![](/images/graphics-bg.png)
ProGeRF: Proteome and Genome Repeat Finder Utilizing a Fast Parallel Hash Function
المؤلفون المشاركون
Lopes, Robson da Silva
Moraes, Walas Jhony Lopes
Rodrigues, Thiago de Souza
Bartholomeu, Daniella Castanheira
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-02-25
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Repetitive element sequences are adjacent, repeating patterns, also called motifs, and can be of different lengths; repetitions can involve their exact or approximate copies.
They have been widely used as molecular markers in populationbiology.
Given the sizes of sequenced genomes, various bioinformatics tools have been developed for the extraction of repetitive elements from DNA sequences.
However, currently available tools do not provide options for identifying repetitive elements in the genome or proteome, displaying a user-friendly web interface, and performing-exhaustive searches.
ProGeRF is a web site for extracting repetitive regions from genome and proteome sequences.
It was designed to be efficient, fast, and accurate andprimarily user-friendly web tool allowing many ways to view and analyse the results.
ProGeRF (Proteome and Genome Repeat Finder) is freely available as a stand-alone program, from which the users can download the source code, and as a web tool.
It was developed using the hash table approach to extract perfect and imperfect repetitive regions in a (multi)FASTA file, while allowing a linear time complexity.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Lopes, Robson da Silva& Moraes, Walas Jhony Lopes& Rodrigues, Thiago de Souza& Bartholomeu, Daniella Castanheira. 2015. ProGeRF: Proteome and Genome Repeat Finder Utilizing a Fast Parallel Hash Function. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055308
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Lopes, Robson da Silva…[et al.]. ProGeRF: Proteome and Genome Repeat Finder Utilizing a Fast Parallel Hash Function. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055308
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Lopes, Robson da Silva& Moraes, Walas Jhony Lopes& Rodrigues, Thiago de Souza& Bartholomeu, Daniella Castanheira. ProGeRF: Proteome and Genome Repeat Finder Utilizing a Fast Parallel Hash Function. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055308
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1055308
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)