Module Based Differential Coexpression Analysis Method for Type 2 Diabetes
المؤلفون المشاركون
Zheng, Chun-Hou
Huang, De-Shuang
Yuan, Lin
Xia, Junfeng
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-08-03
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
More and more studies have shown that many complex diseases are contributed jointly by alterations of numerous genes.
Genes often coordinate together as a functional biological pathway or network and are highly correlated.
Differential coexpression analysis, as a more comprehensive technique to the differential expression analysis, was raised to research gene regulatory networks and biological pathways of phenotypic changes through measuring gene correlation changes between disease and normal conditions.
In this paper, we propose a gene differential coexpression analysis algorithm in the level of gene sets and apply the algorithm to a publicly available type 2 diabetes (T2D) expression dataset.
Firstly, we calculate coexpression biweight midcorrelation coefficients between all gene pairs.
Then, we select informative correlation pairs using the “differential coexpression threshold” strategy.
Finally, we identify the differential coexpression gene modules using maximum clique concept and k-clique algorithm.
We apply the proposed differential coexpression analysis method on simulated data and T2D data.
Two differential coexpression gene modules about T2D were detected, which should be useful for exploring the biological function of the related genes.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Yuan, Lin& Zheng, Chun-Hou& Xia, Junfeng& Huang, De-Shuang. 2015. Module Based Differential Coexpression Analysis Method for Type 2 Diabetes. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056936
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Yuan, Lin…[et al.]. Module Based Differential Coexpression Analysis Method for Type 2 Diabetes. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056936
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Yuan, Lin& Zheng, Chun-Hou& Xia, Junfeng& Huang, De-Shuang. Module Based Differential Coexpression Analysis Method for Type 2 Diabetes. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056936
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1056936
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر