Development of Microsatellite Markers Derived from Expressed Sequence Tags of Polyporales for Genetic Diversity Analysis of Endangered Polyporus umbellatus
المؤلفون المشاركون
Guo, Hongbo
Zhang, Yuejin
Chen, Yuanyuan
Wang, Ruihong
Zeng, Ailin
Deyholos, Michael K.
Shu, Jia
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-06-03
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
A large scale of EST sequences of Polyporales was screened in this investigation in order to identify EST-SSR markers for various applications.
The distribution of EST sequences and SSRs in five families of Polyporales was analyzed, respectively.
Mononucleotide was the most abundant type, followed by trinucleotide.
Among five families, Ganodermataceae occupied the most SSR markers, followed by Coriolaceae.
Functional prediction of SSR marker-containing EST sequences in Ganoderma lucidum obtained three main groups, namely, cellular component, biological process, and molecular function.
Thirty EST-SSR primers were designed to evaluate the genetic diversity of 13 natural Polyporus umbellatus accessions.
Twenty one EST-SSRs were polymorphic with average PIC value of 0.33 and transferability rate of 71%.
These 13 P.
umbellatus accessions showed relatively high genetic diversity.
The expected heterozygosity, Nei’s gene diversity, and Shannon information index were 0.41, 0.39, and 0.57, respectively.
Both UPGMA dendrogram and principal coordinate analysis (PCA) showed the same cluster result that divided the 13 accessions into three or four groups.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Zhang, Yuejin& Chen, Yuanyuan& Wang, Ruihong& Zeng, Ailin& Deyholos, Michael K.& Shu, Jia…[et al.]. 2015. Development of Microsatellite Markers Derived from Expressed Sequence Tags of Polyporales for Genetic Diversity Analysis of Endangered Polyporus umbellatus. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057321
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Zhang, Yuejin…[et al.]. Development of Microsatellite Markers Derived from Expressed Sequence Tags of Polyporales for Genetic Diversity Analysis of Endangered Polyporus umbellatus. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057321
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Zhang, Yuejin& Chen, Yuanyuan& Wang, Ruihong& Zeng, Ailin& Deyholos, Michael K.& Shu, Jia…[et al.]. Development of Microsatellite Markers Derived from Expressed Sequence Tags of Polyporales for Genetic Diversity Analysis of Endangered Polyporus umbellatus. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057321
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1057321
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر