining the molecular basis of A.
gambiae traits requires knowledge of both genetic variation and genome-wide linkage disequilibrium (LD) map of wild A.
gambiae populations from malaria-endemic areas.
We sequenced the genomes of nine wild A.
gambiae mosquitoes individually using next-generation sequencing technologies and detected 2,219,815 common single nucleotide polymorphisms (SNPs), 88% of which are novel.
SNPs are not evenly distributed across A.
gambiae chromosomes.
The low SNP-frequency regions overlay heterochromatin and chromosome inversion domains, consistent with the lower recombinant rates at these regions.
Nearly one million SNPs that were genotyped correctly in all individual mosquitoes with 99.6% confidence were extracted from these high-throughput sequencing data.
Based on these SNP genotypes, we constructed a genome-wide LD map for wild A.
gambiae from malaria-endemic areas in Kenya and made it available through a public Website.
The average size of LD blocks is less than 40 bp, and several large LD blocks were also discovered clustered around the para gene, which is consistent with the effect of insecticide selective sweeps.
The SNPs and the LD map will be valuable resources for scientific communities to dissect the A.
gambiae genome.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Xiaohong& Afrane, Yaw A.& Yan, Guiyun& Li, Jun. 2015. Constructing a Genome-Wide LD Map of Wild A. gambiae Using Next-Generation Sequencing. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1054703
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Xiaohong…[et al.]. Constructing a Genome-Wide LD Map of Wild A. gambiae Using Next-Generation Sequencing. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1054703
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Xiaohong& Afrane, Yaw A.& Yan, Guiyun& Li, Jun. Constructing a Genome-Wide LD Map of Wild A. gambiae Using Next-Generation Sequencing. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1054703
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1054703
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)